Agly019182.1
Basic Information
- Insect
- Aphis glycines
- Gene Symbol
- mybA
- Assembly
- GCA_009928515.1
- Location
- scaffold:284825-289966[-]
Transcription Factor Domain
- TF Family
- MYB
- Domain
- Myb_DNA-binding domain
- PFAM
- PF00249
- TF Group
- Helix-turn-helix
- Description
- This family contains the DNA binding domains from Myb proteins, as well as the SANT domain family [1].
- Hmmscan Out
-
# of c-Evalue i-Evalue score bias hmm coord from hmm coord to ali coord from ali coord to env coord from env coord to acc 1 7 6.6 6.4e+03 -2.5 0.1 1 17 205 221 205 222 0.82 2 7 0.0016 1.5 9.1 0.0 22 44 289 310 275 312 0.91 3 7 4.9e-11 4.8e-08 33.1 0.6 4 46 321 365 318 365 0.97 4 7 8.7e-08 8.4e-05 22.7 0.2 1 44 371 420 371 422 0.90 5 7 0.061 59 4.0 0.0 25 45 451 471 440 472 0.83 6 7 3.1e-11 3e-08 33.7 0.1 1 43 480 525 480 527 0.93 7 7 7.6 7.4e+03 -2.7 0.1 4 16 773 786 772 789 0.74
Sequence Information
- Coding Sequence
- ATGGACGCATATGGTAACCCAATTCCTGGACCATCAAGAGAATTTGTAAATATAGAAACTACTGAATCAACAGCTGCTTATGACTTTATACGGTTAGAAAATGAATTTAACAATGATGATACTAATGAAGATTCAAAAGTTCAAATAAATATATTTAAAAATTTGAATAAAAATGACAGTTATAAATTTGAACCAATTGAAACAAATCCTAGTATTCAAGATTTTTTTGAAAAAATTGATTGCATAGATTTTAATCAAGATGATATCGAACAAAATAAATATTATCTTACAGAGTTATTAGAACAATGTAATAATTTCATTGATATTTTAGGCCGTAATATAGTTTATTTAGAAGAAATAATGATTGAAATTCATAGAAATATTGACATTTCAAAAAGAAATGTAACCAAAGCTTTAACTTGCATAAAGTTTGAAAAAAATTATATGTCTAAAGTTAAAATGAAACATTTGAAAATTAAAGCACACTTGGCAAACTTTTTTAAAATTGGTTTAGTAAGCTGCCCACAGAATCCTCATCTTAAGGAGTTATACGAAACTGAAAAATTAATGTTATCGTACAATGGACGTTTTATATTTGAAGAATGTATTGAAAGGAATCGATGGGATCAAGAGTTTAAAAATAAACTGGAAAAAGCAATACATACTGAAGTATTAAATAAATTAAAAATTCCTATGCTTGAACAGCACTTCCGTCTTAGTATAGATGGAAATAAACAAACTAATCCAATTATTAAACAAAAAATTGAAATTGAAATGTTAGACCTAGAAAAAGAATTAGATATTATAGCGAAAACACCATTTAAGCAGTTAGTCTTTCAGTTTATGGATTCAGACACAAAGTATGATTGGCTACACATTGCAAAAGAAGTTGATAAACCTGATATACAATGTAAAAGGTTTTGGAATTTAATTTTAAAACCTCCCATATCTAGAGCTATATGGACTAAAAGTGAAGTTGACCGTTTAATTCAAATTGTTGCAAAAAATGAGGAAAAAAATTGGCAAAAAATAGCTGATGAATTAGATATTAACCGTAATGCGTTACAATGTTTTGTTCATTATCAAAAATATAAAAAAAAGATTCACACAAGAGGTAAATGGACAAAAGAAGAAGATCAGAAACTTGTAGAGATAATTAAGAAAAACTCAATAGATAATATCATCAATTGGCAAAGAGTATATTTTGCTATGCAAGATAATAATAGAAATGTTTATCAAATCTACTGCAGATACATGCAAAGTTTAAAACCAGGCATCAAGAAAGGGTTTTTGACTGATAATGAAAAATTTATTATTAAACAAGCTAAAATCCAAAATATACCCCCATCGATAGTATCAATGAATCTAACTAATCGAACTCCTACACAAGTTCGTAATGCTTATCGTAGAATTTTATTAAACAATGAAGATATTTATAGAGGTGGTTGGTCAGCTGAAGAAGATAAAATGTTAATGTGTGCTGTAAATTCTTTTGTACCTAATGAATTTAGTTGGACACAAATATCTCAACAGGTGCCTAAGCGTAATGAAGAACAATGCCGTCATAGATTTAAATTAATTGAAAAAAAATTAAAAATTAATCCAAATTTAGATGTTGATGATCTTTCACGCCCATTCCAATCTTACAAGTATAAAGAATTAGCTTTTTTTCCAGAAGATGAATTAAATTTTGATTTACAAAAAAAATTTAAACTCAATCGCCAATTTCTTAAAACATCTAATATGCCAATGGAAACAATTGCCGATCTCAAGGTGAAGAGAGCATACTTGGAAAATAATTTCGTTATTAACAATTGCAATATGTCTAGTAAATGTGATCTCTACAAACACATACTTGATTATTTGGGAGCTAATTTGGTTGCACCTAATACGTTTACCCACTCAGATGATTTGATTGATGCTGGACTTATGAGCATGATGTCGTATATACAAGAGTATTCCATTGATGTAATGACTTTAGATCCTAGTAAGGTGGAGCATAATTTGTGTAACCCACTATTAACCCACGAAGGAGTTCACAATGTCTTGAAAACAAGTGATATAATAAATTCTGATCTAAGTGAAATAGAAGGTTTATTAGACATTAGAATAAAAAATATTCATAAGGAACAACCAAAAGAAGATTTAAATTTAAATAATTCTACTAAAAAAATAAAAGATCCACTACTACCTCTACAGTTCATTGGTTCTGTACCACCAAATTATGAGACTTTTAAAATCTTGTATGCATATGAAAATTCTTTAACTTCATTGATGAAAATCGATCACTGTAAAGATTCCAATATGGATTTTGATTGGGATGACGAAGAATCTATGAAATTACAGAAACGCCTTGTCGCCATGTTAAGGTTACCAACATTATTTTCTAATTTGATACCTTACAATGCAGCAAACATAAATATGCTTGTAAATGCTGACAAAGTTAATAAGGAAGAGATAAAAATAGTACCGTCTTCAAATTATTCTAAAGTTAATTATGCACACCCTAAAAATAAAAAATACAATTTCAAGTTTAAAAGTTTTTTATAA
- Protein Sequence
- MDAYGNPIPGPSREFVNIETTESTAAYDFIRLENEFNNDDTNEDSKVQINIFKNLNKNDSYKFEPIETNPSIQDFFEKIDCIDFNQDDIEQNKYYLTELLEQCNNFIDILGRNIVYLEEIMIEIHRNIDISKRNVTKALTCIKFEKNYMSKVKMKHLKIKAHLANFFKIGLVSCPQNPHLKELYETEKLMLSYNGRFIFEECIERNRWDQEFKNKLEKAIHTEVLNKLKIPMLEQHFRLSIDGNKQTNPIIKQKIEIEMLDLEKELDIIAKTPFKQLVFQFMDSDTKYDWLHIAKEVDKPDIQCKRFWNLILKPPISRAIWTKSEVDRLIQIVAKNEEKNWQKIADELDINRNALQCFVHYQKYKKKIHTRGKWTKEEDQKLVEIIKKNSIDNIINWQRVYFAMQDNNRNVYQIYCRYMQSLKPGIKKGFLTDNEKFIIKQAKIQNIPPSIVSMNLTNRTPTQVRNAYRRILLNNEDIYRGGWSAEEDKMLMCAVNSFVPNEFSWTQISQQVPKRNEEQCRHRFKLIEKKLKINPNLDVDDLSRPFQSYKYKELAFFPEDELNFDLQKKFKLNRQFLKTSNMPMETIADLKVKRAYLENNFVINNCNMSSKCDLYKHILDYLGANLVAPNTFTHSDDLIDAGLMSMMSYIQEYSIDVMTLDPSKVEHNLCNPLLTHEGVHNVLKTSDIINSDLSEIEGLLDIRIKNIHKEQPKEDLNLNNSTKKIKDPLLPLQFIGSVPPNYETFKILYAYENSLTSLMKIDHCKDSNMDFDWDDEESMKLQKRLVAMLRLPTLFSNLIPYNAANINMLVNADKVNKEEIKIVPSSNYSKVNYAHPKNKKYNFKFKSFL
Similar Transcription Factors
Sequence clustering based on sequence similarity using MMseqs2
- 100% Identity
- iTF_00972975;
- 90% Identity
- iTF_00136064;
- 80% Identity
- -