Basic Information

Gene Symbol
mybL
Assembly
GCA_030523065.1
Location
JAPYYR010000004.1:36285-38837[+]

Transcription Factor Domain

TF Family
MYB
Domain
Myb_DNA-binding domain
PFAM
PF00249
TF Group
Helix-turn-helix
Description
This family contains the DNA binding domains from Myb proteins, as well as the SANT domain family [1].
Hmmscan Out
# of c-Evalue i-Evalue score bias hmm coord from hmm coord to ali coord from ali coord to env coord from env coord to acc
1 5 8.4 6.9e+03 -2.8 0.6 6 20 10 24 9 27 0.84
2 5 2.5e-09 2.1e-06 27.6 1.2 1 39 264 304 264 311 0.91
3 5 2.1e-05 0.017 15.1 0.1 2 43 321 366 320 368 0.96
4 5 1.5e-13 1.3e-10 41.1 0.0 1 45 375 420 375 421 0.94
5 5 1.2e-08 9.8e-06 25.5 0.3 4 34 431 462 429 464 0.95

Sequence Information

Coding Sequence
atgaattcaaatgattatgaagatgatgaagaggatatcgaaaaattacaagaaataTTGGCTAAACATAAagctaaaaaagaaattgaaagtGATGACAGTGAAATTGAAAGTGAAATAGATGAACATaatgataaaacttttaaatttcattcatcaACATTTGCTGATTCTGATTCTGATTCTTCAAGCTGTGAAATAGATTTCCCAAATGATACAGAAAcaattaaacataataatgaagtaaatgatgttgaaaaatcattaaaattaaatagagaattaatggaaaaatataaaaaagcaagattaataattgaagaaagattaaataaatgcaaaaatgaaatagcagaaataaatttagcaacagataaaaaaataaaaaatataccacaTACACAATGGTCAAAAGCAGGTATGCCATATTTTAAAGATTCACAAATGTTTGGAGCACCATTAAATgctgatgcaaaaaaaaaaataagtaaagaCGAATTAATGGTTGTTTATTTACCAAAACCAAAAAGATGGAGTGGAAGAGATCGTCGtgaattatcgaaaaaaatacaagttgaaTCATCATGTTCAAGTTTTGAGAGTATTATTGCTGAAAATTTAATGTCtgataatttaccaattaaaaaaaaaagttttcatgaAATTGTTGGTCCACTTGGCTCACGTGAATTTGATTGGATGAAATTatctgttgatttattttatcatcgtCATACTGCTGAAGAATTACGTGTCATGTGGAATGTATACCTACATCCTgatataagtaaaaaaaaatggaaaacaaAAGAAGACaaagatttaaaaagaatagctaataaacataaacatcAAAATTGGGATCTTAttgctgaaaaattaaatacatcaaGATCTGGTTATCAATGCTTCATAAGACAcaatacaatattaaaatgtctCAATTCAAATGACAAAGATAAACCATGgtcaaaagaagaaaatattatattaaacatATGCATTGATAAGCTGAGAATTGGTGATTACATACCATGGAGTGTTGTTGTTTCTTACATTGATGATCGtacaaaaaatcaagtttatgGACATTGGAAATATAGTATTGATCCGTCATTAAAAAAAGGTAGATTTACTAGTGAAGAAGATCAAATAATACTTGATGGTGTTGCTGAATATGGAcgtaattattcaaaaatatcaacaaaattaatgcCACATAGAACAAGTGTACAAATTGCATCACGTtttcgtttattattattaaaagctgatgataaatttaatttatggaCACTTGCTgaggataaaaaattacttgaactTTATAAACTACATGAATCACAATGGAGTCTTATTgctaaaattatgaaaaaagataGAACATATCTACGTCATCGTCATTTAGCATTAATGCGTTATATTAACAAAGGCCATAGCTTAAGATCAATACCAAGAAAACGTCTTGTTGATGAAACTAAGGATGATATGAatgctgatgataataatgatgatgaagatgaagaagatgatgataatattgatactacagataatattgaaatgaataaaattgataatcaaataattgaatttataaaagctGCACATTTACCAACAATGAAACCAGTTGGTggacaaattaaaaaagaaaattactatGATCCAGTTAAATCATCTAAAGaattgtataatatattttcgtcATTATCAGCAAAACTTGAAATACCAGATACTTTAAATATGAGTGAATTAAATGACAATGACATTGATATATTaacaacatataaaaaaatttgtcaaggTACATtagcaacaaataaaattgaagaatatagtaaaaaaatgtttccaTTAAATTCATCACCATCAACATCTGAAGATACACAACATTTTATACCACCAGCACCATTtggattatttcaaaattgtcataaaaaaattataaaagataataatattaattcaaaagaaGTTGATGAAAGTTTTCAGtatgatttatcaatgaataatatagAAACACcagttattattgatgaaaaaattgatgataaagaaaaaagagtatttgataaattatcatcattatttggtgatgaatgtttgaaaaaacgtagatgtaaatttgaaaataaaatggtaTTTTCAAATTCTGAAGATGGGGATGAGactgatgttgatgatgatgttcatcatgaaataacaaaaaaaaaaattgataaaatttggtTGCCATATAATAAAGAAGATAATATTATTCGTGATCGTAGTTTTTTTAAGCCATCATTGTCAACAATTATTGGCTTTGATGCAAtacaaaatatgaaaaaaaataaagaaaaattacactGGTCCAAGAGTGATgctaaaaatagtaaaacaaaaataacaacaaatggtAAACAAGCATTTTATGCATTTAAAAAtcgttttcaaaaattattcaaatatccAATTGTATTAGCAAATATATTACCAATTGAAGTTGGATTGCCAAGTGGTGATGTTCAGcaagatgatgacgatgatgatgatgatgatgaagaccagtaa
Protein Sequence
MNSNDYEDDEEDIEKLQEILAKHKAKKEIESDDSEIESEIDEHNDKTFKFHSSTFADSDSDSSSCEIDFPNDTETIKHNNEVNDVEKSLKLNRELMEKYKKARLIIEERLNKCKNEIAEINLATDKKIKNIPHTQWSKAGMPYFKDSQMFGAPLNADAKKKISKDELMVVYLPKPKRWSGRDRRELSKKIQVESSCSSFESIIAENLMSDNLPIKKKSFHEIVGPLGSREFDWMKLSVDLFYHRHTAEELRVMWNVYLHPDISKKKWKTKEDKDLKRIANKHKHQNWDLIAEKLNTSRSGYQCFIRHNTILKCLNSNDKDKPWSKEENIILNICIDKLRIGDYIPWSVVVSYIDDRTKNQVYGHWKYSIDPSLKKGRFTSEEDQIILDGVAEYGRNYSKISTKLMPHRTSVQIASRFRLLLLKADDKFNLWTLAEDKKLLELYKLHESQWSLIAKIMKKDRTYLRHRHLALMRYINKGHSLRSIPRKRLVDETKDDMNADDNNDDEDEEDDDNIDTTDNIEMNKIDNQIIEFIKAAHLPTMKPVGGQIKKENYYDPVKSSKELYNIFSSLSAKLEIPDTLNMSELNDNDIDILTTYKKICQGTLATNKIEEYSKKMFPLNSSPSTSEDTQHFIPPAPFGLFQNCHKKIIKDNNINSKEVDESFQYDLSMNNIETPVIIDEKIDDKEKRVFDKLSSLFGDECLKKRRCKFENKMVFSNSEDGDETDVDDDVHHEITKKKIDKIWLPYNKEDNIIRDRSFFKPSLSTIIGFDAIQNMKKNKEKLHWSKSDAKNSKTKITTNGKQAFYAFKNRFQKLFKYPIVLANILPIEVGLPSGDVQQDDDDDDDDDEDQ

Similar Transcription Factors

Sequence clustering based on sequence similarity using MMseqs2

100% Identity
iTF_00131886;
90% Identity
-
80% Identity
-