Agif011050.1
Basic Information
- Insect
- Aphidius gifuensis
- Gene Symbol
- CSRNP3
- Assembly
- GCA_014905175.1
- Location
- CM026521.1:7398061-7401548[+]
Transcription Factor Domain
- TF Family
- CSRNP_N
- Domain
- CSRNP_N domain
- PFAM
- PF16019
- TF Group
- Unclassified Structure
- Description
- This presumed domain is found at the N-terminus of cysteine/serine-rich nuclear proteins. These proteins act as transcriptional activators [1].
- Hmmscan Out
-
# of c-Evalue i-Evalue score bias hmm coord from hmm coord to ali coord from ali coord to env coord from env coord to acc 1 6 0.031 3.5e+02 0.3 1.2 59 139 48 125 22 135 0.45 2 6 0.27 3.1e+03 -2.8 0.8 84 103 228 247 191 292 0.48 3 6 0.27 3.1e+03 -2.8 0.2 45 103 254 311 243 332 0.40 4 6 1.1e-98 1.2e-94 315.6 4.7 1 218 488 698 488 698 0.91 5 6 0.43 4.9e+03 -3.4 0.8 86 117 737 767 699 794 0.42 6 6 0.017 2e+02 1.1 8.3 36 115 846 922 815 937 0.47
Sequence Information
- Coding Sequence
- ATGGAATCGACTTTAGCTTGTCCGTCAAAGTCAGAAAATACTAATGACCAAGAAGAATTCACCTCAGTGAAtttaccaacaacaacaacaacaacaacaataaatttggaaaatttacaagaaaatattaataatgaaattagtAATAATGTTAATGAATTATCATCAGAGCCAAGCAATCATCATGacgaaaatattaatgaaaataatatcaaggtgacaaatattgataaatcattattgtCAACAATTAATGCAataagtgatgatgatgatgatgataataatattagtaaaagtgatgatttttcaacaataaataatacagaATTAAAAGTAATTGGTGTTGAAATATCTGATGaagaaattaaacaattaaaaaatgatatacatAGATTATCACCAGTATCAGTTAGTCTTCATGAACGAACACTtggtgaaatattattaacatcagaaactggtggtggtggtggcaaTGGTGATGGTTGTAAagatgatggtggtgatggtgttattgaaaatgaattaaatataaataataaaaatattaatagtgaaaatattataaataatattgataaatttgaaattaataattacaataatattaatgatagtaataatgaaaatataaatgatacaaaattaatatgtcaACAAAAAGAATTAATGCTTATATTATCAAgagttgatgataataaaaaaacgaatcAACAAATTGATGATACAGAAGCAACAACAAgtgaaataaatgtttttaatttatcaccaaAATATATGGAAAATGATCAATTAAGTCGTAAAAGTCCAATGgttgttattgataaaatgaatcatttaaataaacaaataattacaagaaaattaaataatgaatatgacGATAATGATGGTGCTGATAATGatgtaaaaattgataataatttagaaaaaacaaatgaattaaataatgaatatattgttaatCAAGAATCTAGTAGTATTATGATTAATGAAACAGTAGTATGTGATGATAATGagcaattgataataaataatgaagatgttacaaatgttattttaacGAGATTAGAAGCTGTACAACCTGAAGCATTTACTGAAGATTCAGCTGAAAGTATGACATTAACAACTGGTGGTGCTGTTGATGAAGTTAGATCTGATGGTAGTGATTCTGGTCTTGGTAGTGAATTACCTGGTGATCAAGGACCAGCACCAGCACAAGAAAGTGACTCGGAAACTTCATTTCTTGATAGAATACCAGATGATATTTTAACAGACAAagaaaaagttgtTAATACATTGAATACATTTGATTCTCCATCAAGTTCAAATTCAACAACAGTTGTAAcacaacaaaattattcatcacCACAAAAAAGTAGTTTAAAAAGACGTTTGGATGATTGTCTTGAGGGTGAACCAAGTGCAAAACGTAACAACACCGACGGTgaaccatttaaaaaaaaaaggaatattaaatttgatgctgttactgtttattattttcctcGGTCGCAAGGTTTTACATGTGTACCTTCACagggtGGTAGTACATTGGGAATGAGTGCAACACATACTCATGCTGAAAGATTTTCATTGAGTGAACATGCAGCTGAACAAAGACGACTTCATCGTGCAAGAGTTGCACAATTAAGATCAGAAAGAGCTGCAACATCAGTTATTGAAGCAGCATCAAGTTCTGAAGATCCAAGtgatgatactgatgatgAACCAAGTGATACTGAAGAacttgatattgataattattattttcttcaaccaGTACCACCATGGCAAAGACGTTCATTATTACGTGCTGCTGGTGTACGTAGAATTGATGCTAATGAAAAAGATGATTGTCGTGATATAAGAGCAAGTAGAGAACATTGTGGATGTGGATGTAAAGGATATTGTGATCCTGAAAGTTGTCCATGTTCAAGAGCTAATGTTAAATGCCAAgtTGATCGAGCTGGATTTCCCTGTGGATGTTCACGTGATGGTTGTGCAAATAATTCTGGTAGAATTGAGTTTAATCCAGTTCGTGTACGTACACATTTTATTCATACATTATTGCttcttgaaattgaaaaaaaacaacgtaATGAAGAGCAACGTGATGCAACAAATGAACAAGATATTCAAGATATTAATTCACGAATACCTTTACATGGTGATGTAATACAACAAACAGTAACAGATATTACAACAAATGAACAAAATTGTATGAATACAAGTAGTTTTACAACACtaaattatgataatcatgaaacaacaacacaaAGTTgtcaaaatatacatacaacaAGAGATAATAATAGTTTAGATTTATATGGAATAAGAGATGTTTGTTATCAAACTGatgaaacaattgataattcaaatcACAAAATACATCCAGAATTTAATCCAACATTTCAATCATTTACTCCTCAACAAACAAcattttcaacaacaaattatCAAGATTATCAAACATATGATACActaccatcaacatcatcaccatcacaaTTTCAACCACAATTTCAAAACGTCAATCAATCAcaagatattaataattttacacatTATTCATATGTACAAAATGATCAAAATTCAATTGCTAACAATTCTTGTCAATCACAACTACAAGAACAACAACACCAgcaacaatcatcatcatcatcatcatcacaaccaCAACAAGCACAACCACAACAGCaacaaatttatgataataattttacccAAGATGATAATAACTCTCAACAATacacaaatttaaattcagtACAACAACCAATGAATAATGTTGTACAACAAATGGGTAAACTTGAACCATTCTCGGAACTTCTTGCTGGTCGTTATTCATATTATAGTGATGTTGAGCCACAAccaatcaataattatcatcaaaatagtaataaagttgatgataaaattattgaaagcacaaatatacaaaataatattgatgattgcgatgaaaattttggtgaaattattaaaaaatcaatggtTGAGACTGTTTCTgcttga
- Protein Sequence
- MESTLACPSKSENTNDQEEFTSVNLPTTTTTTTINLENLQENINNEISNNVNELSSEPSNHHDENINENNIKVTNIDKSLLSTINAISDDDDDDNNISKSDDFSTINNTELKVIGVEISDEEIKQLKNDIHRLSPVSVSLHERTLGEILLTSETGGGGGNGDGCKDDGGDGVIENELNINNKNINSENIINNIDKFEINNYNNINDSNNENINDTKLICQQKELMLILSRVDDNKKTNQQIDDTEATTSEINVFNLSPKYMENDQLSRKSPMVVIDKMNHLNKQIITRKLNNEYDDNDGADNDVKIDNNLEKTNELNNEYIVNQESSSIMINETVVCDDNEQLIINNEDVTNVILTRLEAVQPEAFTEDSAESMTLTTGGAVDEVRSDGSDSGLGSELPGDQGPAPAQESDSETSFLDRIPDDILTDKEKVVNTLNTFDSPSSSNSTTVVTQQNYSSPQKSSLKRRLDDCLEGEPSAKRNNTDGEPFKKKRNIKFDAVTVYYFPRSQGFTCVPSQGGSTLGMSATHTHAERFSLSEHAAEQRRLHRARVAQLRSERAATSVIEAASSSEDPSDDTDDEPSDTEELDIDNYYFLQPVPPWQRRSLLRAAGVRRIDANEKDDCRDIRASREHCGCGCKGYCDPESCPCSRANVKCQVDRAGFPCGCSRDGCANNSGRIEFNPVRVRTHFIHTLLLLEIEKKQRNEEQRDATNEQDIQDINSRIPLHGDVIQQTVTDITTNEQNCMNTSSFTTLNYDNHETTTQSCQNIHTTRDNNSLDLYGIRDVCYQTDETIDNSNHKIHPEFNPTFQSFTPQQTTFSTTNYQDYQTYDTLPSTSSPSQFQPQFQNVNQSQDINNFTHYSYVQNDQNSIANNSCQSQLQEQQHQQQSSSSSSSQPQQAQPQQQQIYDNNFTQDDNNSQQYTNLNSVQQPMNNVVQQMGKLEPFSELLAGRYSYYSDVEPQPINNYHQNSNKVDDKIIESTNIQNNIDDCDENFGEIIKKSMVETVSA
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Sequence clustering based on sequence similarity using MMseqs2
- 100% Identity
- iTF_00131949;
- 90% Identity
- iTF_00131949;
- 80% Identity
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