Basic Information

Gene Symbol
Kdm5_1
Assembly
GCA_963942445.1
Location
OZ012682.1:44569068-44584819[+]

Transcription Factor Domain

TF Family
ARID
Domain
ARID domain
PFAM
PF01388
TF Group
Helix-turn-helix
Description
This domain is know as ARID for AT-Rich Interaction Domain [2], and also known as the BRIGHT domain [1].
Hmmscan Out
# of c-Evalue i-Evalue score bias hmm coord from hmm coord to ali coord from ali coord to env coord from env coord to acc
1 2 2.8e-24 1.6e-20 74.4 0.0 2 89 288 371 287 371 0.95
2 2 5.4 3.1e+04 -3.4 0.0 54 81 1203 1231 1198 1232 0.62

Sequence Information

Coding Sequence
ATGACACCTTCACCTAGTAAAGTTTTAAGTCAAAGTTCTGTTGTTGCTAGCAATAGTACAGcagcagcaacagcaacaacaacaatagcgGAACCTGAAGGATCAATAACATTAATAGAATCAGAAACCGAAAATGAAACAGAAATAATTTCATTACCAACAATTGATTTAACGTCATCATCATTAAATCAAATATCACCAGAAAAAGATATTGAagaaataataaataaaattacaactaCTACCACTACTACTACAACTACTATTACTGGTGCTACTACTACAGCTCAGCCATCAGaagaaacaataaatttatcttataattcaGACACCTTAAGTTGTAATGGTAGTCCTATAATACAAACGATAACATcaccattgaaaaaaaataatgataacaatcagaacaatattataaatttaccaaattctaatagtaataatgataatcaggataatattataaatttaccaaattctaatattaataatataaataataacagtaataataataataatagcagtaataatcatttaaataataataatggtaatactACTACTACAAATGGCTCAAAGCAAAATTATCCTCATAGTTCatcaacattttcattaaataaaaatgaagaatttcattttatcaaacCATCCGAATGTCCAGTATTTTCACCGACtgaagaagaatttaaaaatcccCTAGCATATATTGGTAAAATTAGATCATTTGCTGAAAAATATGGTATAGCAAAAATTCTACCGCCAaagTCATGGACACCACCATTCACAGTCGACGTAGATAAACTGAAATTTACACCAAGAGTTCAACGTTTAAATGAGTTAGAAGCTAAAACAcgtgttaaattaaattttttagatcaaATTGCCAAATTTTGGGAATTACAAGGTTCATCACTTAAAATTCCAATGGTAGAAAGAAAAGCATTAGATTTATATAGTTTACATCGTATTGTTCAAGAAGAAGGTGGTATTGAACAAACAACAAAGGAACGTAAATGGTCTAGAGTTGCTACACGTATGGGTTATCCATCTGGTAAAAGTATTGGAGCAATATTAAAAGGTCATTACGAAAGAATATTAAACCCATTTGATATATTTACATCTGGCAAAACTGTTGATATAAAATTAGAGACTGAAATTGATGATCAAGATTATAAACCACATGGTATTGTATCAAGACAACAAATTACACCACCAAATGAAACGACTGCACGTCGGTCGAAACGTTTTGCTAATGCAACTCAAGCAACATGTGGCTTAGGTTTAAATAGTACTAATAATCATTGCCCACCAATTTCATCAATTAATAATTCACAATTAGCTggtgataataaattaacaaatattaataacaatacaCAAAATGTATGCgtaaataataatggaaatgaTAATATTACTAGTACACCAATTTCACCAtcaaaagaagaaattaaagaTGAATATAATTCAATTGGATATGGTGAATATAAACGTATGCATTCATATGGTTTTGGAGGTAAAATGGCAATTGGTGGTTGTGGTCGTAATCGGAAATCAGTACATACAACAACATTGAATGCTAGcatgaaaagaaaacaaaaaaaaaatgatccattatcaaaatatatatgccATTTTTGCAATCGTGGTGATGCTGAAGAAAATATGTTACTTTGTGATGGATGTGATGATAGTTatcatacattttgtttaatgCCACCATTAAGTGATATACCAAAAGGTGATTGGCGTTGTCCAAAATGTGTTGTTGAAGAAGTCAGTAAACCACAGGAAGCATTTGGTTTTGAACAGGCCCAACGTGAATATACTTTACAACAGTTTGGTGAAATGGCTGATCAATTTAAAgcagattattttaatatggcTGTACATTTGGTACCAACTGAATTAGTCGAACGTGAATTTTGGCGTATTGTTTCATCAATTGATGAAGATGTTACGGTTGAATATGGAGCTGATTTGCATTCAATGGATCATGGTTCTGGATTTCCAACAAAatcttcattatatttattaccaGGTGATCAGGAATATGCAGAATCAAGTTGGAATTTGAACAATTTACCAATATTAGAAGAGTCAATATTAGGTCATATTAATGCCGATATTAGTGGTATGAAAGTACCTTGGATGTATGTTGGAATGtgttttgcaacattttgttggCATAACGAAGACCATTGGAGCTATTcgattaattatttacattggGGAGAACCTAAAACATGGTATGGTGTTCCAGGTTCAAAGGCTGAGGAATTTGAAGAAACAATGAAATCTGCTGCACCAGAATTATTCCATTCACAACCAGATTTGTTACACCAATTGGTTACAATAATGAATCcaaatatattaatgaaaaatgatGTACCTGTTTATAGAACAGATCAGCATGCTGGTGAGTTTGTTATAACTTTTCCACGTGCATATCATGCCGGTTTTAATCAAGGTTATAATTTTGCTGAAGCTGTAAATTTTGCTCCAGCAGATTGGATGAAAATGGGTCGAGAATGTATCAATCATTATTCAATGCTAAGGAGATTTTGTGTCTTTTCTCATGATGAATTAGTTTGTAAAATGGCACTTAATCCAGATAAATTGAATTTAGGAATTGCAACTGCTTGTTATTTAGATATGGCTGAAATGGTTGATACagagaaaaaattaagaaaatcttTATTAGAGTGGGGCGTTACAAAAGCAGAACGTGAAGCATTTGAATTAATTCCAGATGATGAAAGGCAGTGTGATTCATGTAAAACAACATGCTTTTTATCAGCAGTAACATGCTCTTGCACAAAATCAATTGTATGTTTAAGACATTATACAGAGTTATGTAATTGTCCACCTGAAAAACACACTTTACAGTATCGTTATACTTTAGATGAGTTACCTTTAATGTTGAAAAAACTTAAAGTTAAAGCTGAAACTTTTGAAAATTGGTTGTCTAAAGTACGTGATGTCTTATACCCAAATGCATCAACAAATATAACATTAGaggaattacaaaatttgactCAGGAAGCTGAAGAAAAGAAATTTCCATCATCTGTTATATTAGAACGATTAAACTCAGCTGTATTAGAAGCTGAAAAATGTGTTACCGTTATTCAGCAattagatattaataaaatgcgTACCAGAACACGAAATTCAATTGAATCagctaaatataaattaaccaTGGATGAATTAGATTTATTTGTACAAGAAATAGATAATCTGTGTTGTGTTATACAAGAAGGACAGAGCGTACGAGACTTACAATTATTAGGACGAGACTTTATTGAATCATCAAAAcacattttatcaaaaaaattaaataaagttaatgagACTGATTTGGAACAATTAATTGAAGAAGGTTCAGTGCTTTGCATTGATTTACCTGAAATGGAACGTTTAAAATGTAGATTAGGGCAATTAAAATGGTATAAAAGAATTCGTGAATATCgtgattcaaatgaaaaaatgtcTTTGAATGATATAcataattttctaaaagaagGATTAAATATATTACCAGATTACTTTATTGAAAAAGAATTagttcatttacaaaaaattgttttagcaATTGAATATTGGGAAGAAGTTGCGAAAAAATGTTTTGAGAGTGGTACTCAACATGAGTTACCAGAAATTGAAGTACTTTTAGAAAGAGCATATGATATCGAAGGTGAACTTCCATCAGAGCCAGCACTTCGTGATGCAGTTAGAAAAGCTAAAGAATGGTTACATAATGTAGGAGTTTTgcaatcaaatgaaaattatccTTATTTTCATACACTTGAAAATGTTGTTAATCGTGGTAAAAATATTCCGTTTCATCTCGAAGAATTAAAACGAATGGAAGAGCATTTGGATGCTGCAAGAAGTTGGAAAGACAAAACagctaaaacatttttgaaaaaacaaacacaatttcaTTTAATGGATGTTTTATCACCAAGATCGGAAGCAGTAATGATTGGAagtcgatttaaaaaaaaatctcctgAAGATCAATTTACTGAAGATGTTACACCTCAACAAATGGTAAATCAGTTCAAATTGGCTGAAGAAAAAGAGATGATGGATATGCGTgagttaagaaaattaaatatggaaaaaactcCACTAGAAGATAAATACTGTATAtgtaagagaaaatttaatggTAATATGTTTAATTGTCAATTATGTAAGGATTGGTTCCATGAACAATGTGTACCTCCACCAAAAAATACTGTACGTCCGAGACCACAAAATTCAACTACTCCACCAGGTGGTAGTAACACACCACACATACCACATGTAAATTATCGGGAAAAAGATCGTGAGCTAAAATATCTATGTCCATCATGTATGCGTTCACGACGTCCTCGTTTagaaacaattttgcaattattaGTATCATTACAACGTTTACCGATTCGATTGCCAGAAGGTGAGGCATTACAGTGTTTAACCGAAAGAGCCATGAATTGGCAAGATCGTGCAAGACAAGCCTTCGCATCAGAAAATGTCACTActgttttaacaaaattatcattgttatcacaaaaatttgatgaaaattctAAAGGgacatcaaataaaaatgaagaaaattgtgGAACAAAAATTCAGAGTggcaataaaaagaaatttgatggtaaaaaatatagtaataacaATGGGAATTCTCTCAGTAATAGTAACTGCAATGACGTTAATAGAACTAAGAGAAGACACCAAGCAAAAAGTCCAGTGACTAAAAACTCTATTACCTCAGAAGATGATGAAGTTGATGAATCCAGTTCTGAAGAAGAATTTCGTCAACTAAAAATAAGTGAAAGTATAATTTCTGCTATTGTATCTCAATCAAAATGTGAAAGTCCAGCATCACCAACTAATGTCAATATATCAAGCCCAATAACAGTAGTAGATAATTGCGGTAATACCTTAGCGAAAACAGATATGCCTctaataaatttagataaaataactCGTGAAAAGCTGGAAGATTTAATGATGGAGGGAGATTTACTTGAAGTTTCTTTAGATGAAACATTAcatttatggaaaattttaaatgcagCTAAACCATCAATTTCTGATTTAGCACATAtcaactataaatataatttaacgcaaatttctaataatattctaGTCATGAACAATGCGTCAGTAAGCAAAAAACGTCGATCAGCGGACGATTCTGGTAATGTgccgacaaaaaaaaatacaaatgCAAAAAGTAATGCATTACTTACCACATTACAGCAAACGATTTCACAATCTGAGttagtaacaaaattaaaacgcGGTCGGAAGTTTAAAAAGTTACCTAAAATTGCATTACCTAGTGATAGTGCAGATCAAATATCTAGTGGAAATAATAGCCCTGATATTGATTCATCTGCACTCTTGTCTGGATCTCCTGGCCCTAAtacaaatagtaataataatatttcagcAATTGTTTCATTAACATTATCTACACCAGAACTCACTACAAGTACAACATCAATAACatcaactacaacaacaacgaacatagcagcaacaacaacaaccataGTAACGCAAACAACAACACTAACACCAAAAACAATTCAAGAAAAAGATACACCTGTTGGTATTATGAATTTAAGTggtaaaaaacgaaaacgtGCTTATGTTGGTAATGTAACTAGTAAAAAAGCTGCAGCGACTGCTGCAGCTGCTGCGGCTCAAGCTCAATTAGATCAAATAGCAGCTATAGCTACTACAGCAGCATCAACatctgatgatgatgaagaatgTAGTGCGCCGAATTGTGCTAGACCTTCAGGTCGTGAAGTAGATTGGGTACAGTGCGATGGCGGTTGTAATAAATGGTTCCATATGTTTTGTGTTGGTTtagacaaaaatgaaattaaaccaGATGATGATTATATTTGTAAGCGATGTAAAAAAACAACTCATAAGTCTAGTGGTAGTATTTCAACAACTCCAACTAATTTAATTACTTCGTCtacaacaataaatatattaaatgcgGCAACAACTAACGAAACTGCAACAACAATGGATATAACCGGTTTAACAGCAATGATAACTACAACCACAACATCAACAGCAAGAATAAGTGAAACGACAACACCTGTGTtagatattgtaaataatactgataataataacgaagataataataataacaataataataatagtgataatagtaataataatgatattagtaataatattaataatattgatagtaataatagtaatagtattgataataataacgataatagtaataatagtagtaataattcaaataactcagcaattgataataaaaagaatgGCCACGATATTGATGATGTCACTAGAGCCAATAACGACAACATTGATAATTATGATGACAAAAATGAAAAGTCAATTGAAATTGTTAGTAGTAGAAGTAATGGTGGTAGTATTATCCAATTTGTAACAGAATCTGATTCTAAAAACATCttacaaacataa
Protein Sequence
MTPSPSKVLSQSSVVASNSTAAATATTTIAEPEGSITLIESETENETEIISLPTIDLTSSSLNQISPEKDIEEIINKITTTTTTTTTTITGATTTAQPSEETINLSYNSDTLSCNGSPIIQTITSPLKKNNDNNQNNIINLPNSNSNNDNQDNIINLPNSNINNINNNSNNNNNSSNNHLNNNNGNTTTTNGSKQNYPHSSSTFSLNKNEEFHFIKPSECPVFSPTEEEFKNPLAYIGKIRSFAEKYGIAKILPPKSWTPPFTVDVDKLKFTPRVQRLNELEAKTRVKLNFLDQIAKFWELQGSSLKIPMVERKALDLYSLHRIVQEEGGIEQTTKERKWSRVATRMGYPSGKSIGAILKGHYERILNPFDIFTSGKTVDIKLETEIDDQDYKPHGIVSRQQITPPNETTARRSKRFANATQATCGLGLNSTNNHCPPISSINNSQLAGDNKLTNINNNTQNVCVNNNGNDNITSTPISPSKEEIKDEYNSIGYGEYKRMHSYGFGGKMAIGGCGRNRKSVHTTTLNASMKRKQKKNDPLSKYICHFCNRGDAEENMLLCDGCDDSYHTFCLMPPLSDIPKGDWRCPKCVVEEVSKPQEAFGFEQAQREYTLQQFGEMADQFKADYFNMAVHLVPTELVEREFWRIVSSIDEDVTVEYGADLHSMDHGSGFPTKSSLYLLPGDQEYAESSWNLNNLPILEESILGHINADISGMKVPWMYVGMCFATFCWHNEDHWSYSINYLHWGEPKTWYGVPGSKAEEFEETMKSAAPELFHSQPDLLHQLVTIMNPNILMKNDVPVYRTDQHAGEFVITFPRAYHAGFNQGYNFAEAVNFAPADWMKMGRECINHYSMLRRFCVFSHDELVCKMALNPDKLNLGIATACYLDMAEMVDTEKKLRKSLLEWGVTKAEREAFELIPDDERQCDSCKTTCFLSAVTCSCTKSIVCLRHYTELCNCPPEKHTLQYRYTLDELPLMLKKLKVKAETFENWLSKVRDVLYPNASTNITLEELQNLTQEAEEKKFPSSVILERLNSAVLEAEKCVTVIQQLDINKMRTRTRNSIESAKYKLTMDELDLFVQEIDNLCCVIQEGQSVRDLQLLGRDFIESSKHILSKKLNKVNETDLEQLIEEGSVLCIDLPEMERLKCRLGQLKWYKRIREYRDSNEKMSLNDIHNFLKEGLNILPDYFIEKELVHLQKIVLAIEYWEEVAKKCFESGTQHELPEIEVLLERAYDIEGELPSEPALRDAVRKAKEWLHNVGVLQSNENYPYFHTLENVVNRGKNIPFHLEELKRMEEHLDAARSWKDKTAKTFLKKQTQFHLMDVLSPRSEAVMIGSRFKKKSPEDQFTEDVTPQQMVNQFKLAEEKEMMDMRELRKLNMEKTPLEDKYCICKRKFNGNMFNCQLCKDWFHEQCVPPPKNTVRPRPQNSTTPPGGSNTPHIPHVNYREKDRELKYLCPSCMRSRRPRLETILQLLVSLQRLPIRLPEGEALQCLTERAMNWQDRARQAFASENVTTVLTKLSLLSQKFDENSKGTSNKNEENCGTKIQSGNKKKFDGKKYSNNNGNSLSNSNCNDVNRTKRRHQAKSPVTKNSITSEDDEVDESSSEEEFRQLKISESIISAIVSQSKCESPASPTNVNISSPITVVDNCGNTLAKTDMPLINLDKITREKLEDLMMEGDLLEVSLDETLHLWKILNAAKPSISDLAHINYKYNLTQISNNILVMNNASVSKKRRSADDSGNVPTKKNTNAKSNALLTTLQQTISQSELVTKLKRGRKFKKLPKIALPSDSADQISSGNNSPDIDSSALLSGSPGPNTNSNNNISAIVSLTLSTPELTTSTTSITSTTTTTNIAATTTTIVTQTTTLTPKTIQEKDTPVGIMNLSGKKRKRAYVGNVTSKKAAATAAAAAAQAQLDQIAAIATTAASTSDDDEECSAPNCARPSGREVDWVQCDGGCNKWFHMFCVGLDKNEIKPDDDYICKRCKKTTHKSSGSISTTPTNLITSSTTINILNAATTNETATTMDITGLTAMITTTTTSTARISETTTPVLDIVNNTDNNNEDNNNNNNNNSDNSNNNDISNNINNIDSNNSNSIDNNNDNSNNSSNNSNNSAIDNKKNGHDIDDVTRANNDNIDNYDDKNEKSIEIVSSRSNGGSIIQFVTESDSKNILQT

Similar Transcription Factors

Sequence clustering based on sequence similarity using MMseqs2

100% Identity
-
90% Identity
-
80% Identity
-