Basic Information

Gene Symbol
CSRNP3
Assembly
GCA_963971155.1
Location
OZ020119.1:1041748-1045738[-]

Transcription Factor Domain

TF Family
CSRNP_N
Domain
CSRNP_N domain
PFAM
PF16019
TF Group
Unclassified Structure
Description
This presumed domain is found at the N-terminus of cysteine/serine-rich nuclear proteins. These proteins act as transcriptional activators [1].
Hmmscan Out
# of c-Evalue i-Evalue score bias hmm coord from hmm coord to ali coord from ali coord to env coord from env coord to acc
1 5 0.051 1.7e+03 -0.4 0.6 58 103 72 113 34 143 0.44
2 5 6.1e-97 2e-92 309.9 8.0 1 218 381 582 381 582 0.92
3 5 0.25 8.3e+03 -2.7 0.4 53 81 655 683 637 703 0.52
4 5 1 3.3e+04 -5.0 4.1 62 104 1097 1144 1077 1177 0.52
5 5 0.079 2.6e+03 -1.0 3.1 43 93 1219 1270 1199 1293 0.40

Sequence Information

Coding Sequence
atgtttaAACCAATAAAAAGTTTCATATCATATTTTCAAAAGAATACTAATGTTGGTACAGGTATATTTGGTCCATCATCAATACAACAAACaaataatgatataaaaatggatgagaataaacaaaaatttaaaactgatataataacaattgaaaattttattgatgTTGAAGATGAAATTATTGcagaaaaaattgaaaagaaatcATTATCAATATCAAGGCatcaaaatcataataaaaatgaaattttaaataatagtaagaaaaaatcaaataatttaataaataatgataatgatataAATGTTGATGATTTAATTGAAGATTGTATAAGCCCAAAAAAATCATCTACAACGACAACAACAACATTAAATCCAATTAAAATTGATACGGATAgagatttaattttatattcaagtCCAATAAATAGTccaacaacaacagcaaaaTCATGTGATTCATTTGCAAGCATTATTAGTCCAActaaaatttatgtaaatggtgataacaattttaatggtatcaatgatgatgatgataatgataatgttGATGATGAAACAGCCGTTGATGAGGAAATTATTGTTGTATCAATGAATGgtgatgataatgatgatgatgataatgaaaataatttatgtaatatgaCAACAATATCAGATCCATTAGCATTAGATGAATATAATTTAGATGaaatgaattcaaatttaaCTCAAAGTGATACAACAAGTTCATCAATTATTGATACAACTGATGTCTTAAATGATGGTATCATTTGTATAATAGATGTTGATAATAttaaagatataaaaaaagaaaatacaacagcagcaacaacaatGATATTGACAgcaaataaaaccaaaaatacTAAATCTAATCATCATGATACTTCGATAAAAACTAATGTAACAAACTTTAATATATCAAAtgttaaaattgaaattggTAATGAAGAACACGAATTAAGAAGTGATGGATCAGATTCAGGATTAGGTTTAGAAACATCTACAACATCTAATAATAGCGTATTCACAACTCAATCATCATCACCTTtaattaataagaaaattgtaataccaacaaaaagtaatttaaaacGACGATCAAATGAGGAACCAATTTTCAATGAGAAAAAGACAAAACGTTCAATACATTTTGATGGAGTTAgtgtttattattttccaCGAATGCAGGGTTTTGCTTGTATACCATCACAAGGTGGTTGTACTTTGGGCATGGGATCAAGACATATACACTTTAAAACGTTTTCCTTGACGGATTATGCAGCTGAACAAAGACGAGCTCATAAACAACAAATGCAAGAAATAAATCCAAAGAGCTCATCAAGTGATGAGACCGATAGCGACGAAGAGTTGAGTGAAGCAAGCGGTTCAGATCTTGATGCTGATGGTAGTGGATTTTTGCAACCTGTACCCACTCGACAAAGAAGGGCACTACTAAAAGCAGCTGGAATTCGAAAAATCGATCCAACAGAAAAAGACGAATGCCGCGCGATACGTACATCAAGAGAATTTTGTGGGTGCAGTTGTAGAGGATACTGTGATCCAGATACTTGTTCATGTAGTCAAGCTGGAATTAAATGTCAGgtTGATCGGCCAAGTTTTCCTTGCGGTTGTACTCGAGATGGTTGCGCTAATGTTGTCGGTCGAGTAGAATTTAATCCAGGTAGAGTTCGAacacattttatacatacaattatgCGTTTAGAAATCGAAAATAAACAAAAGCGCCGAAATGATGAAATCGATTCAACATTATCGTCAACGCCATCATCGTTACCAATGTTAAATTACATGAATAACTGTATAACAGATAACAGTAATTTATCAATTACTTCCACAATGATGAATACATGCTCTAATAATAACAGCAGTAGTTTAAGTGCtatttgtaattataatgTAAGTAATAATACCGCTAGCCATATTGGAACAACACAGCAATCATACCACCAAATTCATTTACAACATCAGCAACAACAacataatcaaaattttcttaataacGTTCATTATTCAAATATGATGCATAATAATACCACTGGTGGTATTTcaacatcattttcatcaGAAAATTCGCATACTGGTTGCATACCATTGATGGCGAACGGTCCTAGTAGTAATCATTTAAATACTACATTAGACATAAATCTAATGAGTACAAATTCAAATCATTCAATGGATTTGTCTTATCCACTTCGTGACATTACAACCGAAAATTCAATATGCAACAATTTGATGATCGATTTTCCTAATAATAGTAATCAATTATTTCATCACGATATCTATGGTACTAGTAATCAATCGTATGCAGTTGGTGGTAGTCAATCTTATCATAATCAAAATCTTAGTTCAAATAATAGTTATCACTCAACAACGGCAACAACAACGCCGGCTGTCacatattcaaattataatcaacaaaattatattCCTTACATGCCACAAACATGTAATAGCGATACAATAGAAATTCACGATTTAGTATCGCCTGACGAAGATTCAAATAATTACATAAGCCTACATCCACCAATAGCAAATTCATCACGTTTAGATGCAATTAATGATTTATTACATAACAATCGTAATACACCTCCAACAATTCCAACAGTACAACAACAAACACCCATCATCGCCACCATTGCAGCAACAAGTGCGATCATTGATCCATTACCAATGAAACCAGCAACAGTCTCTGCACTGTCGGAATCATGTAATTTAGCATCATCTGCACAAACATCAACTTCTGTTGTTGAAGGCAcagcaacaaaaaatacatCCCCCGTACAAATAACGTGTCatggaaaacaaaaatcgTCTGTAGTCGATTTAACTGATGATGatttaatgaaaattgaaaatagtTCATCACTTAGAATGTCAACGAATATTACTAATAATGCtactaataataatgatgatgttCAAATTATTGAGCCATTAACAATATCATCAAAATCAACAacagaaattttaaatattgaaaattcttcaaatattatttttaaagaatcAGCCTTAAATGATCCTTCAAATGGTAAAATAAATTCGCAAATTGAAAGAAACGATGATATTGAAATAATtggaatttcattaaatttagataaaattgATGAGAATACGAATAGTGTAGAAATAAAAGATACAATTGATAATGAATTATCACCAACagataataaattattatcattattattatcaccCCAACCATCATCATCGTTATCAAAAGATAAAGACGATGATGAACAACAGAATGATGATAATAGTAATAATGATCAAAGGTataaaatatcacaattagataaaaatcataaaattataaattgtgACTCAGGTAAAAATGATAAACGACAACGGCAACAACAAGTAATTAAAGATGGAATAGATTTACTTAATTTACTCGATActaataatgataatgataatgtaAATTTAGTACCAAAAAGTAATGAATCACAAATAACTAGCAGCAGAATAGCATCAAAAACCAAACAAGAACAAAATTCAATAGTTATaggaaataataaaaaattaaataataattttaatgttcctaatttaaataatttaacaaCAATAAATGGCGAAGAAAATATTGAAACACAGAAAAATCATAAcattaatacaaaatatgttaAAGTAATAgaacatgaaaataatattcaagAAACATTATGTAATCTTAAATCAATAGAAAATCAACAACAATCATCAAATAATATTATGTCAATTgctaataataataataataataataataacagtaataaacaaaatataaataaatcaccaacatcatcatcaattgagaatgatgaaaatttaacaGATATTATTAAAAAGACTATTTTTGAAACAGTCAAAgcataa
Protein Sequence
MFKPIKSFISYFQKNTNVGTGIFGPSSIQQTNNDIKMDENKQKFKTDIITIENFIDVEDEIIAEKIEKKSLSISRHQNHNKNEILNNSKKKSNNLINNDNDINVDDLIEDCISPKKSSTTTTTTLNPIKIDTDRDLILYSSPINSPTTTAKSCDSFASIISPTKIYVNGDNNFNGINDDDDNDNVDDETAVDEEIIVVSMNGDDNDDDDNENNLCNMTTISDPLALDEYNLDEMNSNLTQSDTTSSSIIDTTDVLNDGIICIIDVDNIKDIKKENTTAATTMILTANKTKNTKSNHHDTSIKTNVTNFNISNVKIEIGNEEHELRSDGSDSGLGLETSTTSNNSVFTTQSSSPLINKKIVIPTKSNLKRRSNEEPIFNEKKTKRSIHFDGVSVYYFPRMQGFACIPSQGGCTLGMGSRHIHFKTFSLTDYAAEQRRAHKQQMQEINPKSSSSDETDSDEELSEASGSDLDADGSGFLQPVPTRQRRALLKAAGIRKIDPTEKDECRAIRTSREFCGCSCRGYCDPDTCSCSQAGIKCQVDRPSFPCGCTRDGCANVVGRVEFNPGRVRTHFIHTIMRLEIENKQKRRNDEIDSTLSSTPSSLPMLNYMNNCITDNSNLSITSTMMNTCSNNNSSSLSAICNYNVSNNTASHIGTTQQSYHQIHLQHQQQQHNQNFLNNVHYSNMMHNNTTGGISTSFSSENSHTGCIPLMANGPSSNHLNTTLDINLMSTNSNHSMDLSYPLRDITTENSICNNLMIDFPNNSNQLFHHDIYGTSNQSYAVGGSQSYHNQNLSSNNSYHSTTATTTPAVTYSNYNQQNYIPYMPQTCNSDTIEIHDLVSPDEDSNNYISLHPPIANSSRLDAINDLLHNNRNTPPTIPTVQQQTPIIATIAATSAIIDPLPMKPATVSALSESCNLASSAQTSTSVVEGTATKNTSPVQITCHGKQKSSVVDLTDDDLMKIENSSSLRMSTNITNNATNNNDDVQIIEPLTISSKSTTEILNIENSSNIIFKESALNDPSNGKINSQIERNDDIEIIGISLNLDKIDENTNSVEIKDTIDNELSPTDNKLLSLLLSPQPSSSLSKDKDDDEQQNDDNSNNDQRYKISQLDKNHKIINCDSGKNDKRQRQQQVIKDGIDLLNLLDTNNDNDNVNLVPKSNESQITSSRIASKTKQEQNSIVIGNNKKLNNNFNVPNLNNLTTINGEENIETQKNHNINTKYVKVIEHENNIQETLCNLKSIENQQQSSNNIMSIANNNNNNNNNSNKQNINKSPTSSSIENDENLTDIIKKTIFETVKA

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Sequence clustering based on sequence similarity using MMseqs2

100% Identity
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90% Identity
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80% Identity
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