Basic Information

Gene Symbol
ABLIM1_1
Assembly
GCA_963693445.1
Location
OY856328.1:103978-145790[-]

Transcription Factor Domain

TF Family
COE
Domain
COE domain
PFAM
AnimalTFDB
TF Group
Helix-turn-helix
Description
This is the helix-loop-helix domain of transcription factor COE. It is responsible for dimerisation [1].
Hmmscan Out
# of c-Evalue i-Evalue score bias hmm coord from hmm coord to ali coord from ali coord to env coord from env coord to acc
1 14 0.72 3e+03 -3.2 0.0 339 379 785 825 782 853 0.66
2 14 0.0025 10 4.9 0.0 329 379 881 931 866 941 0.89
3 14 0.0026 11 4.9 0.0 329 379 987 1037 976 1047 0.89
4 14 0.0026 11 4.9 0.0 329 379 1093 1143 1082 1153 0.89
5 14 0.0026 11 4.9 0.0 329 379 1199 1249 1188 1259 0.89
6 14 0.0026 11 4.9 0.0 329 379 1305 1355 1294 1365 0.89
7 14 0.0026 11 4.9 0.0 329 379 1411 1461 1400 1471 0.89
8 14 0.0026 11 4.9 0.0 329 379 1517 1567 1506 1577 0.89
9 14 0.0026 11 4.9 0.0 329 379 1623 1673 1612 1683 0.89
10 14 0.0026 11 4.9 0.0 329 379 1729 1779 1718 1789 0.89
11 14 0.0026 11 4.9 0.0 329 379 1835 1885 1824 1895 0.89
12 14 0.0026 11 4.9 0.0 329 379 1941 1991 1930 2001 0.89
13 14 0.0026 11 4.9 0.0 329 379 2047 2097 2036 2107 0.89
14 14 0.59 2.5e+03 -2.9 0.0 330 366 2154 2190 2148 2195 0.89

Sequence Information

Coding Sequence
ATGCGGAAGCGTCGCGTATGCCCCTCCCTGCGCATCCTGCCGCGCGACTCGCTCCAGCCGCTCGCTGGAGACGTCTGGAACCGCGCCAACAGCAAGGTGGTGTGCGGCGCGTGCGGCGGCAAGTGCAGCGGCGAGGTGCTGCGCGTGTCGGAGCGCTACTTCCACACGGCCTGCTTCACGTGCCGCACCTGCGCCGCCAGCCTCGCCAAGGGCGGCTTCTTCTGCAAGGACGGACACTACTACTGCCCACAGGACTACCAGCGCGCGTTCGGCACGCGGTGTGCGGCGTGCGGGCAGTACGTGGAGGGCGAGGTGGTCTCCGCGCTCGGCAACACCTACCACCAGCGCTGCTTCACCTGCGCGCGCTGCCAACGCGCGTTCCCGTCGGGCGAGAAGGTGACGTACACGGGCGCGGAGGTGGTGTGCTCCACGTGCGTGGGCGTGACGTCACCGGCGGCGCCGTACGGGCCGCACGGGCAGGCTGCGGCCACGCGGCACACGGCGCGCGCCGCCTCCGCCGCCTCCTccgcgccgcgcccgcgccccgccAGCCCCGCCAGCCCCGAGCGAGAGCGAGAGCGAGAGCCCCGCCAGCAGGCACACATAGACCCTAATGATTGTGCAGGATGCGGGCAAGAGCTATCAGAAGGACAGGCGCTAGTCGCATTAGACAGACAGTGGCACACGTGGTGCTTCTCGTGCGGGGAGTGCGGCGCGGCGCTGCAGGGCGAGTACATGGGGCGCGCCGGCGTGCCCTACTGCGAGCGCGACTACCAGCGGCTCTACGGCGTGCGCTGCGCCTACTGCCAGCGGTACATCGCCGGCAAGGTGCTGCAGGCGGGGGAGAACCACCACTTCCACCCGACGTGCGCGCGCTGCTCCAAGTGCGGGGACCCGTTCGGTGACGGCGAGGAGATGTTCCTGCAGGGAGCCGCCATCTGGCACCCGCGCTGCGGCCCCGCGCCCCACGACCCGCTGCAGCTGGACCGCGCCTGCTCCGAGCTACAGTACGGGTACCGCGCGGCGTCGCCCGGGCTGGTGCTGCGGCAGTACTCGGCGCCCTGCTCGCCGCACCGCATCACCACCTACTCGTACCTGGCGGCCGAGCCTGCGCCCCTCCGCCGCCCCGTGCAGCCCGCCGACCGCCCCCCCGCCTCGCCACACTTCCACCGCCCCGCCTCAGCCTCGACGGGTGGAACCCGAGCCAGCTCGCGCGCCTCCAGTGCGCGGCCCGGCATGCGCGTGCTGGTGGACTCCATGCGAGCCGAGACACCCAGGCCCAAGTCACCACACATGAACAACGAGGAGCCCATCGAGCTGTCGCACTACCCGGCCGCCTTCAAGCCGCCGCCCGGCACCAAGTCCAAGATAGAGCGAGATGACTTCCCCGCGCCGCCCTACCCCTACACGGACCCCGAGCGCAGACGGCGGTGGTCGGACACGTACAAGGGCATGGAGAGCGACGACGACAACGACGGCAAGATGAACGGCAACGTTAACGGCAACGGAGTTGACCCCAAGCTGCGGAGAGAGGAGATGGAGCTCGCCAAGATAGAGACCGGCATAGCGCAGGTGTTCCTAAAAGAAGTGAAAGAGCGAGAAAAACTACAACAATGGAAAAAGCAGAACTTAGATCCTAGAAACGCGAGCAGAACGCCGTCGGCCATGCGCGAGCCGGCGCACAGGCTGCGCTACTCCTCGCCCGTGGGCGCGTCGCCCTCGCGCCAGCTCGACCACGACCACGACCACGACCACGAGCACGACCACGACCACACCCACACACACTCACACGTTCACATACCCTGCTACAACGTGgcgcacgcacacacgcacGCGCGGGGTGCGGGGCCGCGCTCCTGCACATTGCCGGCCGGCGTCGGCGTCGGACATCGATACAACACTCGCCCCCCGCAGTACGACCCCGCGGCTAGACCTAGCGTTAGTGTTAGGTCCCccctgtgtgtgtgtgtgtgcgtgtgtcgGGTCGCGAGGCGAGTGTGTGAGTGTGTGAGTGTTGCAGTGGTGTCGTCGCTGCGCGCGGCGCCGCGGCCGGGCTACGGGCTCGCCAACAGGTCGCACACCTTCTCCTCCAGCACCGCCGGTGACTTCACGTTCAGCGGGCTCGGGGACAAGACGCACAGCACTGACTTCAGCAGCGGCAAGTCCGACCTTTCTGCCGGCTCCATAACGGACGTGGACAGGAGTGCCGTGATGTCGGTACGCGCGCAGACGGCGGCGGACGGCGTGGGGGGCATGGGGGGCACGCTGGGGGGCGCGGGGGTCATGGGGGCCGCGGGGGGGCGCGGCGTGCGGCGCTCGCTCCCCAACATGGCGACCGGGCACCTGCTGCACGAGCCGGCCAAGCTCTACCCCTACCACCTGCTGCTCATCACCAACTACCGCCTGCCGCCCGACGTCGACCGCCTCAACCTGGAGGTATGTCTATATACTGCTGCACGAGCCGGCCAAGCTCTACCCCTACCACCTGCTGCTCATCACCAACTACCGCCTGCCGCCCGACGTCGACCGCCTCAACCTGGAGGTATGTCTATATACTGCTGCACGAGCCGGCCAAGCTCTACCCCTACCACCTGCTGCTCATCACCAACTACCGCCTGCCGCCCGACGTCGACCGCCTCAACCTGGAGGTATGTCTATATACTGCTGCACGAGCCGGCCAAGCTCTACCCCTACCACCTGCTGCTCATCACCAACTACCGCCTGCCGCCCGACGTCGACCGCCTCAACCTGGAGGTATGTCTATATACTGCTGCACGAGCCGGCCAAGCTCTACCCCTACCACCTGCTGCTCATCACCAACTACCGCCTGCCGCCCGACGTCGACCGCCTCAACCTGGAGGTATGTCTATATACTGCTGCACGAGCCGGCCAAGCTCTACCCCTACCACCTGCTGCTCATCACCAACTACCGCCTGCCGCCCGACGTCGACCGCCTCAACCTGGAGGTATGTCTATATACTGCTGCACGAGCCGGCCAAGCTCTACCCCTACCACCTGCTGCTCATCACCAACTACCGCCTGCCGCCCGACGTCGACCGCCTCAACCTGGAGGTATGTCTATATACTGCTGCACGAGCCGGCCAAGCTCTACCCCTACCACCTGCTGCTCATCACCAACTACCGCCTGCCGCCCGACGTCGACCGCCTCAACCTGGAGGTATGTCTATATACTGCTGCACGAGCCGGCCAAGCTCTACCCCTACCACCTGCTGCTCATCACCAACTACCGCCTGCCGCCCGACGTCGACCGCCTCAACCTGGAGGTATGTCTATATACTGCTGCACGAGCCGGCCAAGCTCTACCCCTACCACCTGCTGCTCATCACCAACTACCGCCTGCCGCCCGACGTCGACCGCCTCAACCTGGAGGTATGTCTATATACTGCTGCACGAGCCGGCCAAGCTCTACCCCTACCACCTGCTGCTCATCACCAACTACCGCCTGCCGCCCGACGTCGACCGCCTCAACCTGGAGGTATGTCTATATACTGCTGCACGAGCCGGCCAAGCTCTACCCCTACCACCTGCTGCTCATCACCAACTACCGCCTGCCGCCCGACGTCGACCGCCTCAACCTGGAGGTATGTCTATATACTGCTGCACGAGCCGGCCAAGCTCTACCCCTACCACCTGCTGCTCATCACCAACTACCGCCTGCCGCCCGACGTCGACCGCCTCAACCTGGAGGTATGTCTATATACTGCTGCACGAGCCGGCCAAGCTCTACCCCTACCACCTGCTGCTCATCACCAACTACCGCCTGCCGCCCGACGTCGACCGCCTCAACCTGGAGGTATGTCTATATACTGCTGCACGAGCCGGCCAAGCTCTACCCCTACCACCTGCTGCTCATCACCAACTACCGCCTGCCGCCCGACGTCGACCGCCTCAACCTGGAGGTATGTCTATATACTGCTGCACGAGCCGGCCAAGCTCTACCCCTACCACCTGCTGCTCATCACCAACTACCGCCTGCCGCCCGACGTCGACCGCCTCAACCTGGAGGTATGTCTATATACTGCTGCACGAGCCGGCCAAGCTCTACCCCTACCACCTGCTGCTCATCACCAACTACCGCCTGCCGCCCGACGTCGACCGCCTCAACCTGGAGGTATGTCTATATACTGCTGCACGAGCCGGCCAAGCTCTACCCCTACCACCTGCTGCTCATCACCAACTACCGCCTGCCGCCCGACGTCGACCGCCTCAACCTGGAGGTATGTCTATATACTGCTGCACGAGCCGGCCAAGCTCTACCCCTACCACCTGCTGCTCATCACCAACTACCGCCTGCCGCCCGACGTCGACCGCCTCAACCTGGAGGTATGTCTATATACTGCTGCACGAGCCGGCCAAGCTCTACCCCTACCACCTGCTGCTCATCACCAACTACCGCCTGCCGCCCGACGTCGACCGCCTCAACCTGGAGGTATGTCTATATACTGCTGCACGAGCCGGCCAAGCTCTACCCCTACCACCTGCTGCTCATCACCAACTACCGCCTGCCGCCCGACGTCGACCGCCTCAACCTGGAGGTATGTCTATATACTGCTGCACGAGCCGGCCAAGCTCTACCCCTACCACCTGCTGCTCATCACCAACTACCGCCTGCCGCCCGACGTCGACCGCCTCAACCTGGAGGTATGTCTATATACTGCTGCACGAGCCGGCCAAGCTCTACCCCTACCACCTGCTGCTCATCACCAACTACCGCCTGCCGCCCGACGTCGACCGCCTCAACCTGGAGGTATGTCTATATACTGCTGCACGAGCCGGCCAAGCTCTACCCCTACCACCTGCTGCTCATCACCAACTACCGCCTGCCGCCCGACGTCGACCGCCTCAACCTGGAGGTATGTCTATATACTGCTGCACGAGCCGGCCAAGCTCTACCCCTACCACCTGCTGCTCATCACCAACTACCGCCTGCCGCCCGACGTCGACCGCCTCAACCTGGAGGTATGTCTATATACTGCTGCACGAGCCGGCCAAGCTCTACCCCTACCACCTGCTGCTCATCACCAACTACCGCCTGCCGCCCGACGTCGACCGCCTCAACCTGGAGGTATGTCTATATACTGCTGCACGAGCCGGCCAAGCTCTACCCCTACCACCTGCTGCTCATCACCAACTACCGCCTGCCGCCCGACGTCGACCGCCTCAACCTGGAGGTATGTCTATATACTGCTGCACGAGCCGGCCAAGCTCTACCCCTACCACCTGCTGCTCATCACCAACTACCGCCTGCCGCCCGACGTCGACCGCCTCAACCTGGAGGTATGTCTATATACTGCTGCACGAGCCGGCCAAGCTCTACCCCTACCACCTGCTGCTCATCACCAACTACCGCCTGCCGCCCGACGTCGACCGCCTCAACCTGGAGGTATGTCTATATACTGCTGCACGAGCCGGCCAAGCTCTACCCCTACCACCTGCTGCTCATCACCAACTACCGCCTGCCGCCCGACGTCGACCGCCTCAACCTGGAGGTATGTCTATATACTGCTGCACGAGCCGGCCAAGCTCTACCCCTACCACCTGCTGCTCATCACCAACTACCGCCTGCCGCCCGACGTCGACCGCCTCAACCTGGAGGTATGTCTATATACTGCTGCACGAGCCGGCCAAGCTCTACCCCTACCACCTGCTGCTCATCACCAACTACCGCCTGCCGCCCGACGTCGACCGCCTCAACCTGGAGGTATGTCTATATACTGCTGCACGAGCCGGCCAAGCTCTACCCCTACCACCTGCTGCTCATCACCAACTACCGCCTGCCGCCCGACGTCGACCGCCTCAACCTGGAGGTATGTCTATATACTGCTGCACGAGCCGGCCAAGCTCTACCCCTACCACCTGCTGCTCATCACCAACTACCGCCTGCCGCCCGACGTCGACCGCCTCAACCTGGAGGTATGTCTATATACTGCTGCACGAGCCGGCCAAGCTCTACCCCTACCACCTGCTGCTCATCACCAACTACCGCCTGCCGCCCGACGTCGACCGCCTCAACCTGGAGGTATGTCTATATACTGCTGCACGAGCCGGCCAAGCTCTACCCCTACCACCTGCTGCTCATCACCAACTACCGCCTGCCGCCCGACGTCGACCGCCTCAACCTGGAGGTATGTCTATATACTGCTGCACGAGCCGGCCAAGCTCTACCCCTACCACCTGCTGCTCATCACCAACTACCGCCTGCCGCCCGACGTCGACCGCCTCAACCTGGAGGTATGTCTATATACTGCTGCACGAGCCGGCCAAGCTCTACCCCTACCACCTGCTGCTCATCACCAACTACCGCCTGCCGCCCGACGTCGACCGCCTCAACCTGGAGGTATGTCTATATACTGCTGCACGAGCCGGCCAAGCTCTACCCCTACCACCTGCTGCTCATCACCAACTACCGCCTGCCGCCCGACGTCGACCGCCTCAACCTGGAGGTATGTCTATATACTGCTGCACGAGCCGGCCAAGCTCTACCCCTACCACCTGCTGCTCATCACCAACTACCGCCTGCCGCCCGACGTCGACCGCCTCAACCTGGAGAGGCACCTGTCGGACCAGGAGTTCGAGGCGATCCTGCAGGCGCCGCGCCCAGAGTTCTACCGCCTGCCGCAGTGGCGCCGCAACGAGCTCAAGCGCCGCGCCAGGCTCTTCTAG
Protein Sequence
MRKRRVCPSLRILPRDSLQPLAGDVWNRANSKVVCGACGGKCSGEVLRVSERYFHTACFTCRTCAASLAKGGFFCKDGHYYCPQDYQRAFGTRCAACGQYVEGEVVSALGNTYHQRCFTCARCQRAFPSGEKVTYTGAEVVCSTCVGVTSPAAPYGPHGQAAATRHTARAASAASSAPRPRPASPASPEREREREPRQQAHIDPNDCAGCGQELSEGQALVALDRQWHTWCFSCGECGAALQGEYMGRAGVPYCERDYQRLYGVRCAYCQRYIAGKVLQAGENHHFHPTCARCSKCGDPFGDGEEMFLQGAAIWHPRCGPAPHDPLQLDRACSELQYGYRAASPGLVLRQYSAPCSPHRITTYSYLAAEPAPLRRPVQPADRPPASPHFHRPASASTGGTRASSRASSARPGMRVLVDSMRAETPRPKSPHMNNEEPIELSHYPAAFKPPPGTKSKIERDDFPAPPYPYTDPERRRRWSDTYKGMESDDDNDGKMNGNVNGNGVDPKLRREEMELAKIETGIAQVFLKEVKEREKLQQWKKQNLDPRNASRTPSAMREPAHRLRYSSPVGASPSRQLDHDHDHDHEHDHDHTHTHSHVHIPCYNVAHAHTHARGAGPRSCTLPAGVGVGHRYNTRPPQYDPAARPSVSVRSPLCVCVCVCRVARRVCECVSVAVVSSLRAAPRPGYGLANRSHTFSSSTAGDFTFSGLGDKTHSTDFSSGKSDLSAGSITDVDRSAVMSVRAQTAADGVGGMGGTLGGAGVMGAAGGRGVRRSLPNMATGHLLHEPAKLYPYHLLLITNYRLPPDVDRLNLEVCLYTAARAGQALPLPPAAHHQLPPAARRRPPQPGGMSIYCCTSRPSSTPTTCCSSPTTACRPTSTASTWRYVYILLHEPAKLYPYHLLLITNYRLPPDVDRLNLEVCLYTAARAGQALPLPPAAHHQLPPAARRRPPQPGGMSIYCCTSRPSSTPTTCCSSPTTACRPTSTASTWRYVYILLHEPAKLYPYHLLLITNYRLPPDVDRLNLEVCLYTAARAGQALPLPPAAHHQLPPAARRRPPQPGGMSIYCCTSRPSSTPTTCCSSPTTACRPTSTASTWRYVYILLHEPAKLYPYHLLLITNYRLPPDVDRLNLEVCLYTAARAGQALPLPPAAHHQLPPAARRRPPQPGGMSIYCCTSRPSSTPTTCCSSPTTACRPTSTASTWRYVYILLHEPAKLYPYHLLLITNYRLPPDVDRLNLEVCLYTAARAGQALPLPPAAHHQLPPAARRRPPQPGGMSIYCCTSRPSSTPTTCCSSPTTACRPTSTASTWRYVYILLHEPAKLYPYHLLLITNYRLPPDVDRLNLEVCLYTAARAGQALPLPPAAHHQLPPAARRRPPQPGGMSIYCCTSRPSSTPTTCCSSPTTACRPTSTASTWRYVYILLHEPAKLYPYHLLLITNYRLPPDVDRLNLEVCLYTAARAGQALPLPPAAHHQLPPAARRRPPQPGGMSIYCCTSRPSSTPTTCCSSPTTACRPTSTASTWRYVYILLHEPAKLYPYHLLLITNYRLPPDVDRLNLEVCLYTAARAGQALPLPPAAHHQLPPAARRRPPQPGGMSIYCCTSRPSSTPTTCCSSPTTACRPTSTASTWRYVYILLHEPAKLYPYHLLLITNYRLPPDVDRLNLEVCLYTAARAGQALPLPPAAHHQLPPAARRRPPQPGGMSIYCCTSRPSSTPTTCCSSPTTACRPTSTASTWRYVYILLHEPAKLYPYHLLLITNYRLPPDVDRLNLEVCLYTAARAGQALPLPPAAHHQLPPAARRRPPQPGGMSIYCCTSRPSSTPTTCCSSPTTACRPTSTASTWRYVYILLHEPAKLYPYHLLLITNYRLPPDVDRLNLEVCLYTAARAGQALPLPPAAHHQLPPAARRRPPQPGGMSIYCCTSRPSSTPTTCCSSPTTACRPTSTASTWRYVYILLHEPAKLYPYHLLLITNYRLPPDVDRLNLEVCLYTAARAGQALPLPPAAHHQLPPAARRRPPQPGGMSIYCCTSRPSSTPTTCCSSPTTACRPTSTASTWRYVYILLHEPAKLYPYHLLLITNYRLPPDVDRLNLEVCLYTAARAGQALPLPPAAHHQLPPAARRRPPQPGGMSIYCCTSRPSSTPTTCCSSPTTACRPTSTASTWRYVYILLHEPAKLYPYHLLLITNYRLPPDVDRLNLERHLSDQEFEAILQAPRPEFYRLPQWRRNELKRRARLF

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Sequence clustering based on sequence similarity using MMseqs2

100% Identity
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90% Identity
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80% Identity
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