Agif005344.1
Basic Information
- Insect
- Aphidius gifuensis
- Gene Symbol
- KDM5A
- Assembly
- GCA_014905175.1
- Location
- CM026523.1:6898584-6915978[-]
Transcription Factor Domain
- TF Family
- ARID
- Domain
- ARID domain
- PFAM
- PF01388
- TF Group
- Helix-turn-helix
- Description
- This domain is know as ARID for AT-Rich Interaction Domain [2], and also known as the BRIGHT domain [1].
- Hmmscan Out
-
# of c-Evalue i-Evalue score bias hmm coord from hmm coord to ali coord from ali coord to env coord from env coord to acc 1 2 2e-25 3.2e-22 78.1 0.0 2 89 85 168 84 168 0.94 2 2 4.5 7.3e+03 -3.2 0.1 49 81 814 844 811 847 0.62
Sequence Information
- Coding Sequence
- atgggAGAAAAATCAAGTGCTGATTTTGAATTTGGTATACCACCAGAAGCACCAGTATTTGAACCAACACCTGAAGAATTTCTTGATCCACTTGGATATATTGCTAAAATACGTCCAATTGCTGAAAAATCAGGAATATGCAAAATTAAACCACCGCCTAATTGGCAGCCACCATTTGCAgttgatgttgataaatttaaatttacaccTCGAATACAAAGATTAAATGAATTGGAAGCAAAAACacgtattaaattaaattttttagatcaAATTGCTAAATTTTGGGAACTTCAAGgttcatcattaaaaataccatTAGTTGAAAGAAAAGCACTTGATCTTTATTCACTTCATAAAATTGTAACAGATGAAGgtGGTATTGAGACAGTTACACGTGAACGTAGATGGGctaaaattgcaaataaattgGGTTATCCATCAGGCAGAAGTGTTggaagtattttaaaaaatcattatgaaAGAATTTTATATCCATTTGATGTATTCAAACAGGGTAAAACACTTAGTGATATTaaaattgaacCAGACAATgaagttaatgaaaaaaaagatcgTGATTATAAACCACATGGTATAATATCAcgtcaacaaataaaaccacCAACAGCAAAATTTTCACGTCGTTCAAAAAGATTTAatggtgatgataataaagatatacaattaaaacaaGAAGATTGTAAAGATGATTGTGATTCTGATTCTGATATTAAAGatgttaaaaatgaaacaGACGAAGAACGTGACagtaaagaattaaaaaaattacaattttatggAGCTGGTCCAAAAATGGCTGGTTTTAATaccaaagataataataaaaaattaaatatcaataataataacaacaacaacaataataataatagtagtaataatagtaataataaaacacgTGGTGTTAAACATACATATGATTATGATCCATtggcaaaatatatatgtcatAATTGTGGACGTGGTGATATGGAAGAGAGTATGTTACTTTGTGATGGTTGTGATGATAGTTATCatacattttgtttattaccaCCATTATCTGAAATACCAAAAGGTGATTGGAGATGTCCAAAATGTGTTGCTGAAGAAGTATCAAAACCAATGGAAGCATTTGGATTTGAACAAGCACAACGTGAATATACATTACAACAATTTGGTGAAATGGCTGATCAATTTAAAagtgattattttaatatgcCAGTACATATGGTACCAACAACACTAGTTGAAAAAGAATTTTGGCGTATTGtatcatcaattgatgaagATGTTACTGTTGAATATGGTGCTGATTTACATACAATGGATCATGGTTCTGGTTTTCCAACAAAAACaagtgttaatttatttacatgtgATCAAGAATATGCTGAATCAGCATGGAATCttaataatttaccagtaTTACATGGTAGTGTACTTGGACATATTAATGCTGATATTAGTGGTATGAAAGTACCATGGATGTATGTTGGTATGTGTTTTGCAACATTTTGTTGGCATAATGAAGATCATTGGagttattcaattaattatttacattggGGTGAACCAAAAACTTGGTATGGTGTACCTGGTTCTGAAGCTGAAAAATTTGAACATTCAATGAAATCAGCAGCACCAGAATTATTTCATAGTCAACCTGATTTATTACATCAACTTGTTACAATTATGAATCCAAcaatattaacaaatgaaGGTGTACCAGTTTATCGTACTGATCAACATGCTGGTGAATTTGTTGTTACATTTCCTCGTGCATATCATGCTGGTTTTAATCAAGGCTATAATTTTGCTGAAGCTGTTAATTTTGCTCCAGCTGATTGGCTTAAAATTGGAAGAGATTGCATATcacattattcaaatttacGTAGATTTTGTGTATTTTCACATGATGAATTAGTTTGTAAAATGTCACTTGATCCAGACTCATTGGATATTGGTGTTGCAACAGCAACATATCAAGACATGTTGACAAtggttgaaaatgaaaaaaaattacgtaaaaaTCTTCTTGAATGGGGTGTTACCGAGGCTGAACGTGAAGCATTTGAACTATTACCAGATGATGAACGACAGTGTGAGACATGTAAAACAACTTGTTTTTTAAGTGCTGTGACCTGTTCATGTCATAGTTCTCAACTTGTTTGTCTACGTCATTATAGTGATCTTTGTAGTTGTTCACCAGATAAACATACATTACGTTATCGTTATACACTTGATGAATTACCAATCatgttacaaaaattaaaattaaaagctgAATCATTTGATTCATGGGTTAGTAAAGTTAAAGAAGCCATTGAACCAGAtggtgaaaaaattgaattaagtGATTTAAAAGAACTACTAAATGaagctgaaaataaaaaatttcctgACAGTGAATTATTAACAGCTCTAACAACAGCTGTACAAGATGCTGAAAAATGTGCAAGTGTTgcacaacaattattaaatagtaaACAACGTACAAGAACAAGACAATCAGTTGATACAAAGTACAAATTAACTGTTGaagaattaacattattttataaagaaataaaaaatttatgctgTGAATTAAAAGAATCAGATGgtgttaaatatatacttgatcaagttattaaatttaaaaaagatgctgaagattttaataatgaaaatgatgatgatgatgatgaagactgtgattatgataaattggaaaaatgtATTGATTTTGGTGATTCAATATGTATTGAATTACCACAATTAGTACGtcttaaacaaaaattatgtcaACTACAATGGCTTGAtgaagtaaaattaattttagatgataaaaaacaattaacacgtgaaaatataattaaattaataaataaaggttTAACAATACCACCATATtataatgttgataaaatgttaacaaaattacaaaagttaaaaaatgatattgataattgggaaaataaagcaaataattatttacaagataaaaaaattcataatattattgaaattgaagaatttataaatgaagctaaaaaaattgatgcaaTATTACCAAGTTTTGATAcattaaatgatatattaataaaatctaaaaattggataaaacaaattgatgaaataaatgcaCGTGATAATCCACCATATTATGATACACTTGATGAACTTGTTAAAAAAGGTACAAATATACCATTACGTCTTGATGGTTTAGCTGTACTTGAATCAACATTAACAGCAGCAAAATCATGGAAAGAACGTAcatcaaaaacatttttacgTAAAAATGCACATTGTACATTAATGGAAGCATTATCACCACGTATTGGTGTTGGTGTACaaccattaaaatttaaaaaaaatcatcataaatttgatgataattcaattaattctgTATTTGTATGTGATACAAAATTAGATGATTCAAGTGATTCAGCAAATGTTGTTGCTGCATTTAAACTTGCTGAACAACGTGAAATGGAAGCTATGAAAAATTTACGTGATAGAAATATgtcaaaaattgataatgaagaTTCAAGATATTGTGTTTGTCGTAGACCAAGATTTGGTATGATGTTTCAATGTGAATTATGTAAAGATTGGTTTCATTCAAATTGTATACCACTaccaaaaacattaaataaacataaaaatttaacaaatacattatcaccatcatcatcaccatcctcgtcatcatcatcatcgtcgtcgtcatcatcaccaccaacaGCAACAAACACAACTACCACATCACCACCATCAttaacagcagcaacaacactATCACCATCATTAGTAGCAccaaaagaaacaaaatttttatgtccATGTTGTTTAAGATCAAGAAGACCAAAATtagaaacaatattaaaactattggttagtttacaaaaaataccAATAAGATTACCAGAAGGTGAAGCATTACAATGTTTAACTGAACGTGCTATGAATTGGCAAGATCGTGCAAGACAAGCATTATTAGATGAAGAAATAGTTACAGTacaatcaaaattatcagcattattacaaaaatcaGTTGATACTTCAACTGTTAAAGATAaaacagataaaataattaataatgaattaaaaaaagttacaaataatacagagttaaataatcaacaacgtttatcatcatcatcgtcatcatcatcatttaataaaacagatgataatatattaagtagtgttgatgaagatgatgaggatgatgaagaagacgatgaagatgatgacaatgatgcTGAtgctgatgaagatgaagacgatgatgatgatggtcaTACACCAAGAAgaacatcatcaaataaatttaacaatagtGAACATGCATATTCATATTCATCAAAGCTACATCGTAAAATAATTGGACAAAATAATGATAGACTTGTTGAATTATCAGAAAATGCTagagaaaatttaatagaattaaTGATGGAAGGTGATTTATTAGAAGTATCACTTGAAGAAACATCAAAAATATGGAGAATATTAACTGATACTAATCGcccaagtattaaaaaatattcatttagtaataaacatgataatttaaatagtgataataaagatattaaaaaacgtggaagaaaaagaaaatccgaagaatttgaattattaaaaaaaattggtagaCAAAagattgatgataaaacaacaacaacaacaacatcatcatcatcaacaacgacaacaccaacaacatcaccaattattaaaaaaaaaggttttaataataaagatattaaagataaaaaaattattccatcAACTGGTGCACTTAAACGAGGTCCAAGaaagattaaaaGAAAAGATGGTGAagaattaccaaaaaaaaaaggaggtaatagaaaaaaaacaaaacaagatACATCTGATGAAGAAGATGACTGTGCAGCTAATGATTGTCTTCGACCAAGTggTCGAGAAGTTGACTGGGTCCAGTGTGATGGAGGATGTAATGGATGGTTTCATATGCATTGTGTTGGACTTGATAAAACTGAACTTGCTGAGGAGGATGATTATATTTGCCGTCATTGCAAAGATGCTGATCAAAATGCGTCACCGGGATACGACACCGAGGACAACGACCTGGACATTGAAGTAGGACTTGAGAAGACCTACTAG
- Protein Sequence
- MGEKSSADFEFGIPPEAPVFEPTPEEFLDPLGYIAKIRPIAEKSGICKIKPPPNWQPPFAVDVDKFKFTPRIQRLNELEAKTRIKLNFLDQIAKFWELQGSSLKIPLVERKALDLYSLHKIVTDEGGIETVTRERRWAKIANKLGYPSGRSVGSILKNHYERILYPFDVFKQGKTLSDIKIEPDNEVNEKKDRDYKPHGIISRQQIKPPTAKFSRRSKRFNGDDNKDIQLKQEDCKDDCDSDSDIKDVKNETDEERDSKELKKLQFYGAGPKMAGFNTKDNNKKLNINNNNNNNNNNNSSNNSNNKTRGVKHTYDYDPLAKYICHNCGRGDMEESMLLCDGCDDSYHTFCLLPPLSEIPKGDWRCPKCVAEEVSKPMEAFGFEQAQREYTLQQFGEMADQFKSDYFNMPVHMVPTTLVEKEFWRIVSSIDEDVTVEYGADLHTMDHGSGFPTKTSVNLFTCDQEYAESAWNLNNLPVLHGSVLGHINADISGMKVPWMYVGMCFATFCWHNEDHWSYSINYLHWGEPKTWYGVPGSEAEKFEHSMKSAAPELFHSQPDLLHQLVTIMNPTILTNEGVPVYRTDQHAGEFVVTFPRAYHAGFNQGYNFAEAVNFAPADWLKIGRDCISHYSNLRRFCVFSHDELVCKMSLDPDSLDIGVATATYQDMLTMVENEKKLRKNLLEWGVTEAEREAFELLPDDERQCETCKTTCFLSAVTCSCHSSQLVCLRHYSDLCSCSPDKHTLRYRYTLDELPIMLQKLKLKAESFDSWVSKVKEAIEPDGEKIELSDLKELLNEAENKKFPDSELLTALTTAVQDAEKCASVAQQLLNSKQRTRTRQSVDTKYKLTVEELTLFYKEIKNLCCELKESDGVKYILDQVIKFKKDAEDFNNENDDDDDEDCDYDKLEKCIDFGDSICIELPQLVRLKQKLCQLQWLDEVKLILDDKKQLTRENIIKLINKGLTIPPYYNVDKMLTKLQKLKNDIDNWENKANNYLQDKKIHNIIEIEEFINEAKKIDAILPSFDTLNDILIKSKNWIKQIDEINARDNPPYYDTLDELVKKGTNIPLRLDGLAVLESTLTAAKSWKERTSKTFLRKNAHCTLMEALSPRIGVGVQPLKFKKNHHKFDDNSINSVFVCDTKLDDSSDSANVVAAFKLAEQREMEAMKNLRDRNMSKIDNEDSRYCVCRRPRFGMMFQCELCKDWFHSNCIPLPKTLNKHKNLTNTLSPSSSPSSSSSSSSSSSSPPTATNTTTTSPPSLTAATTLSPSLVAPKETKFLCPCCLRSRRPKLETILKLLVSLQKIPIRLPEGEALQCLTERAMNWQDRARQALLDEEIVTVQSKLSALLQKSVDTSTVKDKTDKIINNELKKVTNNTELNNQQRLSSSSSSSSFNKTDDNILSSVDEDDEDDEEDDEDDDNDADADEDEDDDDDGHTPRRTSSNKFNNSEHAYSYSSKLHRKIIGQNNDRLVELSENARENLIELMMEGDLLEVSLEETSKIWRILTDTNRPSIKKYSFSNKHDNLNSDNKDIKKRGRKRKSEEFELLKKIGRQKIDDKTTTTTTSSSSTTTTPTTSPIIKKKGFNNKDIKDKKIIPSTGALKRGPRKIKRKDGEELPKKKGGNRKKTKQDTSDEEDDCAANDCLRPSGREVDWVQCDGGCNGWFHMHCVGLDKTELAEEDDYICRHCKDADQNASPGYDTEDNDLDIEVGLEKTY
Similar Transcription Factors
Sequence clustering based on sequence similarity using MMseqs2
- 100% Identity
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- 90% Identity
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- 80% Identity
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