Basic Information

Gene Symbol
Kdm5
Assembly
GCA_939192785.1
Location
CALNDV010000696.1:65819-74084[-]

Transcription Factor Domain

TF Family
ARID
Domain
ARID domain
PFAM
PF01388
TF Group
Helix-turn-helix
Description
This domain is know as ARID for AT-Rich Interaction Domain [2], and also known as the BRIGHT domain [1].
Hmmscan Out
# of c-Evalue i-Evalue score bias hmm coord from hmm coord to ali coord from ali coord to env coord from env coord to acc
1 1 1.1e-24 1.8e-21 76.3 0.0 2 89 204 287 203 287 0.95

Sequence Information

Coding Sequence
ATGAGTAATACAACAGTAAATAGTTGTAATCAAAGTTCAGGACCAGGACCAGGACCTGGTCCTGGAGGTggtattactacaattagtaatgttaataataataataacaacggcattatcaacaataccagcaacaatagtaatagcactagtttaaatagtagtggaggctataattccaatgtaaataatataaataatacaacaaattcaattttatcatcatctacaacaactataacaacaactgctggaaatacatcaacaacagcatcatcaacagcaagaagtcataatcattatcataattataataatcataatcatcatcatccatATTTACATACCCAAACAACATTTTCTATGAATAAAAATGAAGAATTTCAATTTATTAAACCACCTGAATGTCCTGTATTTAAACCAAATGAGGAAGAATTCAAAAATCCTTTAGCGTATATAAGTAAAATACGACCAGTGGCTGAAAAATTTGGAATTTGTAAAATTCAACCACCAAAGACATGGACACCACCATTTACAGTAGATGTAGATGAATTCCGTTTCACACCACGTGTTCAACGTTTAAATGAATTAGAAGCAAAAACGCGTGTTAAATTAAATTTCTTAGATCAAATTGCAAAATTTTGGGAATTACAAGGATCATCATTAAAAATTCCAATGGTTGAAAGAAAAGCATTAGATTTATATACATTGCATCGTATTGTACAAGAAGAAGGTGGAATGGATGTTATAACAAAGGAACGTAAATGGTCAAAAATAGCACAACGTATGCGTTATCCACCTGGTAAAAGTGTTGGTGCAATATTAAAGGGGCATTATGAAAGGATATTACATCCATTTGATATTTTTACATCTGGAAAAGTTGTTGATTTAAAATTAGAAACTGAAATTGATGATCAAGATTATAAACCTCATGGTATTGTATCACGTCAACAAATTCAACCACCAAATGCAACAACAGCAAAAAGATCTAAACGTTTTGCTGCTAGCGCAACAGCAAAAGAAACAGCTTGTGGCCTTTCAAATTATAATAACACACCAAGTAGTACAACTACATCATCAGGTATTAAAAATGAATTAAAAAAAGAACAACCAGCTGATGATGAAGAACTAAAACATATTGATCCAAAGGAATATCGCCGTTTACAAATTAATGGAGCTTACAGAATGTCCGGTTGTAAAACAAAAGGTATTCGTACTCGAATGATGGCTAGTGGAGGTGCTGGCAGTTCAAATAGCAATGGTGGTGGCAATGCTATTGGAAATAGTGCAAGTGGAACGACTACCTCTAACAAAAAGAAATCAAAAGATTCAGATCCTTTAGCTAAATACATTTGTCATATATGTAATCGTGGTGATGCTGAAGAAGCAATGCTATTATGTGATGGCTGTGACGACAGCTACCACACTTTCTGTTTGATACCCCCATTAAATGATATACCAAAAGGTGACTGGAGATGTCCAAAATGCGTCGTTGAGGAAGTTAGTAAACCACAGGAGGCATTCGGTTTTGAACAAGCACAACGTGAATATACTTTACAACAATTTGGAGAGATGGCTGATCAGTTTAAAGCCGATTATTTTAATATGTCCGTGCATTTGGTACCAACTGACTTAGTTGAACGTGAATTCTGGAGAATAGTTTCATCAATTGATGAAGATGTTACCGTTGAATATGGAGCTGATTTACATACTATGGACCATGGATCTGGTTTTCCAACACGAAGTTCACTTTACTTGCAACCACGCGATCAAGAATATGCCGAATCCAGTTGGAATTTAAATAATTTACCATTACTTGAGGAATCGATTCTGGGACATATTAATGCAGATATAAGTGGCATGAAAATACCATGGATGTATGTTGGAATGTGTTTTGCAACATTCTGTTGGCATAATGAAGATCATTGGAGTTATTCTATTAATTATTTACATTGGGGTGAACCAAAAACATGGTATGGTGTACCTGGTACCAAAGCTGAAAATTTCGAAGAGACAATGAAAAGTGCAGCCCCAGAACTATTTCAATCACAACCAGATTTATTACATCAATTGGTAACAATCATGAATCCAAATATTCTAATGAATTGTGGTGTTCCTGTATACAGAACAGATCAACGTGCCGGTGAATTTGTAATTACATTTCCAAGAGCATATCATGCTGGATTCAATCAAGGGTATAACTTCGCTGAGGCTGTAAACTTTGCTCCTGCCGATTGGATGAAAATGGGCAGAGAATGTATTAATCATTATTCTTTATTAAGAAGATTTTGTGTATTTTCACATGATGAACTTGTTTGCAAAATGGCCCTTAATCCAGATAAGTTGAATTTAGGTATTGCAACTGCTTGCTATTTAGACATGGCTGAAATGGTCGATTCTGAGAAAAAATTAAGAAAATCACTTCTTGAATGGGGTGTTACAAAAGCCGAAAGAGAAGCATTTGAATTAATACCAGATGATGAAAGACAATGTGAATCATGTAAGACTACATGCTTTTTATCAGCGGTTACATGTCCATGTACAAAATCAATTGTCTGTTTACGACATTACACAGAATTATGTGATTGTCCACCAGATAAGCATACATTACGATATCGATATACACTCGATGAATTACCTCTAATGTTGAAAAAATTAAAAGTTAAAGCAGAAAGTTTTGAAAATTGGTTATCAAAAGTACGTGATGTACTTGATCCTAATACACCAACAACAATAACATTAGAAGAATTACAAGAATTAGCACAAGAAGCTGAAACAAAAAAATTTCCAAGTTCTGTTTTACTTGAACGTTTAAATTCAGCTGTTTTAGAAGCAGAAAAATGTGTTACAGTTATACAACAATTAGATATAAATAAAATGCGTACAAGAACACGTAATTCATCTGAATCAGCTAAATATAAATTAACATTAGATGAATTAGAAATGTTTGTACAAGAAATTGATAATTTATGTTGTGTTATATCAGAAGGACAAAGTGTTAGAGAATTACAACAATATGGTAAAGATTTTGTAACAGCAGCTAATAAATTATTATCACAACCAATTGCTAATGTTAGAGAAGATCATATTTCAAAATTAATTGAAGAAGGTGCATATTTATGTATTGAATTACCTGAAATAAAAGCATTAAAATATCGTTTAAAACAAGTTAATTGGTTTAATCGTGTACGTGAATTTCGTGATTCTGAAGATAAATTACCCATAGATGAAATACAAAAATTCTTACAAGAAGGTCTTACAATAGCACCTCATTCAATTATTGAAAAAGAATTAATTGAACTGCAAGACATAGTATTACAAGTTGATGATTGGGAATCGAATGCACAAAAATGTTTTGAAAGTGGTACACAACATGAATTACCTAGAATTGAATTATTATTAGAACGTGGTGATGATATTGAAGGTGAACTACCATCAAAATCTGCATTAAAAGATGCTGTTAAAAAAGCTAAAGAATGGTTACAAACAGTTGAAATACTTCAAGCAAATGAAAATTATCCATATTTTCATACATTAGAGAATGTTGTAAATCGTGGAAAGAATATACCATTTCAATTAGAAGAATTAAAACGTATGGAAGATCATTTAAAATCGGCTCTTGTTTGGAAAGAACGTACTGCACGTACATTCCTTAAAAAACAAACAACATTTACTCTAATAGAAGTATTATCACCACGTACAGAAGCTGTTATGACTGGCATAAAATCAAAAAAGAAACCATTAGAAGAACAATTCACTGAAGAAATGGGTCCAGTACAAATGGTAAATGCATTTAAAAGTGCTGAAGAGAAAGAAATTAATGATATGCGTGAATTACGTAAAATTAATACAGAAAAGAATCCATTAGAGGATAAATATTGTATTTGTAAACGTAAATTTCAAGGTCATATGTAtcattgtcaattatgtaaagaatggtttcatgagcgctgtgtaccagcaccaaaaaatactgttagaacaaaaccaacagcagcaataagtatgaattctccatcatcatcatcatcatcatcatcatcgtcttcatcatcagctggagcatcaccgacaagtacaagtaatgccggttcaccaatagcaatgaaattagtaccacaTTTTAATCGTGATAAAGATCGTGAAACAAAATATTTATGTCAATCTTGTATGCGTTCAAGACGACCACGTTTAGAAACAATTCTATCACTTTTGGTATCACTTCAACGTTTACCAATCCGTTTACCAGAAGGTGAAGCCTTACAATGTTTAACAGAACGTGCAATGAATTGGCAAGATCGTGCTCGTCAGGCATTCGCTATGGAAGATGTTGCTTCAGCATTAGCACTTATATCACAAAAATTAAATGATAATCAAGGAAGAAGTGATATAGATTTGACGACAATTCAACGTAAACGTTTGAATAAAAGAAAATTACAACAACAAAAACAAAAATCTTTTGACGAAAGCGAAGAAATTTTCGATTCAAGTTCATCAGATGATGGAAGTTCAAGTGATTTGAACACTAAAATTGGTATTAGCATTGAAAGTAGTGAACAAAGAGATAGTTCACCATCATCACCAATGAAAATTGAACATGCGTATTCAGTTCCATCTCCGAATGTTTCATCAACGACAACAAACATTTCTGGAAGTGGAAGTGCCTTTAATAAAACTGGAAACAGTAACGTTACTCCTGGTGTTAGTTCTGCATCAGTTCAAAAATCAGATATGCCATTAATACAATTAAATAAAGAAATTCTAGAACATTTAGAGGATTTAATGATGGAAGGTGATTTATTAGAAGTATCACTTGATGAAACACTTCATTTGTGGAGAATTTTAAGTGCAGCTAAACCATCAATGTCTGATTTGGCATGCATACAAAAAAAATACAATTTAGTGCCAAGTTCAGTTGAAAATGTTCTAGTCAGCAACAATAAAAAACGAAAATCTGATGAGGGTATTTCACATGTTGCTGCTAAAAAAATAGCTAAAAGTAAATTGGCTGGCTCACCTACAGCAACGACAACAGCCGGTGGAACAAATATAAATAGCAATGCAACAATATCGGGAGCAATGGCTAAACAAGTTAAACGTGGTAGAAAAATGAAGTTAACAAACCGAAATGTTGAAAATGGTTCAGGTTCTTTGGAAAGTAGTGGTACAATTAGTGCATCATCAGGAGGAGGAGGAACACCTGTAGCAGCTACAGGAGGAAGTGCAGTATCTAGTACAAGTGGCGGAGAAAATAAAAAACCTGGAACAAATAATGAAAATAAAAAACGCAGACGTGGTGGAGGTAGTAATGCTGGGAAAAAAACACAACAAGATTTATCATCAACAACTACTGTTACATCAGATGATGATGAAGATGAAGAATGCAGTGCACCAGTTTGTTCTCGACCTTCAGGTCGTGAAGTTGATTGGGTTCAATGTGATGGTGGCTGCAATATGTGGTTCCATATGTTTTGCGTTGGATTAAGTAAACATCAAATTAAACCGGATGTTGATTTTATTTGTAAAAGATGTAAAAAGACAACTCAAACAaaaaataatgctacaacaccagcagttgcaggagcaattgcaccacctacaacaactacaacaactacaacaacatcaaattctgatgatacaaattctccaaaaataataatagtaacaacaacatcctcatcaccatcaccaccattatcatcaccatcatcctcatcatcatcatcatcattatcatcagcagcagcagcagcaacagcaacagcagcagcagcagcatcatcatcatcatctgttctaatgacgataacatgttcaccaaaaggaccaatcgatataactgaaattgatttagtttcaacaacaacaccaccaaattTAACGTGTGTTTCAACATCTTCAATAAATTCAACAGATTGTAAAACAATTTCACCAGCAACATTATCACATTCTTCTTCTTCCTTTACTTCTTCTTTAAATTCAtcaacagtaccagaagttatatttacaacaacaacagcaacatcaagaagaagtagtataaattcatcaccagaaccatcatcatcatcGGTTATTGAAACAACATTAAATATTAACCAATTTTAG
Protein Sequence
MSNTTVNSCNQSSGPGPGPGPGGGITTISNVNNNNNNGIINNTSNNSNSTSLNSSGGYNSNVNNINNTTNSILSSSTTTITTTAGNTSTTASSTARSHNHYHNYNNHNHHHPYLHTQTTFSMNKNEEFQFIKPPECPVFKPNEEEFKNPLAYISKIRPVAEKFGICKIQPPKTWTPPFTVDVDEFRFTPRVQRLNELEAKTRVKLNFLDQIAKFWELQGSSLKIPMVERKALDLYTLHRIVQEEGGMDVITKERKWSKIAQRMRYPPGKSVGAILKGHYERILHPFDIFTSGKVVDLKLETEIDDQDYKPHGIVSRQQIQPPNATTAKRSKRFAASATAKETACGLSNYNNTPSSTTTSSGIKNELKKEQPADDEELKHIDPKEYRRLQINGAYRMSGCKTKGIRTRMMASGGAGSSNSNGGGNAIGNSASGTTTSNKKKSKDSDPLAKYICHICNRGDAEEAMLLCDGCDDSYHTFCLIPPLNDIPKGDWRCPKCVVEEVSKPQEAFGFEQAQREYTLQQFGEMADQFKADYFNMSVHLVPTDLVEREFWRIVSSIDEDVTVEYGADLHTMDHGSGFPTRSSLYLQPRDQEYAESSWNLNNLPLLEESILGHINADISGMKIPWMYVGMCFATFCWHNEDHWSYSINYLHWGEPKTWYGVPGTKAENFEETMKSAAPELFQSQPDLLHQLVTIMNPNILMNCGVPVYRTDQRAGEFVITFPRAYHAGFNQGYNFAEAVNFAPADWMKMGRECINHYSLLRRFCVFSHDELVCKMALNPDKLNLGIATACYLDMAEMVDSEKKLRKSLLEWGVTKAEREAFELIPDDERQCESCKTTCFLSAVTCPCTKSIVCLRHYTELCDCPPDKHTLRYRYTLDELPLMLKKLKVKAESFENWLSKVRDVLDPNTPTTITLEELQELAQEAETKKFPSSVLLERLNSAVLEAEKCVTVIQQLDINKMRTRTRNSSESAKYKLTLDELEMFVQEIDNLCCVISEGQSVRELQQYGKDFVTAANKLLSQPIANVREDHISKLIEEGAYLCIELPEIKALKYRLKQVNWFNRVREFRDSEDKLPIDEIQKFLQEGLTIAPHSIIEKELIELQDIVLQVDDWESNAQKCFESGTQHELPRIELLLERGDDIEGELPSKSALKDAVKKAKEWLQTVEILQANENYPYFHTLENVVNRGKNIPFQLEELKRMEDHLKSALVWKERTARTFLKKQTTFTLIEVLSPRTEAVMTGIKSKKKPLEEQFTEEMGPVQMVNAFKSAEEKEINDMRELRKINTEKNPLEDKYCICKRKFQGHMYHCQLCKEWFHERCVPAPKNTVRTKPTAAISMNSPSSSSSSSSSSSSSAGASPTSTSNAGSPIAMKLVPHFNRDKDRETKYLCQSCMRSRRPRLETILSLLVSLQRLPIRLPEGEALQCLTERAMNWQDRARQAFAMEDVASALALISQKLNDNQGRSDIDLTTIQRKRLNKRKLQQQKQKSFDESEEIFDSSSSDDGSSSDLNTKIGISIESSEQRDSSPSSPMKIEHAYSVPSPNVSSTTTNISGSGSAFNKTGNSNVTPGVSSASVQKSDMPLIQLNKEILEHLEDLMMEGDLLEVSLDETLHLWRILSAAKPSMSDLACIQKKYNLVPSSVENVLVSNNKKRKSDEGISHVAAKKIAKSKLAGSPTATTTAGGTNINSNATISGAMAKQVKRGRKMKLTNRNVENGSGSLESSGTISASSGGGGTPVAATGGSAVSSTSGGENKKPGTNNENKKRRRGGGSNAGKKTQQDLSSTTTVTSDDDEDEECSAPVCSRPSGREVDWVQCDGGCNMWFHMFCVGLSKHQIKPDVDFICKRCKKTTQTKNNATTPAVAGAIAPPTTTTTTTTTSNSDDTNSPKIIIVTTTSSSPSPPLSSPSSSSSSSSLSSAAAAATATAAAAASSSSSVLMTITCSPKGPIDITEIDLVSTTTPPNLTCVSTSSINSTDCKTISPATLSHSSSSFTSSLNSSTVPEVIFTTTTATSRRSSINSSPEPSSSSVIETTLNINQF

Similar Transcription Factors

Sequence clustering based on sequence similarity using MMseqs2

100% Identity
-
90% Identity
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80% Identity
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