Basic Information

Insect: Argyra leucocephala
Gene Symbol: zfh2
Assembly: GCA_963942445.1
Location: OZ012682.1:40816406-40887856[-]

Transcription Factor Domain

TF Family: zf-C2H2
Domain: zf-C2H2 domain
PFAM: PF00096
TF Group: Zinc-Coordinating Group
Description: The C2H2 zinc finger is the classical zinc finger domain. The two conserved cysteines and histidines co-ordinate a zinc ion. The following pattern describes the zinc finger. #-X-C-X(1-5)-C-X3-#-X5-#-X2-H-X(3-6)-[H/C] Where X can be any amino acid, and numbers in brackets indicate the number of residues. The positions marked # are those that are important for the stable fold of the zinc finger. The final position can be either his or cys. The C2H2 zinc finger is composed of two short beta strands followed by an alpha helix. The amino terminal part of the helix binds the major groove in DNA binding zinc fingers. The accepted consensus binding sequence for Sp1 is usually defined by the asymmetric hexanucleotide core GGGCGG but this sequence does not include, among others, the GAG (=CTC) repeat that constitutes a high-affinity site for Sp1 binding to the wt1 promoter [1].
Hmmscan Out: # of c-Evalue i-Evalue score bias hmm coord from hmm coord to ali coord from ali coord to env coord from env coord to acc

1 13 0.3 43 6.0 0.7 2 23 138 160 137 160 0.95

2 13 0.00025 0.036 15.6 1.4 2 23 898 920 897 920 0.96

3 13 6.2e-05 0.0089 17.5 0.7 1 23 952 976 952 976 0.92

4 13 0.02 2.8 9.7 0.4 1 22 1154 1175 1154 1178 0.91

5 13 0.015 2.2 10.0 0.1 2 23 1852 1874 1851 1874 0.95

6 13 5.8 8.2e+02 1.9 0.5 1 23 2074 2099 2074 2099 0.88

7 13 0.0013 0.19 13.4 1.5 1 23 2112 2134 2112 2134 0.96

8 13 0.0024 0.34 12.6 1.9 2 23 2141 2163 2140 2163 0.94

9 13 1.6 2.2e+02 3.7 1.9 1 22 2325 2346 2325 2349 0.91

10 13 0.022 3.1 9.6 0.6 1 22 2370 2391 2370 2394 0.89

11 13 0.0097 1.4 10.7 0.1 1 23 2500 2524 2500 2524 0.93

12 13 0.7 99 4.8 4.2 1 19 2697 2715 2697 2720 0.91

13 13 0.0017 0.25 13.0 2.6 1 23 3636 3658 3636 3658 0.96

#	of	c-Evalue	i-Evalue	score	bias	hmm coord from	hmm coord to	ali coord from	ali coord to	env coord from	env coord to	acc
1	13	0.3	43	6.0	0.7	2	23	138	160	137	160	0.95
2	13	0.00025	0.036	15.6	1.4	2	23	898	920	897	920	0.96
3	13	6.2e-05	0.0089	17.5	0.7	1	23	952	976	952	976	0.92
4	13	0.02	2.8	9.7	0.4	1	22	1154	1175	1154	1178	0.91
5	13	0.015	2.2	10.0	0.1	2	23	1852	1874	1851	1874	0.95
6	13	5.8	8.2e+02	1.9	0.5	1	23	2074	2099	2074	2099	0.88
7	13	0.0013	0.19	13.4	1.5	1	23	2112	2134	2112	2134	0.96
8	13	0.0024	0.34	12.6	1.9	2	23	2141	2163	2140	2163	0.94
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11	13	0.0097	1.4	10.7	0.1	1	23	2500	2524	2500	2524	0.93
12	13	0.7	99	4.8	4.2	1	19	2697	2715	2697	2720	0.91
13	13	0.0017	0.25	13.0	2.6	1	23	3636	3658	3636	3658	0.96

Sequence Information

Coding Sequence: ATGCCACCACAACCACAACCACCACCAGATTCACCGACATCTGCGGTGgcacatcaacatcaacaacaacaatcaacTTCTGATTTAGCACCACGAAAACGTCGAAGAAAACGTGATGATCCGCAAAGTTGTTTTACAAATTCTGAAGAATATGATTCAGATGGAGGATCACCAACATCATGCTCAGATGTTGAAAGCTTTCAAGGGAAGATAGTGTATAATCCAGATGGTAGTGCATATATTATTGATTCTGAAAATGATTCACTATCAAATTTAtcagaaaattgtttaagtaATAATCCTCCATCAACAAATAAtccaaaaattcattcatttcgTGTTGTAACTGCTCATGATGCAACACATCAAACCATTGaaccaaataatattaaaatacaaaagccAATATTAATGTGTTTTATTTGTAAACTAAGTTTTGGTAATACAAAATCATTTAGCTTACATGCAAATACTGAGCATACATTAAATTTACAAGaatctgaaaaattattattaaatcgtGAATATTCTAGTGCCATAATACAGCGCAATGTTGATGAAAAACCTCAAATATCATTTTTGGAACCACTTGATTTACacaagaaacaacaacaacaacaacaacaattacaattacagcaacaacaacaaccaattAATGCTATAATATCAAAAACTAAtgatattattgataatattttatcaacaacatcaacagtaacatcaacaataacatcagcaacaacaacaccaTCAATAATTGCTTCacaaatacaaacaacaaataatatgaataataatagtgattgtaataataaaataaataataatgataatgtaattaataatagtGCAGGAGGAATGGGAGAAATAGCAGGATCATTAATATTTCCAATTAAATCTTTATcttcatcatcaacatcatcaacaacagcatcatcatcaatttcaaattcaataaatttaaatatattttcatcatcTTCTCCTCCGTTATCATCAcctataacaacaacaacaacaacaacaacacctaCAACATTAGTTGCAACagatacaacaacaacaacaacagcatcTGAAATAATatctgataaaaataattttaataatattagtaatattagtaatattttaatgtcatcatcatcatctacaataacaacaacaacaacagcaacagcagcagcttcaaacacaattacaacagcaacatcaaatttattacaacaagaattaaaagaaacgggagtattattatcaataaacaataatataagtaatattagtaatattaatgATAGTATAACAAATTCTGTAGCATCAGTAACATCAACAACAATAGCAACATTAAGTGGTTGTGAATTAAgtcattcaaataataataacaataataatagtaataatgataatagtTGTAGTAGTAGTTCTATGATATTATcagcaataacaacaacaacagcaacaacaccatcaacagtaacaacaacaacagttaATGTAACaccaatatcatcatcatcatcatcgtcatcatcatcaccatcaatagcaattgataatttatgtttaaaaaataatattgaaataaattcaacaacATTAAATACGACACAAACAACGTCAGTAGTAAATTCTTCTTCACCATTATCAGCAACAATCACTTCCCAATCtcaaaaaacaatgaataagactaataataataataataataataataatagtaatactaCTGCTATATTAAAtaccaattcaaatataaataacagtAGTAGTAATAACAATAGTTGTAATACAACTACTAGTATtagttctaataataataatactaatattcataataataataatcctattaatttaaataacagtaatttaagtaataataataataatagtaatttaaatcCAGCTGATTTCttacaacaacaattacaacaaatgcaacatcaatttcaaaaacatcaacaacaacaacgtaATTCAATTGTCAGCGGCATAAAtcctattaataataataataataataataatagtaatttaataagTGGAAGTTCCTCATTACAAGCATCTTTAGCAGTGGCTGTTGCTGCAGCTGCTGCAGctcaacatcaacaacaaaatgacattattagtaataataatagtgctaaattattaaatgaattttttcaacaacaatttcaacaacaacagcaacaacaacaattaattgCATGTCCTGAACATATAATGACTGGTATGAAAGGACTAGATTGTAAAGGAtgtgaattaataaatattaatttaaataaaacaataccaATAACTTcatcaataacaacaacagtaacaacaacaccaacaaaatCACCaacaagtaatttaaatttatcatcacCATCAGCGGCAGcggcagcagcagcagcagcggCTGCTGCAGCTGCTGTTATAGCATCTGcacaacaattaaatatatcaccTGGTGGAATTAATTGTGGTAATACAATTCCTAATAATAATGGTAGTGGTGGTAGTGGTAATGGTAATAGTTCAACAACAGCACCACCTAGTTTTACAATTGGTGCATGTCCAGAGCATATTAGTGGGAGACCGTTAGGTGTTGATTGTGCaagATGTGAAATGATTTTGAATACAGCCCGTCTAAATAGTGGTGTACAAATATCAACTCGTAACTCttgtaaaacattaaaatgtcCTCAATGTAATTGGCATTATAAATATCAAGAGACACTTGAAATTCATATGAGAGAAAAACATCCGGATGGTGAAAGTGCGTGTGGTTATTGTTTAGCTggtCAACAACATCCACGTCTGGCACGTGGTGAGTCTTATACATGTGGTTATAAACCATATCGCTgtgaaatatgtaattattcaacaacaacaaaagggAATCTATCAATTCATATGCAAAGtgataaacatttaaataatatgcaaGAATTAAATAACTCACAGAATATGCAAAGTGCGGCTGCAGCTGCAGCAATATCAGCTGCAGCAGCAGCATCAGCTGTTAATTCAGCACAAAAttcgaataataatttattgggagcaacaacaacaacaacaacaataaataatagtaatagtggTAATATTAATATGCCAGTAAATTCATCAAGTAGTAATAATTCTAGTGGTAGCGGTAATATTGGTGGTGGTTCATCAATTGATGCAATACGTGATAGTCCAAAAATTCTAATGCCAAATATACATTCAGGTAGTACATCAAATATTGGAAATAACAGTAGCAGTAGTGGTGGTGTTGGTAGTGGTGGTAGTGGTGGTAGTGGTGGTAGTggtggtaataataatattagtggTGGTAGTGGTGGtattatttcacaaattttaccATCACAATCATCACAACAACAATtaatgcaacaacaacaacaacaatcatcACAATCCTCTGGATCTGGTTCTTCATCACAAAAACCCAAACCATCATTTCGTTGTGATGTTTGCTCATATGAAACATCAGTTGCACGTAATTTACGTATACATATGACAAGTGAAAAACATACTCATAATATGGctgtattacaaaataatatgaaacatTTTCAAGCATTATCGTTTTTACaatcacaacaacaaaatttagcTGCAACAGCTAATTTACCAGCTAATTTAGCCGTAGCTGCAGCTGCTGCTGCACAATTAGGGCAAAATATacctaatttacaaaattttttaccaGAAGCAGCATTAGCTGATTTAGCATATAATCAAGCTTTAATGATACAATTATTACATCAAAATTCAGCAACTGGTGCATTAGGTGCTGCAGCAGCAGCCGCAGCAGCAGCTGCTGCAGCTGCAGCTTCTCAACAAACACCAAATTCTGTTGTAACAGCTGCAGCTGTACATCAAttacaacaacagcaacaacaacaagctgctgctgctgttgcaGCTTTATCAGCAGCAAGTGGTAATAATAATgtagcagcagcagcagctgTTGCAGCATCATTaattggtaataataataataataataataataataataataataataataataataataataataataatagcaataacagtaataataataataataataataataatagtaacacatcaatatcatcatgtattcaatcaaattcaaattcatcatTACAAATACATGGTAGTACTGGCATTGGTGGTAGTGgttctattattaataataataatagtaattgtggtaatagtagtagtagtccACAACTTTCAATAAgtcaacagcaacaacaacaacaaaattcagCTAATGTTGCTGCTTTAGCTGCAAATGCATTGATGAATAGTGCTGCAGCAGCTGCTGTTGTAGGTATTGAACCAGATCAAGGTATTAATCCAGATTCATTTGAACCAccaattgaaattgatttaaaaccaacaacaatatataGAACGGGAGCAGGAACAGGAATAGGAacaacatcatcaacaacaacaacaacaccaacatcaacatcaacaacacAAGTGGCAATATCATCAAcatcaacagcaacaacaacatcgACGTTAAATGATAATAATATTGTGAAAAGTGAAAGGCCAAGTCCATCGAATAgtcctattttaaaatatgattcatCGTTATCAATGTCCTCAaatccaatattatttaattcaaataatccaATTGGTATTGAATTACATCATCAATTACAATCTCATCAACAACAACTtcagcaacagcaacaacaacatcatcaacTATTACAACACCAACATCAACTTCAACATCAGCATCATCAATCAGCTGGTTATGATTTATCCTTATCTTCTTTAccatcaaatataaatacatcCACATCAATTGGTGGAATAAGTGGTATATCATCATCAGCATCTACATCAATTGTTAGtccaacaacaccaacaacagtttataaatgtaataattgtgAATATTTAACTGAATTAAAACATGATATTGATCGTCATATTGAACAAATGCATTcacaaaattcaattga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