Basic Information

Gene Symbol
ZMIZ1
Assembly
GCA_963942445.1
Location
OZ012679.1:46487138-46502479[+]

Transcription Factor Domain

TF Family
zf-MIZ
Domain
zf-MIZ domain
PFAM
PF02891
TF Group
Zinc-Coordinating Group
Description
This domain has SUMO (small ubiquitin-like modifier) ligase activity and is involved in DNA repair and chromosome organisation [1][2].
Hmmscan Out
# of c-Evalue i-Evalue score bias hmm coord from hmm coord to ali coord from ali coord to env coord from env coord to acc
1 2 0.81 8.1e+03 -2.2 0.9 4 24 662 682 659 686 0.86
2 2 7.9e-24 7.9e-20 71.5 3.8 1 49 745 793 745 794 0.97

Sequence Information

Coding Sequence
ATGAATGCTCAGGGCGGCTCTTCAAGGGCTCCAGCCTTAGAGAGCCAATTATCCCCTCAAGGAGCATATTCATCATCTTCTAATACATCATTTGATACAACAGCATCACATCAACAACATatattgcaacaacaacaacatcaatatcaattacaacaacaacaacaacatcaacattatcaacaacataataatagtAATACAACTAATAATAACAACagtaataatacaaataatacaaacaatacaaataataataataataatagtaataataacagtaatataaataataataacaatagtaataccaataataataataataatagtaataataacaacaacaataataataatactttaaaTACTGGTGGTAATAACAGTTATCACCAGTCAACTGGTTTAatgaatggaaacatggtagcTGCGACCGGTACACAGCAAACCATGGATGGAATGAGTTTTAATTCACAaatgGCCAATATGCAAATGCATAATGGTGGTAATGGTGGTAATAGTGGTGGTATGACAGGTCATCATCCCCATCAATATATGAATGGAATGAATGGTATGGGATCAAATAGTATGAATGCAAATACAGGAATAAATGGTATGAATAGTATGAATGGTATGACACCAAATGGAATTGGACCTATGACAAATATGAATGGAATGCAAAGCAGTGCAATGAGTGGTATGAATCCAGCTAATCAAATGATGggcggtggtggtggtggtgttgGTGTTGGTGGTAGTAATGGAATGCAAATGAATTCAATGGGACATATGAACAGTATGAATTATAATATGGCAAGGCATCATAATATGTCACCAATGAATCAAATGCAAAATATGACTATGGGCATGGGACCAATGGGTCCAAATCCAAATGTAATGAGTAGTGGCGGTGGTGGTGTTGGTGGTGGTGGTAGTGGTGTTGTATCATCAGCTGGTTCAATGGGACAACATCATCCATCAATGGCTgcacatcatcatcatcagcaacagcagcaacaacaattAAATGCAATGAATCCTATGGCTAAAATGCAAGGTATGGCTAACGGTGGTTATCCACAACAAAGAAGAATAGCACCGTATCCAAATCCACAAATGCATGCAGCACAAAAACGTCATGCAGCTGCAGCTGCTGCTGCAGCAGCTAATATGCATCCAAGTATGGCAAATTATCAAAATCCAAATGTTCCTCCTCAtgcacaacaacaacaacatcccGGGCAAATGCAATTTTCCCATCATCAGTCAGCAAGTGGTATACCAGTTCCTATGCAACCATCTGGTTATGGTCGATCAATGCCAATAAATCCGTATGCAAGTAGTCGTAGTGCGGCTATGGGTGGTACAAGTGGTGGTGGTATGGGTGGTAGTATGGGAGGTGGTAGTGGTGGTATGATTGGTCCACAACAAAGACAAACAACACCACCATATACAAATCCAATGCAACATCAACAATTTTATGGTGCTGGTAGTGGAAATCCATCAGCAAATGCTGGTATGGGAAGTAGTTATTCTAATGCTCCGGGttttCAACAAGATGTTCGAATGAATATGAACAATTATCAGCATAGTCCAGTACCAGGAAATCCTACACCACCATTAACACCTGCTTGTTCAATTCCATATGTTAGTCCAAATCCAGATATTAAACCGCAAATTGATCATAaaGATGAAGAAATGCGATTAACGTTCCCAGTACGTGATGGTATTATATTGGCACCTTTTCGATTACTACATAATTTATCAGTTAGCAATCatgtattcaatttaaaaacaactgtTTATAATACATTGATGAGCaggagTGATCTTGAGCTACAATTAAAATGCTTCCATCAAGAAGATCGACAAATGAATACAAATTGGCCACATACGGTAACGGTTTCAGCAAATGCAACACCATTGGTTATTGAAAGATCAGAAAAAACTGGTCAAGCACTACGGCCTCTCTACTTAAAACAAGTATGTCAACCTGGACGCAATACATTACAATTAACGGCCAGTTCTTGCTGTTGTtcacATTTATTCGTCCTACAATTAGTACATCGTCCATCAGTAAGACAAGTTTTACATAGCTTGCACAGACGTAATTTACTGCCAGTTGAACATAGTGTTGccaaaattaaaagatattttgcAATGGGTATGGCAGGGCAAAGTTCACCATCAGCTGATGGTTCTGGATCAGCAACAAAtccagaatttattaaaatatcacttAAATGTCCAATTACAAAGAATCGAATAAGATTCCCAGCTCGTGGACATGAATGTAAGCATATTCAATGCTTTGATTTggaaagttatttattattgaattgtgAAAGAGGTAGTTGGAGATGCCCAGAATGCAataatccGGCTTTAACTGAAGGTCTAGAAATTGATCAATATATGTGGGCAATTTTAAATACACTTAGTCAGTCAATAGATGTTGATGAAGTAACGATAGATCAATTTGCTAATTGGCAAAAAATTATGAGAAATGTTCCTGGACAAATGCaacaaacacaacaacaacaacagcaacagcaacaacagcaacagcatCTGCAACAAAGTGGTGGAAATAATATACAAGGTAATGGTAATGGTACTAATGATGTAACAACTGGTAATGTTAATAACAGTAATATACcacaaataaaacaagaaaatgttgatgttgatgatttaaAGAATTTAGCAAAAGTTATGTCACCAGGATCAACAGCATTACCAACATGGGATAATTCACAAGCAATGAGTCCATATATGTGTCATGATATGAATTCAATTGCAAGTGGCAATATGATGGGACAAGGttgtaacAGTTCTCGAAATTCATATGATTCATTTGGTAATAATAatccaaatgaaaatatttctggTGCAGATTCTCTGTCACATTTGAATGAATCAGTTAATTCATTGGATCCATTAAATGCTATGGAAAAATCATTAAATGATCAGatgcCTCATACACCTCATACACCACATACGCCAGGTGGCAGTTCTAGTCATCCTTTAACACCAGGTGGACCACCAAGTGTTAGTTCAGCGCACAATGAGAATGTTGGCAATTCAAATACCAACAGCaatacaaataacaataataatagtaataataaaaataatcaaaatacgaataacagtaataatggcaacaataataatagccaAAATAGTAATAGTTGCCATAATTCACCTCAACATCAACTTATAAATCATCCATCTCctcaaaatagtaataataataataataatagtaataatggtaataatagCAGCAGTAATCAACAGCAAATaagtcaacaacaacaacaatcaccACATCATcaatcacaacaacaacaacaagcaCAATGTACATCTACgccaaataaaattagtaataataatattagtaacagtaacagtaatagtaataataatattgataataatattagtacacATCAACAACATCAAATTATAAACTCGCTTATTAATTcacaaaatgataatttaattaatttaaatgataccGATTTAAATGCTGATCTTAATTTTGATCCATCAGCTGTTATTGATAGTGATGCAACAAATGATTTAAAtcttTTATCAGATAGCGTTGTCGATCCCatggaaatattaaattatctagATCCTCAACCAGATTTAAATACACCACCATCCAGCGGATCAAGTAATAATCCAAATCAGGATGATATATTAGCCTCATTATTTGATTGA
Protein Sequence
MNAQGGSSRAPALESQLSPQGAYSSSSNTSFDTTASHQQHILQQQQHQYQLQQQQQHQHYQQHNNSNTTNNNNSNNTNNTNNTNNNNNNSNNNSNINNNNNSNTNNNNNNSNNNNNNNNNTLNTGGNNSYHQSTGLMNGNMVAATGTQQTMDGMSFNSQMANMQMHNGGNGGNSGGMTGHHPHQYMNGMNGMGSNSMNANTGINGMNSMNGMTPNGIGPMTNMNGMQSSAMSGMNPANQMMGGGGGGVGVGGSNGMQMNSMGHMNSMNYNMARHHNMSPMNQMQNMTMGMGPMGPNPNVMSSGGGGVGGGGSGVVSSAGSMGQHHPSMAAHHHHQQQQQQQLNAMNPMAKMQGMANGGYPQQRRIAPYPNPQMHAAQKRHAAAAAAAAANMHPSMANYQNPNVPPHAQQQQHPGQMQFSHHQSASGIPVPMQPSGYGRSMPINPYASSRSAAMGGTSGGGMGGSMGGGSGGMIGPQQRQTTPPYTNPMQHQQFYGAGSGNPSANAGMGSSYSNAPGFQQDVRMNMNNYQHSPVPGNPTPPLTPACSIPYVSPNPDIKPQIDHKDEEMRLTFPVRDGIILAPFRLLHNLSVSNHVFNLKTTVYNTLMSRSDLELQLKCFHQEDRQMNTNWPHTVTVSANATPLVIERSEKTGQALRPLYLKQVCQPGRNTLQLTASSCCCSHLFVLQLVHRPSVRQVLHSLHRRNLLPVEHSVAKIKRYFAMGMAGQSSPSADGSGSATNPEFIKISLKCPITKNRIRFPARGHECKHIQCFDLESYLLLNCERGSWRCPECNNPALTEGLEIDQYMWAILNTLSQSIDVDEVTIDQFANWQKIMRNVPGQMQQTQQQQQQQQQQQQHLQQSGGNNIQGNGNGTNDVTTGNVNNSNIPQIKQENVDVDDLKNLAKVMSPGSTALPTWDNSQAMSPYMCHDMNSIASGNMMGQGCNSSRNSYDSFGNNNPNENISGADSLSHLNESVNSLDPLNAMEKSLNDQMPHTPHTPHTPGGSSSHPLTPGGPPSVSSAHNENVGNSNTNSNTNNNNNSNNKNNQNTNNSNNGNNNNSQNSNSCHNSPQHQLINHPSPQNSNNNNNNSNNGNNSSSNQQQISQQQQQSPHHQSQQQQQAQCTSTPNKISNNNISNSNSNSNNNIDNNISTHQQHQIINSLINSQNDNLINLNDTDLNADLNFDPSAVIDSDATNDLNLLSDSVVDPMEILNYLDPQPDLNTPPSSGSSNNPNQDDILASLFD

Similar Transcription Factors

Sequence clustering based on sequence similarity using MMseqs2

100% Identity
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90% Identity
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80% Identity
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