Basic Information

Gene Symbol
CSRNP3
Assembly
GCA_014905175.1
Location
CM026521.1:7398061-7401548[+]

Transcription Factor Domain

TF Family
CSRNP_N
Domain
CSRNP_N domain
PFAM
PF16019
TF Group
Unclassified Structure
Description
This presumed domain is found at the N-terminus of cysteine/serine-rich nuclear proteins. These proteins act as transcriptional activators [1].
Hmmscan Out
# of c-Evalue i-Evalue score bias hmm coord from hmm coord to ali coord from ali coord to env coord from env coord to acc
1 6 0.031 3.5e+02 0.3 1.2 59 139 48 125 22 135 0.45
2 6 0.27 3.1e+03 -2.8 0.8 84 103 228 247 191 292 0.48
3 6 0.27 3.1e+03 -2.8 0.2 45 103 254 311 243 332 0.40
4 6 1.1e-98 1.2e-94 315.6 4.7 1 218 488 698 488 698 0.91
5 6 0.43 4.9e+03 -3.4 0.8 86 117 737 767 699 794 0.42
6 6 0.017 2e+02 1.1 8.3 36 115 846 922 815 937 0.47

Sequence Information

Coding Sequence
ATGGAATCGACTTTAGCTTGTCCGTCAAAGTCAGAAAATACTAATGACCAAGAAGAATTCACCTCAGTGAAtttaccaacaacaacaacaacaacaacaataaatttggaaaatttacaagaaaatattaataatgaaattagtAATAATGTTAATGAATTATCATCAGAGCCAAGCAATCATCATGacgaaaatattaatgaaaataatatcaaggtgacaaatattgataaatcattattgtCAACAATTAATGCAataagtgatgatgatgatgatgataataatattagtaaaagtgatgatttttcaacaataaataatacagaATTAAAAGTAATTGGTGTTGAAATATCTGATGaagaaattaaacaattaaaaaatgatatacatAGATTATCACCAGTATCAGTTAGTCTTCATGAACGAACACTtggtgaaatattattaacatcagaaactggtggtggtggtggcaaTGGTGATGGTTGTAAagatgatggtggtgatggtgttattgaaaatgaattaaatataaataataaaaatattaatagtgaaaatattataaataatattgataaatttgaaattaataattacaataatattaatgatagtaataatgaaaatataaatgatacaaaattaatatgtcaACAAAAAGAATTAATGCTTATATTATCAAgagttgatgataataaaaaaacgaatcAACAAATTGATGATACAGAAGCAACAACAAgtgaaataaatgtttttaatttatcaccaaAATATATGGAAAATGATCAATTAAGTCGTAAAAGTCCAATGgttgttattgataaaatgaatcatttaaataaacaaataattacaagaaaattaaataatgaatatgacGATAATGATGGTGCTGATAATGatgtaaaaattgataataatttagaaaaaacaaatgaattaaataatgaatatattgttaatCAAGAATCTAGTAGTATTATGATTAATGAAACAGTAGTATGTGATGATAATGagcaattgataataaataatgaagatgttacaaatgttattttaacGAGATTAGAAGCTGTACAACCTGAAGCATTTACTGAAGATTCAGCTGAAAGTATGACATTAACAACTGGTGGTGCTGTTGATGAAGTTAGATCTGATGGTAGTGATTCTGGTCTTGGTAGTGAATTACCTGGTGATCAAGGACCAGCACCAGCACAAGAAAGTGACTCGGAAACTTCATTTCTTGATAGAATACCAGATGATATTTTAACAGACAAagaaaaagttgtTAATACATTGAATACATTTGATTCTCCATCAAGTTCAAATTCAACAACAGTTGTAAcacaacaaaattattcatcacCACAAAAAAGTAGTTTAAAAAGACGTTTGGATGATTGTCTTGAGGGTGAACCAAGTGCAAAACGTAACAACACCGACGGTgaaccatttaaaaaaaaaaggaatattaaatttgatgctgttactgtttattattttcctcGGTCGCAAGGTTTTACATGTGTACCTTCACagggtGGTAGTACATTGGGAATGAGTGCAACACATACTCATGCTGAAAGATTTTCATTGAGTGAACATGCAGCTGAACAAAGACGACTTCATCGTGCAAGAGTTGCACAATTAAGATCAGAAAGAGCTGCAACATCAGTTATTGAAGCAGCATCAAGTTCTGAAGATCCAAGtgatgatactgatgatgAACCAAGTGATACTGAAGAacttgatattgataattattattttcttcaaccaGTACCACCATGGCAAAGACGTTCATTATTACGTGCTGCTGGTGTACGTAGAATTGATGCTAATGAAAAAGATGATTGTCGTGATATAAGAGCAAGTAGAGAACATTGTGGATGTGGATGTAAAGGATATTGTGATCCTGAAAGTTGTCCATGTTCAAGAGCTAATGTTAAATGCCAAgtTGATCGAGCTGGATTTCCCTGTGGATGTTCACGTGATGGTTGTGCAAATAATTCTGGTAGAATTGAGTTTAATCCAGTTCGTGTACGTACACATTTTATTCATACATTATTGCttcttgaaattgaaaaaaaacaacgtaATGAAGAGCAACGTGATGCAACAAATGAACAAGATATTCAAGATATTAATTCACGAATACCTTTACATGGTGATGTAATACAACAAACAGTAACAGATATTACAACAAATGAACAAAATTGTATGAATACAAGTAGTTTTACAACACtaaattatgataatcatgaaacaacaacacaaAGTTgtcaaaatatacatacaacaAGAGATAATAATAGTTTAGATTTATATGGAATAAGAGATGTTTGTTATCAAACTGatgaaacaattgataattcaaatcACAAAATACATCCAGAATTTAATCCAACATTTCAATCATTTACTCCTCAACAAACAAcattttcaacaacaaattatCAAGATTATCAAACATATGATACActaccatcaacatcatcaccatcacaaTTTCAACCACAATTTCAAAACGTCAATCAATCAcaagatattaataattttacacatTATTCATATGTACAAAATGATCAAAATTCAATTGCTAACAATTCTTGTCAATCACAACTACAAGAACAACAACACCAgcaacaatcatcatcatcatcatcatcacaaccaCAACAAGCACAACCACAACAGCaacaaatttatgataataattttacccAAGATGATAATAACTCTCAACAATacacaaatttaaattcagtACAACAACCAATGAATAATGTTGTACAACAAATGGGTAAACTTGAACCATTCTCGGAACTTCTTGCTGGTCGTTATTCATATTATAGTGATGTTGAGCCACAAccaatcaataattatcatcaaaatagtaataaagttgatgataaaattattgaaagcacaaatatacaaaataatattgatgattgcgatgaaaattttggtgaaattattaaaaaatcaatggtTGAGACTGTTTCTgcttga
Protein Sequence
MESTLACPSKSENTNDQEEFTSVNLPTTTTTTTINLENLQENINNEISNNVNELSSEPSNHHDENINENNIKVTNIDKSLLSTINAISDDDDDDNNISKSDDFSTINNTELKVIGVEISDEEIKQLKNDIHRLSPVSVSLHERTLGEILLTSETGGGGGNGDGCKDDGGDGVIENELNINNKNINSENIINNIDKFEINNYNNINDSNNENINDTKLICQQKELMLILSRVDDNKKTNQQIDDTEATTSEINVFNLSPKYMENDQLSRKSPMVVIDKMNHLNKQIITRKLNNEYDDNDGADNDVKIDNNLEKTNELNNEYIVNQESSSIMINETVVCDDNEQLIINNEDVTNVILTRLEAVQPEAFTEDSAESMTLTTGGAVDEVRSDGSDSGLGSELPGDQGPAPAQESDSETSFLDRIPDDILTDKEKVVNTLNTFDSPSSSNSTTVVTQQNYSSPQKSSLKRRLDDCLEGEPSAKRNNTDGEPFKKKRNIKFDAVTVYYFPRSQGFTCVPSQGGSTLGMSATHTHAERFSLSEHAAEQRRLHRARVAQLRSERAATSVIEAASSSEDPSDDTDDEPSDTEELDIDNYYFLQPVPPWQRRSLLRAAGVRRIDANEKDDCRDIRASREHCGCGCKGYCDPESCPCSRANVKCQVDRAGFPCGCSRDGCANNSGRIEFNPVRVRTHFIHTLLLLEIEKKQRNEEQRDATNEQDIQDINSRIPLHGDVIQQTVTDITTNEQNCMNTSSFTTLNYDNHETTTQSCQNIHTTRDNNSLDLYGIRDVCYQTDETIDNSNHKIHPEFNPTFQSFTPQQTTFSTTNYQDYQTYDTLPSTSSPSQFQPQFQNVNQSQDINNFTHYSYVQNDQNSIANNSCQSQLQEQQHQQQSSSSSSSQPQQAQPQQQQIYDNNFTQDDNNSQQYTNLNSVQQPMNNVVQQMGKLEPFSELLAGRYSYYSDVEPQPINNYHQNSNKVDDKIIESTNIQNNIDDCDENFGEIIKKSMVETVSA

Similar Transcription Factors

Sequence clustering based on sequence similarity using MMseqs2

100% Identity
iTF_00131949;
90% Identity
iTF_00131949;
80% Identity
-