Basic Information

Gene Symbol
mybA
Assembly
GCA_009928515.1
Location
scaffold:284825-289966[-]

Transcription Factor Domain

TF Family
MYB
Domain
Myb_DNA-binding domain
PFAM
PF00249
TF Group
Helix-turn-helix
Description
This family contains the DNA binding domains from Myb proteins, as well as the SANT domain family [1].
Hmmscan Out
# of c-Evalue i-Evalue score bias hmm coord from hmm coord to ali coord from ali coord to env coord from env coord to acc
1 7 6.6 6.4e+03 -2.5 0.1 1 17 205 221 205 222 0.82
2 7 0.0016 1.5 9.1 0.0 22 44 289 310 275 312 0.91
3 7 4.9e-11 4.8e-08 33.1 0.6 4 46 321 365 318 365 0.97
4 7 8.7e-08 8.4e-05 22.7 0.2 1 44 371 420 371 422 0.90
5 7 0.061 59 4.0 0.0 25 45 451 471 440 472 0.83
6 7 3.1e-11 3e-08 33.7 0.1 1 43 480 525 480 527 0.93
7 7 7.6 7.4e+03 -2.7 0.1 4 16 773 786 772 789 0.74

Sequence Information

Coding Sequence
ATGGACGCATATGGTAACCCAATTCCTGGACCATCAAGAGAATTTGTAAATATAGAAACTACTGAATCAACAGCTGCTTATGACTTTATACGGTTAGAAAATGAATTTAACAATGATGATACTAATGAAGATTCAAAAGTTCAAATAAATATATTTAAAAATTTGAATAAAAATGACAGTTATAAATTTGAACCAATTGAAACAAATCCTAGTATTCAAGATTTTTTTGAAAAAATTGATTGCATAGATTTTAATCAAGATGATATCGAACAAAATAAATATTATCTTACAGAGTTATTAGAACAATGTAATAATTTCATTGATATTTTAGGCCGTAATATAGTTTATTTAGAAGAAATAATGATTGAAATTCATAGAAATATTGACATTTCAAAAAGAAATGTAACCAAAGCTTTAACTTGCATAAAGTTTGAAAAAAATTATATGTCTAAAGTTAAAATGAAACATTTGAAAATTAAAGCACACTTGGCAAACTTTTTTAAAATTGGTTTAGTAAGCTGCCCACAGAATCCTCATCTTAAGGAGTTATACGAAACTGAAAAATTAATGTTATCGTACAATGGACGTTTTATATTTGAAGAATGTATTGAAAGGAATCGATGGGATCAAGAGTTTAAAAATAAACTGGAAAAAGCAATACATACTGAAGTATTAAATAAATTAAAAATTCCTATGCTTGAACAGCACTTCCGTCTTAGTATAGATGGAAATAAACAAACTAATCCAATTATTAAACAAAAAATTGAAATTGAAATGTTAGACCTAGAAAAAGAATTAGATATTATAGCGAAAACACCATTTAAGCAGTTAGTCTTTCAGTTTATGGATTCAGACACAAAGTATGATTGGCTACACATTGCAAAAGAAGTTGATAAACCTGATATACAATGTAAAAGGTTTTGGAATTTAATTTTAAAACCTCCCATATCTAGAGCTATATGGACTAAAAGTGAAGTTGACCGTTTAATTCAAATTGTTGCAAAAAATGAGGAAAAAAATTGGCAAAAAATAGCTGATGAATTAGATATTAACCGTAATGCGTTACAATGTTTTGTTCATTATCAAAAATATAAAAAAAAGATTCACACAAGAGGTAAATGGACAAAAGAAGAAGATCAGAAACTTGTAGAGATAATTAAGAAAAACTCAATAGATAATATCATCAATTGGCAAAGAGTATATTTTGCTATGCAAGATAATAATAGAAATGTTTATCAAATCTACTGCAGATACATGCAAAGTTTAAAACCAGGCATCAAGAAAGGGTTTTTGACTGATAATGAAAAATTTATTATTAAACAAGCTAAAATCCAAAATATACCCCCATCGATAGTATCAATGAATCTAACTAATCGAACTCCTACACAAGTTCGTAATGCTTATCGTAGAATTTTATTAAACAATGAAGATATTTATAGAGGTGGTTGGTCAGCTGAAGAAGATAAAATGTTAATGTGTGCTGTAAATTCTTTTGTACCTAATGAATTTAGTTGGACACAAATATCTCAACAGGTGCCTAAGCGTAATGAAGAACAATGCCGTCATAGATTTAAATTAATTGAAAAAAAATTAAAAATTAATCCAAATTTAGATGTTGATGATCTTTCACGCCCATTCCAATCTTACAAGTATAAAGAATTAGCTTTTTTTCCAGAAGATGAATTAAATTTTGATTTACAAAAAAAATTTAAACTCAATCGCCAATTTCTTAAAACATCTAATATGCCAATGGAAACAATTGCCGATCTCAAGGTGAAGAGAGCATACTTGGAAAATAATTTCGTTATTAACAATTGCAATATGTCTAGTAAATGTGATCTCTACAAACACATACTTGATTATTTGGGAGCTAATTTGGTTGCACCTAATACGTTTACCCACTCAGATGATTTGATTGATGCTGGACTTATGAGCATGATGTCGTATATACAAGAGTATTCCATTGATGTAATGACTTTAGATCCTAGTAAGGTGGAGCATAATTTGTGTAACCCACTATTAACCCACGAAGGAGTTCACAATGTCTTGAAAACAAGTGATATAATAAATTCTGATCTAAGTGAAATAGAAGGTTTATTAGACATTAGAATAAAAAATATTCATAAGGAACAACCAAAAGAAGATTTAAATTTAAATAATTCTACTAAAAAAATAAAAGATCCACTACTACCTCTACAGTTCATTGGTTCTGTACCACCAAATTATGAGACTTTTAAAATCTTGTATGCATATGAAAATTCTTTAACTTCATTGATGAAAATCGATCACTGTAAAGATTCCAATATGGATTTTGATTGGGATGACGAAGAATCTATGAAATTACAGAAACGCCTTGTCGCCATGTTAAGGTTACCAACATTATTTTCTAATTTGATACCTTACAATGCAGCAAACATAAATATGCTTGTAAATGCTGACAAAGTTAATAAGGAAGAGATAAAAATAGTACCGTCTTCAAATTATTCTAAAGTTAATTATGCACACCCTAAAAATAAAAAATACAATTTCAAGTTTAAAAGTTTTTTATAA
Protein Sequence
MDAYGNPIPGPSREFVNIETTESTAAYDFIRLENEFNNDDTNEDSKVQINIFKNLNKNDSYKFEPIETNPSIQDFFEKIDCIDFNQDDIEQNKYYLTELLEQCNNFIDILGRNIVYLEEIMIEIHRNIDISKRNVTKALTCIKFEKNYMSKVKMKHLKIKAHLANFFKIGLVSCPQNPHLKELYETEKLMLSYNGRFIFEECIERNRWDQEFKNKLEKAIHTEVLNKLKIPMLEQHFRLSIDGNKQTNPIIKQKIEIEMLDLEKELDIIAKTPFKQLVFQFMDSDTKYDWLHIAKEVDKPDIQCKRFWNLILKPPISRAIWTKSEVDRLIQIVAKNEEKNWQKIADELDINRNALQCFVHYQKYKKKIHTRGKWTKEEDQKLVEIIKKNSIDNIINWQRVYFAMQDNNRNVYQIYCRYMQSLKPGIKKGFLTDNEKFIIKQAKIQNIPPSIVSMNLTNRTPTQVRNAYRRILLNNEDIYRGGWSAEEDKMLMCAVNSFVPNEFSWTQISQQVPKRNEEQCRHRFKLIEKKLKINPNLDVDDLSRPFQSYKYKELAFFPEDELNFDLQKKFKLNRQFLKTSNMPMETIADLKVKRAYLENNFVINNCNMSSKCDLYKHILDYLGANLVAPNTFTHSDDLIDAGLMSMMSYIQEYSIDVMTLDPSKVEHNLCNPLLTHEGVHNVLKTSDIINSDLSEIEGLLDIRIKNIHKEQPKEDLNLNNSTKKIKDPLLPLQFIGSVPPNYETFKILYAYENSLTSLMKIDHCKDSNMDFDWDDEESMKLQKRLVAMLRLPTLFSNLIPYNAANINMLVNADKVNKEEIKIVPSSNYSKVNYAHPKNKKYNFKFKSFL

Similar Transcription Factors

Sequence clustering based on sequence similarity using MMseqs2

100% Identity
iTF_00972975;
90% Identity
iTF_00136064;
80% Identity
-