Aepo004547.1
Basic Information
- Insect
- Apamea epomidion
- Gene Symbol
- -
- Assembly
- GCA_947507525.1
- Location
- OX382251.1:13722501-13917740[-]
Transcription Factor Domain
- TF Family
- THAP
- Domain
- THAP domain
- PFAM
- PF05485
- TF Group
- Zinc-Coordinating Group
- Description
- The THAP domain is a putative DNA-binding domain (DBD) and probably also binds a zinc ion. It features the conserved C2CH architecture (consensus sequence: Cys - 2-4 residues - Cys - 35-50 residues - Cys - 2 residues - His). Other universal features include the location of the domain at the N-termini of proteins, its size of about 90 residues, a C-terminal AVPTIF box and several other conserved residues. Orthologues of the human THAP domain have been identified in other vertebrates and probably worms and flies, but not in other eukaryotes or any prokaryotes [1].
- Hmmscan Out
-
# of c-Evalue i-Evalue score bias hmm coord from hmm coord to ali coord from ali coord to env coord from env coord to acc 1 39 1e-05 0.0064 17.6 0.1 19 84 180 241 168 244 0.74 2 39 1.5e-05 0.0092 17.1 0.1 19 84 325 386 313 393 0.73 3 39 1.5e-05 0.0092 17.1 0.1 19 84 840 901 828 908 0.73 4 39 1.5e-05 0.0092 17.1 0.1 19 84 1207 1268 1195 1275 0.73 5 39 1.5e-05 0.0092 17.1 0.1 19 84 1648 1709 1636 1716 0.73 6 39 1.5e-05 0.0092 17.1 0.1 19 84 2015 2076 2003 2083 0.73 7 39 1.5e-05 0.0092 17.1 0.1 19 84 2382 2443 2370 2450 0.73 8 39 1.5e-05 0.0092 17.1 0.1 19 84 2527 2588 2515 2595 0.73 9 39 1.5e-05 0.0092 17.1 0.1 19 84 2672 2733 2660 2740 0.73 10 39 1.5e-05 0.0092 17.1 0.1 19 84 2891 2952 2879 2959 0.73 11 39 1.5e-05 0.0092 17.1 0.1 19 84 3036 3097 3024 3104 0.73 12 39 1.5e-05 0.0092 17.1 0.1 19 84 3181 3242 3169 3249 0.73 13 39 1.5e-05 0.0092 17.1 0.1 19 84 3326 3387 3314 3394 0.73 14 39 1.5e-05 0.0092 17.1 0.1 19 84 3471 3532 3459 3539 0.73 15 39 1.5e-05 0.0092 17.1 0.1 19 84 3690 3751 3678 3758 0.73 16 39 1.1e-05 0.0068 17.5 0.1 19 84 4030 4091 4018 4098 0.73 17 39 1.5e-05 0.0092 17.1 0.1 19 84 4202 4263 4190 4270 0.73 18 39 1.5e-05 0.0092 17.1 0.1 19 84 4421 4482 4409 4489 0.73 19 39 1.5e-05 0.0092 17.1 0.1 19 84 4788 4849 4776 4856 0.73 20 39 1.5e-05 0.0092 17.1 0.1 19 84 4933 4994 4921 5001 0.73 21 39 1.5e-05 0.0092 17.1 0.1 19 84 5078 5139 5066 5146 0.73 22 39 1.5e-05 0.0092 17.1 0.1 19 84 5297 5358 5285 5365 0.73 23 39 1.5e-05 0.0092 17.1 0.1 19 84 5516 5577 5504 5584 0.73 24 39 1.5e-05 0.0092 17.1 0.1 19 84 5661 5722 5649 5729 0.73 25 39 1.5e-05 0.0092 17.1 0.1 19 84 5806 5867 5794 5874 0.73 26 39 1.1e-05 0.0068 17.5 0.1 19 84 6294 6355 6282 6362 0.73 27 39 1.5e-05 0.0092 17.1 0.1 19 84 6439 6500 6427 6507 0.73 28 39 1.5e-05 0.0092 17.1 0.1 19 84 6584 6645 6572 6652 0.73 29 39 1.5e-05 0.0092 17.1 0.1 19 84 6729 6790 6717 6797 0.73 30 39 1.5e-05 0.0092 17.1 0.1 19 84 7022 7083 7010 7090 0.73 31 39 1.1e-05 0.0068 17.5 0.1 19 84 7315 7376 7303 7383 0.73 32 39 1.5e-05 0.0092 17.1 0.1 19 84 7460 7521 7448 7528 0.73 33 39 1.5e-05 0.0092 17.1 0.1 19 84 7605 7666 7593 7673 0.73 34 39 1.5e-05 0.0092 17.1 0.1 19 84 7750 7811 7738 7818 0.73 35 39 1.5e-05 0.0092 17.1 0.1 19 84 7895 7956 7883 7963 0.73 36 39 1.5e-05 0.0092 17.1 0.1 19 84 8114 8175 8102 8182 0.73 37 39 1.5e-05 0.0092 17.1 0.1 19 84 9214 9275 9202 9282 0.73 38 39 1.5e-05 0.0092 17.1 0.1 19 84 9433 9494 9421 9501 0.73 39 39 1.3e-05 0.0084 17.2 0.1 19 84 9726 9787 9711 9794 0.73
Sequence Information
- Coding Sequence
- 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