Basic Information

Gene Symbol
-
Assembly
GCA_950005045.1
Location
OX465429.1:12257361-12259506[-]

Transcription Factor Domain

TF Family
MYB
Domain
Myb_DNA-binding domain
PFAM
PF00249
TF Group
Helix-turn-helix
Description
This family contains the DNA binding domains from Myb proteins, as well as the SANT domain family [1].
Hmmscan Out
# of c-Evalue i-Evalue score bias hmm coord from hmm coord to ali coord from ali coord to env coord from env coord to acc
1 11 0.26 5e+02 2.4 0.0 27 45 48 67 45 68 0.87
2 11 0.26 5e+02 2.4 0.0 27 45 98 117 95 118 0.87
3 11 0.26 5e+02 2.4 0.0 27 45 148 167 145 168 0.87
4 11 0.26 5e+02 2.4 0.0 27 45 198 217 195 218 0.87
5 11 0.26 5e+02 2.4 0.0 27 45 248 267 245 268 0.87
6 11 0.26 5e+02 2.4 0.0 27 45 298 317 295 318 0.87
7 11 0.26 5e+02 2.4 0.0 27 45 348 367 345 368 0.87
8 11 0.26 5e+02 2.4 0.0 27 45 398 417 395 418 0.87
9 11 0.26 5e+02 2.4 0.0 27 45 448 467 445 468 0.87
10 11 0.26 5e+02 2.4 0.0 27 45 498 517 495 518 0.87
11 11 0.26 5e+02 2.4 0.0 27 45 548 567 545 568 0.87

Sequence Information

Coding Sequence
ATGAGCTCAAGAGCCGTTGTTCTTCCTCAGGTGCTACACTATGTTACCTATCAGTTCAGCGGGCGTGGGCTTGGGCCGGTCCTGGCGGTCGAACTCGCGGCTGTGGTAGGACAGGCCGTGCTGGTGCAGCAGCAGGTGCAGGCCCGCGATGTACCGCGACAGAGGACGGTGGATGTGTGTGTGCTACACTATGTTACCTATCAGTTCAGCGGGCGTGGGCTTGGGCCGGTCCTGGCGGTCGAACTCGCGGCTGTGGTAGGACAGGCCGTGCTGGTGCAGCAGCAGGTGCAGGCCCGCGATGTACCGCGACAGAGGACGGTGGATGTGTGTGTGCTACACTATGTTACCTATCAGTTCAGCGGGCGTGGGCTTGGGCCGGTCCTGGCGGTCGAACTCGCGGCTGTGGTAGGACAGGCCGTGCTGGTGCAGCAGCAGGTGCAGGCCCGCGATGTACCGCGACAGAGGACGGTGGATGTGTGTGTGCTACACTATGTTACCTATCAGTTCAGCGGGCGTGGGCTTGGGCCGGTCCTGGCGGTCGAACTCGCGGCTGTGGTAGGACAGGCCGTGCTGGTGCAGCAGCAGGTGCAGGCCCGCGATGTACCGCGACAGAGGACGGTGGATGTGTGTGTGCTACACTATGTTACCTATCAGTTCAGCGGGCGTGGGCTTGGGCCGGTCCTGGCGGTCGAACTCGCGGCTGTGGTAGGACAGGCCGTGCTGGTGCAGCAGCAGGTGCAGGCCCGCGATGTACCGCGACAGAGGACGGTGGATGTGTGTGTGCTACACTATGTTACCTATCAGTTCAGCGGGCGTGGGCTTGGGCCGGTCCTGGCGGTCGAACTCGCGGCTGTGGTAGGACAGGCCGTGCTGGTGCAGCAGCAGGTGCAGGCCCGCGATGTACCGCGACAGAGGACGGTGGATGTGTGTGTGCTACACTATGTTACCTATCAGTTCAGCGGGCGTGGGCTTGGGCCGGTCCTGGCGGTCGAACTCGCGGCTGTGGTAGGACAGGCCGTGCTGGTGCAGCAGCAGGTGCAGGCCCGCGATGTACCGCGACAGAGGACGGTGGATGTGTGTGTGCTACACTATGTTACCTATCAGTTCAGCGGGCGTGGGCTTGGGCCGGTCCTGGCGGTCGAACTCGCGGCTGTGGTAGGACAGGCCGTGCTGGTGCAGCAGCAGGTGCAGGCCCGCGATGTACCGCGACAGAGGACGGTGGATGTGTGTGTGCTACACTATGTTACCTATCAGTTCAGCGGGCGTGGGCTTGGGCCGGTCCTGGCGGTCGAACTCGCGGCTGTGGTAGGACAGGCCGTGCTGGTGCAGCAGCAGGTGCAGGCCCGCGATGTACCGCGACAGAGGACGGTGGATGTGTGTGTGCTACACTATGTTACCTATCAGTTCAGCGGGCGTGGGCTTGGGCCGGTCCTGGCGGTCGAACTCGCGGCTGTGGTAGGACAGGCCGTGCTGGTGCAGCAGCAGGTGCAGGCCCGCGATGTACCGCGACAGAGGACGGTGGATGTGTGTGTGCTACACTATGTTACCTATCAGTTCAGCGGGCGTGGGCTTGGGCCGGTCCTGGCGGTCGAACTCGCGGCTGTGGTAGGACAGGCCGTGCTGGTGCAGCAGCAGGTGCAGGCCCGCGATGTACCGCGACAGAGGACGGTGGATGTGTGTGTGCTACACTATGTTACCTATCAGTTCAGCGGGCGTGGGCTTGGGCCGGTCCTGGCGGTCGAACTCGCGGCTGTGGTAGGACAGGCCGTGCTGGTGCAGCAGCAGGTGCAGGCCCGCGATGTACCGCGACAGAGGACGGTGGATGTTTCAGCGGGCGTGGGCTTGGGCCGGTCCTGGCGGTCGAACTCGCGGCTGTGGTAG
Protein Sequence
MSSRAVVLPQVLHYVTYQFSGRGLGPVLAVELAAVVGQAVLVQQQVQARDVPRQRTVDVCVLHYVTYQFSGRGLGPVLAVELAAVVGQAVLVQQQVQARDVPRQRTVDVCVLHYVTYQFSGRGLGPVLAVELAAVVGQAVLVQQQVQARDVPRQRTVDVCVLHYVTYQFSGRGLGPVLAVELAAVVGQAVLVQQQVQARDVPRQRTVDVCVLHYVTYQFSGRGLGPVLAVELAAVVGQAVLVQQQVQARDVPRQRTVDVCVLHYVTYQFSGRGLGPVLAVELAAVVGQAVLVQQQVQARDVPRQRTVDVCVLHYVTYQFSGRGLGPVLAVELAAVVGQAVLVQQQVQARDVPRQRTVDVCVLHYVTYQFSGRGLGPVLAVELAAVVGQAVLVQQQVQARDVPRQRTVDVCVLHYVTYQFSGRGLGPVLAVELAAVVGQAVLVQQQVQARDVPRQRTVDVCVLHYVTYQFSGRGLGPVLAVELAAVVGQAVLVQQQVQARDVPRQRTVDVCVLHYVTYQFSGRGLGPVLAVELAAVVGQAVLVQQQVQARDVPRQRTVDVCVLHYVTYQFSGRGLGPVLAVELAAVVGQAVLVQQQVQARDVPRQRTVDVSAGVGLGRSWRSNSRLW

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Sequence clustering based on sequence similarity using MMseqs2

100% Identity
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90% Identity
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80% Identity
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