Basic Information

Gene Symbol
BAS1
Assembly
GCA_963971155.1
Location
OZ020118.1:30678678-30680571[-]

Transcription Factor Domain

TF Family
MYB
Domain
Myb_DNA-binding domain
PFAM
PF00249
TF Group
Helix-turn-helix
Description
This family contains the DNA binding domains from Myb proteins, as well as the SANT domain family [1].
Hmmscan Out
# of c-Evalue i-Evalue score bias hmm coord from hmm coord to ali coord from ali coord to env coord from env coord to acc
1 5 0.014 24 6.0 0.3 22 46 114 140 99 140 0.86
2 5 5.8e-09 9.6e-06 26.5 0.6 1 44 146 190 146 192 0.96
3 5 3.2e-10 5.2e-07 30.5 0.1 2 44 200 246 199 248 0.94
4 5 5.4e-14 8.9e-11 42.6 0.0 1 46 254 300 254 300 0.94
5 5 8.9e-12 1.5e-08 35.5 0.2 3 43 308 349 306 352 0.95

Sequence Information

Coding Sequence
ATGTTACGTTCATATAATTTATGTGGTGCACCATATTTTAAAGATAAATCATTATTTCCGGCAccaaataattttgattataatcAACGTAAATTATCTggtgaattatttttatttgatttaaattatgtacaacATAGTTGGACATTACGTGATAAAGTAAATGTTATAAAAGGTATACGTAATCAATTAAtcacatatttaaaaatgaaaatatcacAACAAcgttataataataaaatttcaaaaaataataattttataaaagattatgatatacaaacaaataattttaataaattatataattatgttaTTAATGATGATAACTTTAAAATTGATTGGTATCGTATATCaactgaaaatttaaatagtcGTCATACAGAGAATTCATGTATTACAATGTGgaatatgtatttaaaaccaaatttaaatCGTGATAAATGgacaaataaagaaaatgataaattattaaaaatagctaaaaaatataattatgaaaattggTATATGATATCATTAGAAATGAATAATCGTTCAGAATTACAATGTTTTGTACATTTTCGTACTGAAATTGcatcaaaattaaataatggtAATAAATGGACAAAATATGAAGatgaattattaataaaagctgttgaaaaatatcgtgttgGTGAATTAATTAGATGGAATATGGTTGTAACACATTTTCCACATCGAACTAAAAAGCAACTATATGCAAGATACGCTAATTCAATAAATCCAAGTATAAATCGTGATAgatttacaaaaaaagaagattGCATATTAATGGCTGCTATTCAACAATAtggtaaaaatttttcaaatataccAATCACATTATTTCCAGGTAGAACGAGAAATCAAATACGTAATCGttataataatgtattaaaatatgttCAATTGCAAAAATGTTGGACAATTGAGGATGATAAAAAACTAATGAATTTAGTTGATACATATGGTACATCAAATTggtataaaatttcaaaagaattaaaatatcattcaAGAATTAGTTGTCGTACACGTTATACAGTTATTAAACgttatttacataaatttcCAAATACTAAAATTGATGATATACCACGTAAAAGTAAAAGGCCATTAACTGATATACACTTAGATAATTGGATTGATAAAATGATTGAAATACATAAAAATTTTAGTTTACCACCAAATTGGTCTACATTAATTGGTTTACGTGctttatatttaaaatatttatcaaaGAATTCATTAGAAAATGATAATAGCAATGATAGTCATAATGAGGATAAGAGTAATGATGAAGTAAGAAATAATTgtaatgataatgatgatttaaaatgtacaacaTCAATAGAAATTGCAAAGAAACGTTTTCGTGATCGATTTTTCAGTATATTTTATAAACCTGTATTATTAagtaaaattgaattaaaaactGAAGATAGTATTGTCTATTAG
Protein Sequence
MLRSYNLCGAPYFKDKSLFPAPNNFDYNQRKLSGELFLFDLNYVQHSWTLRDKVNVIKGIRNQLITYLKMKISQQRYNNKISKNNNFIKDYDIQTNNFNKLYNYVINDDNFKIDWYRISTENLNSRHTENSCITMWNMYLKPNLNRDKWTNKENDKLLKIAKKYNYENWYMISLEMNNRSELQCFVHFRTEIASKLNNGNKWTKYEDELLIKAVEKYRVGELIRWNMVVTHFPHRTKKQLYARYANSINPSINRDRFTKKEDCILMAAIQQYGKNFSNIPITLFPGRTRNQIRNRYNNVLKYVQLQKCWTIEDDKKLMNLVDTYGTSNWYKISKELKYHSRISCRTRYTVIKRYLHKFPNTKIDDIPRKSKRPLTDIHLDNWIDKMIEIHKNFSLPPNWSTLIGLRALYLKYLSKNSLENDNSNDSHNEDKSNDEVRNNCNDNDDLKCTTSIEIAKKRFRDRFFSIFYKPVLLSKIELKTEDSIVY

Similar Transcription Factors

Sequence clustering based on sequence similarity using MMseqs2

100% Identity
-
90% Identity
-
80% Identity
-