Basic Information

Gene Symbol
CAMTA1
Assembly
GCA_963971155.1
Location
OZ020121.1:23848835-23889023[-]

Transcription Factor Domain

TF Family
CG-1
Domain
CG-1 domain
PFAM
PF03859
TF Group
Unclassified Structure
Description
CG-1 domains are highly conserved domains of about 130 amino-acid residues containing a predicted bipartite NLS and named after a partial cDNA clone isolated from parsley encoding a sequence-specific DNA-binding protein [2]. CG-1 domains are associated with CAMTA proteins (for CAlModulin -binding Transcription Activator) that are transcription factors containing a calmodulin -binding domain and ankyrins (ANK) motifs [1].
Hmmscan Out
# of c-Evalue i-Evalue score bias hmm coord from hmm coord to ali coord from ali coord to env coord from env coord to acc
1 2 1.2e-48 1.9e-44 150.9 2.3 2 116 28 140 27 140 0.98
2 2 2 3.3e+04 -6.6 3.8 56 77 492 513 454 541 0.47

Sequence Information

Coding Sequence
ATGAAAGTCAAGAGAAaTAGTGAACCAATCAAACTTCCTGATAATTTAGAAAGTTTACCACGTGCTGACCATTTTCCCACACAAAGACATCGTTGGAATACAAATGAGGAAATTGCTGCAATCCTTATAAGTTTCGATAAACATTCTGAATGGCAATCGAAGGAAGTTAAAACACGACCAAAAAGTGGTTCGTTGTTATTATATTCTCGAAAAAAAGTACGTTATCGAAGAGACGGTTACTGTTGGAAGAAACGTAAAGATGGTAAAACAACCAGGGAAGATCACATGAAATTAAAAGTTCAAGGAACAGagTGTATCTATGGTTGTTATGTACATTCAGCAATTTTGCCAACTTTCCATCGCAGATGTTACTGGTTATTGCAGAATCCAGATATTGTTCTTGTACATTACTTAAATGTCCCATACCCTGATGATAATAAAATGGCTGTAATTACACCAAGTTTATCCTTATGGGGTGATAAAAAGGAATGGACTAAAGAAGAGCTGGTCAGTCAATTAAAACCAATgtTTTTTAATGAGGATGAACCGGATGCAAgtaatgaaattgaaatttcgaCTGCTGAAACAGTTGAAGTGATTGTTGGTCAATTAATGGAAAAACAACGATTAGCTAGACAAGCAGCACTTGTTAAACAGTTAGAATGTGGATGTCCAGATTCAACATGTGCTGATGGTAAATCATGTTCACACTTAATGCGTCGtttaaatacaacaaaatcACTAAATGATAAACGTcaagaaaataataatcaagTATCAAGTACAACACCAAATGTTTTAATTGGACCTAGAcTATATTCCCGTTGGATTGATCGAAGGAATCGTGAATCAATTACGGATTTATCACAGAAATCAATTGATAattcaatacattttcaaGTAATTCCAAGGGTTCATAATCACACAAATTATTcaaatcatcatcatcaacatcaacatcatcaacaacaacaacaacaacaacaccATCAACATCTTAACCGACAACATAATGCTGGTCTTACGGTAACTGCCCATACATCTCAGCAGACAAGCTCTCAATTATTATCAAACAATTCAACTGGTGttccatcatcatcatcgtctACATCTACTCaatcatcatcgtcatcagCAGTAATAGCTAATCAACCCTTTACCAATGCGTCTAATCATGGAAATCTAATAAATCGCATCACCACCAATAATGTTAGTCAAATGATCATAAATACAGCTGGCCATCATAGCGGTAATacagataataataatagtaataacaACATAACAGGAGGTGTTAGCAATAATTATAACAGTAATGGAAATAGTGGTAGCAATTCAACCAATAACCAATTATCATCTCATTCcaatcaacaacaacagcaacaacaacaacaaattagtttagaaaattcaaatgataacaataatttaaataatttaacaaaCACTGATGACCACCttcatcaacatcatcatcatcatcatcatcatcaacaacagCAACATCAACAGCACCAACATCAGCTTCATTTGAATATGTCTCAACATGCCTCTCAACCACAGCATGCCTCTCATCATCGtcagcagcaacaacaacaacagcaatCACACCATCAACAATCAATAATTGATAGTAATGTTGTCAATCAGAGGGTGTCATCAAATCTAATTAGTAGTACCGGTACAAATGGAGGTAGTGGTGGTACTGGTGATAACAGTAATAATTCGCCTGTTGTTACATCAGCTGCTCCTCCACTTGTACTCAATTTGTCCCAGTTACAAAATTCAGGTGGTAGTCTATTAATACTTAATAGTCAACAACAATCAATTGTATGTCAATCTCCGCAACAACAACAGCAccagcaacagcaacaacgAAGATCTTGTGCTCCAAAAGATGATAACAATTTAACATGTACTACAATTACAGCAAATTTAATTCCCAAACAAGAGGCAATGGAttcaacatcatcatcaatttcTGACGAACAAATGGATTCAATTTATGGTACACCAAGCCATAATTCAACTACACATAATACTCCAATGGAAAGTCCAACAAAAGAGAATAATTTTGTTAAAGAATTGAATGATTCATTgccattttttaatgaaaCACTTGATCTATCACAGGAAGATATTCAAAAAACTTTAAGTGCTAATATGCCAATAACAAATGGCGGTGTTTCAAACACAAATGATGATGGAATCGATTCAGATATAAATCCTATGGATTTTATGGATAATGTAGTTTGTGATGGTACTGGTGTTGTTACAAGTGATCCAAATGGTTGTGGTGGTTCAAATGATGAACCAAATCCAGATAatgtttttgttaatttaGATGCCTTTGATATGTTAGTTGAATTTCCTGATCTTGAATTAGATACAAAAACGACATTTTCACATGATAGTTTAGATACAAATCGAAATCAATCAGCAACATTACATGATAGCAGCAATAGTAATACAATACGTTCTGATGACATAAATCAGAATCATGTATTTAATATAACTGATTATAGCCCAGAATGGGCATATCCTGAGGGTGGAATTAAAGTTCTTGTAACCGGGCCATGGAATTCAAATTCCTCATATACAGTTCTATTTGATTCATTCCCAGTACCAACAACATTTGTACAAAATGGTGTTTTACGTTGCTATTGTCCAGCACATGAAGTCGGTTTAGCTACATTACAAGTTGCATGCGATAGTTATGTCATTTCAAATTCAGTTATATTTGAATATAAGTCACCACCAAATATGGAAACAACAAACGTTGATGGTGCCACAAGTGATagtttatataaattttctttattgaaTCGTTTATCATCGATTAACGAAAGAATGCAAATAAAGTCTGAACCAAAAGATTTGcCTGAAGATGCTGTCCTAATTTCTCAATCAAATTTTGAAGAGCGTATGGTTAATTACTGTCAATTattgactcataaagcatgGCGATCAATGACACCTGGATCATGGCCAACAGGACATCAGGGTATGACATTATTGCATTTAGCATCAGCTCTTGGTTATTCAAAATTGGTATGTGCAATGTTAACATGGAGATCAGAAAATCCAAATGTAATTTTAGAAACTGAAATTGATGCCCTAAGTCAAGATATACAAGGATATACGCCATTGgcGTGGGCTTGTACAAAGGGTCATCTTGATACTGCTGTTGTATTATATAAATGGAACTATAATTCgttaaatattaaaacaagTTTTCAGCAGACACCAATCGATATTGCGAAAATGAATGGttttatttatattgttgATGAATTGGAACGTTTAGAAAAAAATCGTATAAATGGCCAATTACAAAATTCAGAATTATCAACAATGACACCAAATAatacaacaaataaattaaatacaaaattaccaacaacagcaacaacaacaacagcaacaacatcaacaacaaAAGATGCTAATAATAGTAATGAAATTTCTTCAAATAATTCAACTATTACTAATACAATTAGCACTAATATCACTACTTCTAGTAGTACTATAACTACTACGGCgactactactactactactactactactattactaataataatagtagtaatagtattaataataatattaataaaattaataataaaaataaaaataaaagtaataattataataatgaaaatataattcttGCTTCTGAGAAAATTCAATcttctaattttaatttatctagtaatagtaataataatattaattataatgaaaataatgaaaataaaaatgttaataacaataataataataataaaaacattgaTAATAATGGTGGTATACAAGgtaaatcaaaaataaaaatgaataataaaaacacAGATGATCATAATAAAAGTTTAAACATTAATGAAAATGTTAATGATAATGCCGCGATAAATTCttattcatcatcatcatcattatcattatcttCATCGACAAATTCctacaaaaataataatgcaaatactactactactaataataataacaatagCGATAAgaatgataataatgatggtaatattattaataatattaataataatgaaaataataataacaagaATATAAATGTTGATTTAAATCCATCTTCATCTTCATCTTCAACATTATATTCTACTTCTTCATCTACTAATACTTCTTATATTATTGAAAACACAAATgatagtaataataatacaaaaaatacaaaaaattcacaaGATAATATACaagtgaaaaattttaaacaacaaaaattttctaatagCTCATCATTATTAagaattaataataattcaacttataaatgtaataatgataataatacaagtaatttagATGATATTGTTTGTAAAACAACACATAATggtaaattaaataataacaacaataattccagtaatataaaaaataataatggtaGTAGCATCAGCACTAACACCAATTGTGGTAATAGtcataatgaaaattataatttaattaaaaatgacaaTTCATTATCACAATGCTCATCACCAATATCATCAAATGGATCATTAGGATCAATTAGTAGCAGTGATCGTAGTCATGATGGTGTATTTCTTAGACCTGGTGCTACATCAAATGGACAAAGTCCTTCTAGTATACGATTATCTGAACGATATTCAATTGATAGCGGTATTAATATGGATATACGCTCATATTCAAGATctggaaaatattttaaagatcataataaatttcaaagTCTTGACGCATGTGATAATCTATCATTTTCAATGGATTCATCGATAAATAATGATTGCGGTGGTGGTAGCAATAGTATATCAAAtaatacaacaacaacaggTTCACTTCTATCACCATTAAGAAAAATGGATTTCGCATTATGCGAAGTATCGGCAGGTGATTCAAGTCCAATACAGGATATACATCCACCAGGTTCACCTTTAGACTGTGAAGACATTACGGATCCAAATAATATGAACGATAATATTGTAGGGGAATCTGATGCTAAAGTTCTAACACTAGCTGAACACATAATTGCAGCTATACCAGAAAGAATTAAGaatgaATCTGAAGAAATGATGTCATTAGGTAGTCCAGTATCAGAATCATTAAATACAGATACATCTGGTATTAGCGGATTAAATGATACCTTTATGGAACCAATATTGGATTCATTACCAAATACAAATTTCTATCATGaattcaattttgaatttagTGATCATACTTATCGTTATCATGATGTTGGTACACCATGTTCTAGTTTAAGTCCAGCAAGTTCTGGTCCATTACAATCACCAGCTAGTTATTCTATACCACAGGATCCACAAATGAGTTCACCAAGTCCACCACCATCAGCACAAgaattaacaaaatttttacatgCCTCGAATACTCAACAACCATTTGAAGCTGacttttcaaatttaacaTTAACAGatCATGAACAACGTGAATTATATGAAGCTGCTAAATGTATTCAAAAAGCATATCGATCATATAAAGGTCGTAAAAAGCTTGAAGAACAAGATAAAGAACGTTCAGCCGCAATTGtcatacaaaattattatcgtcgttataAACAATATGCATTCCATCAACAACGTACACAAGCCGCATTAATCATACAAAATGGTTATCGTTCATATTGTGAAAATAAACGTTTTAAAAAATCACAATGTCAAAGTATGCCATCATCTGATAAACAAGAATTTCAGTGTTTGCAAAATTACGGAAAAAATAATCGTTATACACAAAGTaatcaacaacaacatcagCAAATTCAAATCCAAGGCAATACCATTGGTAAAAGATCATCAAATGTTATGAGTTCGATTACAGAATTATCGGGTGGAGCAACATCATCAAAAGAACGAAGCCCATCCGGACCATTAAAaCGTACATATTCTCAAAGAACTCAAAATCAGGCCGCTAGAAAAATTCAACAATTTATGCGTCAATCCAAAATGAAAATACAGAAAGAACGAGCAGAAAAAGAGAAGCTGGTGCACCTACACAAGGAGGGATACCATCAAAACTCGCTGTCTCACGAACAACAAGAAATTGTACCTATTCCAGATCAAAAGTATgaattcaatttataa
Protein Sequence
MKVKRNSEPIKLPDNLESLPRADHFPTQRHRWNTNEEIAAILISFDKHSEWQSKEVKTRPKSGSLLLYSRKKVRYRRDGYCWKKRKDGKTTREDHMKLKVQGTECIYGCYVHSAILPTFHRRCYWLLQNPDIVLVHYLNVPYPDDNKMAVITPSLSLWGDKKEWTKEELVSQLKPMFFNEDEPDASNEIEISTAETVEVIVGQLMEKQRLARQAALVKQLECGCPDSTCADGKSCSHLMRRLNTTKSLNDKRQENNNQVSSTTPNVLIGPRLYSRWIDRRNRESITDLSQKSIDNSIHFQVIPRVHNHTNYSNHHHQHQHHQQQQQQQHHQHLNRQHNAGLTVTAHTSQQTSSQLLSNNSTGVPSSSSSTSTQSSSSSAVIANQPFTNASNHGNLINRITTNNVSQMIINTAGHHSGNTDNNNSNNNITGGVSNNYNSNGNSGSNSTNNQLSSHSNQQQQQQQQQISLENSNDNNNLNNLTNTDDHLHQHHHHHHHHQQQQHQQHQHQLHLNMSQHASQPQHASHHRQQQQQQQQSHHQQSIIDSNVVNQRVSSNLISSTGTNGGSGGTGDNSNNSPVVTSAAPPLVLNLSQLQNSGGSLLILNSQQQSIVCQSPQQQQHQQQQQRRSCAPKDDNNLTCTTITANLIPKQEAMDSTSSSISDEQMDSIYGTPSHNSTTHNTPMESPTKENNFVKELNDSLPFFNETLDLSQEDIQKTLSANMPITNGGVSNTNDDGIDSDINPMDFMDNVVCDGTGVVTSDPNGCGGSNDEPNPDNVFVNLDAFDMLVEFPDLELDTKTTFSHDSLDTNRNQSATLHDSSNSNTIRSDDINQNHVFNITDYSPEWAYPEGGIKVLVTGPWNSNSSYTVLFDSFPVPTTFVQNGVLRCYCPAHEVGLATLQVACDSYVISNSVIFEYKSPPNMETTNVDGATSDSLYKFSLLNRLSSINERMQIKSEPKDLPEDAVLISQSNFEERMVNYCQLLTHKAWRSMTPGSWPTGHQGMTLLHLASALGYSKLVCAMLTWRSENPNVILETEIDALSQDIQGYTPLAWACTKGHLDTAVVLYKWNYNSLNIKTSFQQTPIDIAKMNGFIYIVDELERLEKNRINGQLQNSELSTMTPNNTTNKLNTKLPTTATTTTATTSTTKDANNSNEISSNNSTITNTISTNITTSSSTITTTATTTTTTTTTITNNNSSNSINNNINKINNKNKNKSNNYNNENIILASEKIQSSNFNLSSNSNNNINYNENNENKNVNNNNNNNKNIDNNGGIQGKSKIKMNNKNTDDHNKSLNINENVNDNAAINSYSSSSSLSLSSSTNSYKNNNANTTTTNNNNNSDKNDNNDGNIINNINNNENNNNKNINVDLNPSSSSSSTLYSTSSSTNTSYIIENTNDSNNNTKNTKNSQDNIQVKNFKQQKFSNSSSLLRINNNSTYKCNNDNNTSNLDDIVCKTTHNGKLNNNNNNSSNIKNNNGSSISTNTNCGNSHNENYNLIKNDNSLSQCSSPISSNGSLGSISSSDRSHDGVFLRPGATSNGQSPSSIRLSERYSIDSGINMDIRSYSRSGKYFKDHNKFQSLDACDNLSFSMDSSINNDCGGGSNSISNNTTTTGSLLSPLRKMDFALCEVSAGDSSPIQDIHPPGSPLDCEDITDPNNMNDNIVGESDAKVLTLAEHIIAAIPERIKNESEEMMSLGSPVSESLNTDTSGISGLNDTFMEPILDSLPNTNFYHEFNFEFSDHTYRYHDVGTPCSSLSPASSGPLQSPASYSIPQDPQMSSPSPPPSAQELTKFLHASNTQQPFEADFSNLTLTDHEQRELYEAAKCIQKAYRSYKGRKKLEEQDKERSAAIVIQNYYRRYKQYAFHQQRTQAALIIQNGYRSYCENKRFKKSQCQSMPSSDKQEFQCLQNYGKNNRYTQSNQQQHQQIQIQGNTIGKRSSNVMSSITELSGGATSSKERSPSGPLKRTYSQRTQNQAARKIQQFMRQSKMKIQKERAEKEKLVHLHKEGYHQNSLSHEQQEIVPIPDQKYEFNL

Similar Transcription Factors

Sequence clustering based on sequence similarity using MMseqs2

100% Identity
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90% Identity
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80% Identity
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