Basic Information

Gene Symbol
ARID2
Assembly
GCA_963942445.1
Location
OZ012677.1:64303089-64311764[-]

Transcription Factor Domain

TF Family
ARID
Domain
ARID domain
PFAM
PF01388
TF Group
Helix-turn-helix
Description
This domain is know as ARID for AT-Rich Interaction Domain [2], and also known as the BRIGHT domain [1].
Hmmscan Out
# of c-Evalue i-Evalue score bias hmm coord from hmm coord to ali coord from ali coord to env coord from env coord to acc
1 4 2.6e-23 1.5e-19 71.3 0.0 2 89 41 126 40 126 0.93
2 4 1.3 7.4e+03 -1.5 0.0 29 61 648 680 627 697 0.65
3 4 2.4 1.4e+04 -2.3 0.2 49 65 1843 1858 1796 1878 0.55
4 4 7 4e+04 -7.7 9.0 20 86 1897 1958 1847 1959 0.55

Sequence Information

Coding Sequence
ATGACAACAACAGAATTTAAAGATCCTGCAGCAACCCAAAATGATGAAAGTCAAAATACAACAAACTCAACAAAGAAGCGTGGAACACGGACAGATGTTGGGCTACAACAACAACCAGACCCCGAAacattttataagaatttaatagCATTTAATGAGCGcagaaacaCTCCAATAATAAGAATGCCAAAAATTAGCGGTGAAGATGTTGATTTGCACAAGTTATATTTAGAAGTAATAAGTCGCGGCGGATGGTTAAAAGTTAACATAAGAAATGAATGGGAAGATGTTTTAAGTGATTTAGATTTTTCTTCAAGATGTGTGAATGGCATTGTTgcgttaaaacaaatttattatcgatatttagataaatatgaaaaagtttattttcttgGAGAAGATCCGGATCGACCAGATGAACCTGATGATGACGATCGTCAAAGCAGGCATAAGAAATGGTCTGAAAAATCAACACCAATAATACCAATGTCTTATAATTATCTTCAACATAATGTCACAGAACAAACCAGAATATCTAATAAAATGTCaactgatttatataaaaattccgAATATGAAAAGCTATTGCTTTCTTTAATGTCTCCATTACCAAATGAACAAGATTTTGCAATTAATGTTTGTACTTTAATGGCAAATGAAAGTAAACATacgttaaaaattgaaaattgtccaAAACTATTAGATGCTTTAATTGCACATGCTGGTGTATTTTGTCATTccaCTATGAGAGAACTTTTTGAagagttttatacaaaaaatcgAAAACATCAGTTGCAAACCTTTTGGAAtgatttactttataaaattccACAAATTTTGGAATTATCATATGAAAATTCTGCCAAATCAATTGGATCAAGTGGATTACGTAAAGTACAATTAGACTGTAAAGAAACTTTTGAGGATGGATTGAATGCTGAATTTGATGaagaatttgaaatagaaaatattgattttgataGATTGGAATTTTTATCATTAGGATGTGGTCTCGGAACCCGTGAATATGTTGGTCAAAGAGTTCAACAAATTGCTTCGATAATgagaaatttaagttttttcgaAGAAAATATAACTATCATGGCTAAGAATCGGACATTTATTCGTTTTTTAGTTATGTGCTCTAATATTCGTTGGAGCAATTTGCATCATATGGCTTTAGATATATTGGGTAATATTGCAACTGAATTAGATCTGAATGATCCAACAACGGATTATTTAACTCGTTGTTTAATTTCTACATTGTGTGAAGGAATCGAAAGTCAAGATCGTGGTGTAATTATAAgttgtttagaaattttaaacaagTTCAGTCAAAAAGACACTAATGAAGATTACTTACTAAAATctatcaatcaaaatatttataatcatGTATGCCTTTATCTTTCGTTGAATGATATAATGCTTTTGTTGTATACATTGGAATGTATTTACAGTCTCAGTTCATTAGGTTCAACTCCTTGTAATGCATTTGTTCAAGTAAAAGGTATTGTTGATACATTAGTATCATTAATAACTGTTGAGGCACAATCATATGGATCCGATGGATGTATATTGATGAGAGTTGTTGAAACAGTTCCCGGAAATATGTTACCGATGGTAGCTCAAAATATCGCCAACTTGCAAAATGTTGCCTTAGCGCAACTCAAGCAACCACAACAATCACAAAgtcatttaattaaaactgaaGTTACACAAAaagtaccGACTCTTTCTCAAAATCAAGTGCCTCCAATTATAAATTCTCCTGTTgcatcacaacaacaacaaccacaacaaatGTCACCCAATGTTAACacaccaaaacaaaatattcaacaattGCAACAACAACCAACAACACAAGAAAATGAACAGTTTGCTATTTCATGGTTAACTGCAACTTTGGAAAATGCTCCATCTGTTACAAATAGAATTGAACAACAAGATCTTTACAAATTATATAGTGCCGCTCTTGTAAAAAATGGAAAACGTGGCGCTGTCACACAAACACTTTTTCCAAGAATAGTTCGTTCAATATTTGGAACTAACATCGGACCAACAATGTTAAAAACTACAGATTCGGCAAAGGGTTCTGaaacaaatatgtttttttatgttaatttaaaattacgtgCTAATCCAATACCCTTAAAAGGATTATCACAAGTATCACAAATTCAAAACCAACAGCAGCCTGGTCAACAAAACAACCAGCTAAATCAAATAACACAACAATCCCACATAAATCAAAATGTCCTGAATAAACCTTCAACCCCAACCGCTACATCAACTCAAAATTCAGTGTCAACATTATCAAAAACGCAATCATCTAATGATTTggtaaataattcaaataaagagGTGGGTTCAAAACATGAAACTAGCGCAAAATTGCCGACGAATTCTCCAGTATCATCTTCTCCACTAGTTTTACAAACACCTAACAGTAGTTGTAATACTAAcaatgtcaataaaaatttacaaaatgtgaATGCTAATGTTCCAAGTAATATCGTTAATAGTAGTAATAGTTGTAACAAAAGTAAAACTTTTTTGCAACCACAATCTAGCgtaataataaagaaagaagCCCAAAAAATAGATCAACCTAAGAATCAGTCTCAACAAATCTCTAAAATCTCAGTTGTACAAAAAACCAATACAGTAGAATTAGAAGATAAAGATTTTAAtgatggaaataaaaatttaaataatattacaaataacatTTCCATAATTAATGAACCTGTAAaagtaattaaaacaaatcaacaaaGTTGTACAGTTCAACAACCACATTCAACTAACTCAGTTATTTCTcagcaacaacaaaatcaacaatctCAGATTGCACAACAGCAGCCTCAAGTACAATTTCAACAACCATCTCAACAACAACTGCAACATTTATTACCagagaaacaacaacaaaaacaatttccgCAGTCTCAACAACAGTCTATTTCTGTGAATTCAcaaaaattacatcaaaatCAACTTCTTAAAACTCAACCACAATCAATTCAACAAAAACAGCAATCGGAAGTTACACAACATTCGCAGCCGAAAATGATCGGAAATGTTATTATAACGCAACATTCTGGACAAGTAGTTACTAAAACAACAACGATTGGACAAACCCAAATGACAACAACAACTCATGTTCCAAGTAGTGCAGGTGGTTCAACAGCAATAATTAAAAGTCTTCTTGCTAATAAGGTAACAACAActgctaataataataatataacaacctCTAATTTTACTACCGCTTCCACTTCTCAAATTGGTGGAAGCAATGGTAATATATCAACTACATGTGCTGTTGTTAAAGAAACGACTATGAGTGCAGTTAATACAAATAATCCAAATTATTTGATTACTCAAAATGTTAATTTGCATCAGcTTGCGCAAAGACAAAGTttagcaaaacaaaaagaagtCTCAAATCAAAATCTACACGGAACttctttacatttaaataatataagtacaCCACAAAAGCTTTCCACTACAACAATTAGCGCTTTGGTTAATAATCCAATAATCCAGTCTACATCTGTTAAAGTTGGTCAAACCACAATAAAACCAATAAATCCTcattcattagaaaaaaaaactacaatacaGGTACCAGTTGAAAGTATGGATTCATCTAGTTGGGATCCAATGCCACCCTTACCTCCACTTGGTGGTTCAACCGTCCGTTCAATTATTGTACCAGCATCATCTTTATCTACAGCTAGCGAAGATTCATGTAATTCAATTGCATCAAGTGCTCTCAGTACAAGTCATGTACTTTTGAATGATGATGGCGAAAATTCCTTAATTAGTTTTGACGGCTTATTAataccaaaatcaaaatcaaatgcCTCATCTATACTAGAAGATGATAGTTCAAAAGATTCGAATCAAAGAGGATCTCAATTTATTAACGCTAATAAAATGCTGGTAAATCTATTGGATAAAAAATCACCAGATCCTCCTGCACTAACTGTTGGTATTAAAAGGAAACTTATTGATGAtagtaaaaacagaaaaaaacaattgataatcACACAAATTGAAGATTCTGAGACACAAGTAACTCCTTCAAAAAATGCTGCAAATTTATATGCAGAAATGGCTGCATCAATTTTAGAAGATGAAGATTTAGAAGATGTTATTCCGACAAGTAAAATGAATATTCACACAAATTCCTCACCTATCCAAACTATTTCAACGGTCTCtacacaaaaacaacaaatttcacaacaacaacaaacctTACAAAATGTAATACAAAAGTCACAGGAACaacaaaagcaaataataaCAATGCCTTTGCATCGTCAAATAATTGTCTCTCCAAACGTTTCACATCAGCAAGTTATTTTATCTCAAAATCCAATAACGGTACAAGCTTcccaacagcaacaacaaacaataacaaCTTCAAGTCTACAACAAGGAAAAATGAAAACCGATTCAGGACTTCAATCTGTTCCCGTCATTTTACAGAAGCAAATAGCACATGGAGGGCAACAAATTATTCAGCCCGTACTTCAACAACAACCGCAAACACAGACACAATATGTCCTTGCAACTAATCCACAAGGCCAAACATACCTCGTAGCACAACAGACTCATTCACAACCACAACCAACGGTTCTATTAACACAGTCATCTGGTCAGAACCAACAGAGTGGTCCAACgaaaactattattatacttCAACAACAAGGTGGTCCTCCACAAGCTGTTGCTCAGATAACAGAACAATTAATGGGTGCTAGTTCAGGACAACCAAAAATGATAATGACAACTCCACAAGGTCAACAAATGTTCGTTACACAAGTTCCACGTCCTTCAATGCAGCAAATTATTGTTAATCAAGGTGGAAATGTTCTACCGCAGAATGTTGTACTTACACAATCAGTTCACCCACAATCATCCTCCCAACCACAAACTACTATTCAACAAATTCAACAAGCCGCACAGCAATCTCAATTATC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Protein Sequence
MTTTEFKDPAATQNDESQNTTNSTKKRGTRTDVGLQQQPDPETFYKNLIAFNERRNTPIIRMPKISGEDVDLHKLYLEVISRGGWLKVNIRNEWEDVLSDLDFSSRCVNGIVALKQIYYRYLDKYEKVYFLGEDPDRPDEPDDDDRQSRHKKWSEKSTPIIPMSYNYLQHNVTEQTRISNKMSTDLYKNSEYEKLLLSLMSPLPNEQDFAINVCTLMANESKHTLKIENCPKLLDALIAHAGVFCHSTMRELFEEFYTKNRKHQLQTFWNDLLYKIPQILELSYENSAKSIGSSGLRKVQLDCKETFEDGLNAEFDEEFEIENIDFDRLEFLSLGCGLGTREYVGQRVQQIASIMRNLSFFEENITIMAKNRTFIRFLVMCSNIRWSNLHHMALDILGNIATELDLNDPTTDYLTRCLISTLCEGIESQDRGVIISCLEILNKFSQKDTNEDYLLKSINQNIYNHVCLYLSLNDIMLLLYTLECIYSLSSLGSTPCNAFVQVKGIVDTLVSLITVEAQSYGSDGCILMRVVETVPGNMLPMVAQNIANLQNVALAQLKQPQQSQSHLIKTEVTQKVPTLSQNQVPPIINSPVASQQQQPQQMSPNVNTPKQNIQQLQQQPTTQENEQFAISWLTATLENAPSVTNRIEQQDLYKLYSAALVKNGKRGAVTQTLFPRIVRSIFGTNIGPTMLKTTDSAKGSETNMFFYVNLKLRANPIPLKGLSQVSQIQNQQQPGQQNNQLNQITQQSHINQNVLNKPSTPTATSTQNSVSTLSKTQSSNDLVNNSNKEVGSKHETSAKLPTNSPVSSSPLVLQTPNSSCNTNNVNKNLQNVNANVPSNIVNSSNSCNKSKTFLQPQSSVIIKKEAQKIDQPKNQSQQISKISVVQKTNTVELEDKDFNDGNKNLNNITNNISIINEPVKVIKTNQQSCTVQQPHSTNSVISQQQQNQQSQIAQQQPQVQFQQPSQQQLQHLLPEKQQQKQFPQSQQQSISVNSQKLHQNQLLKTQPQSIQQKQQSEVTQHSQPKMIGNVIITQHSGQVVTKTTTIGQTQMTTTTHVPSSAGGSTAIIKSLLANKVTTTANNNNITTSNFTTASTSQIGGSNGNISTTCAVVKETTMSAVNTNNPNYLITQNVNLHQLAQRQSLAKQKEVSNQNLHGTSLHLNNISTPQKLSTTTISALVNNPIIQSTSVKVGQTTIKPINPHSLEKKTTIQVPVESMDSSSWDPMPPLPPLGGSTVRSIIVPASSLSTASEDSCNSIASSALSTSHVLLNDDGENSLISFDGLLIPKSKSNASSILEDDSSKDSNQRGSQFINANKMLVNLLDKKSPDPPALTVGIKRKLIDDSKNRKKQLIITQIEDSETQVTPSKNAANLYAEMAASILEDEDLEDVIPTSKMNIHTNSSPIQTISTVSTQKQQISQQQQTLQNVIQKSQEQQKQIITMPLHRQIIVSPNVSHQQVILSQNPITVQASQQQQQTITTSSLQQGKMKTDSGLQSVPVILQKQIAHGGQQIIQPVLQQQPQTQTQYVLATNPQGQTYLVAQQTHSQPQPTVLLTQSSGQNQQSGPTKTIIILQQQGGPPQAVAQITEQLMGASSGQPKMIMTTPQGQQMFVTQVPRPSMQQIIVNQGGNVLPQNVVLTQSVHPQSSSQPQTTIQQIQQAAQQSQLSPQLHIQQSILNQQNQAQPHIPQLASNGTTLQIQQQTPQQQQASILSQLPQIPATIKLHTPVSNTPVNLKPIQQQNITTKVINKPGTPSISIVAQNQISSQPNTGQSQIIQQIIKPGHKNLNSPLTKVTIQQQQQIIQQTQQNQQQQTIVKSQVITQPQQQSIQKIQTNQIVHKSQINQNQSQTFQQKLQQSNQNQITNSSISQQTQATQMQVPVQQQNIQQQNIQQNIQGQQQNVPIQLQNIQQQNLQQNMQGQQHNMQQQKNQIQQQKPQQSSLQSSTNQHQNIFQQILAQNPSQTQIIQQSSPIQGTNNSIITTHNKSVITNQNSQTKINNLNQQSKLNSNSTQQNNCVSFNQQNGQNQTQQPNSSQSNNNNNSSSTTSRSETSNTTANSSNITSSQNTTLSNAPSPPPPPPIAQKSKSDEDVADIQYLFVCDWRNCPRKKYKSVQEIYKHACQVHCPEGLDPSAEIYCQWGTGPGFCDNIPRKRFSLMTHLLDRHCTLESMKAAVQRRVTMGIQQPTHANPVTIIKSNEARGSTASPALSTSSSGSTPSGAVISAAMHAIKRHSTDFINPKELMDENEGPVTKSIRLTASLILRNLVTYTDKAKRHIRQYEPHLAGVALSNVESSRTISQILFELNN

Similar Transcription Factors

Sequence clustering based on sequence similarity using MMseqs2

100% Identity
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90% Identity
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80% Identity
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