Aorb004236.1
Basic Information
- Insect
- Acrocera orbiculus
- Gene Symbol
- IntS14
- Assembly
- GCA_947359355.1
- Location
- OX375757.1:58785507-58793178[-]
Transcription Factor Domain
- TF Family
- MYB
- Domain
- Myb_DNA-binding domain
- PFAM
- PF00249
- TF Group
- Helix-turn-helix
- Description
- This family contains the DNA binding domains from Myb proteins, as well as the SANT domain family [1].
- Hmmscan Out
-
# of c-Evalue i-Evalue score bias hmm coord from hmm coord to ali coord from ali coord to env coord from env coord to acc 1 2 0.002 1.6 8.8 0.0 4 36 493 529 492 530 0.86 2 2 1.4e-11 1.2e-08 34.8 0.1 3 41 628 670 627 674 0.92
Sequence Information
- Coding Sequence
- ATGCCGACAGTTATAGCTTTAGATGTGTCATTATCAATGACTAGAAATATTCCTTCTGGAAATAGTGAAGATACTATAACATACCATCAATTAGCTACCGCTGCCATAAATCAATTTTTGGACCATTTAACAGCTAATTCAAGACTTGAATATGTATCATTAGTAACAAATAATTATAAAATGAGCAATTTAAATAAAATTAGTAGTTCAGAAAATTCCGTTAATAATCTTCAAGTTCAAGTAGCTTGGCCATCTGTATCGGAATTTCTAAAAAGATTTCAACCTGGTTATGAAAATAATAAATTATCAAGAAAAAAATCAATTGACAAATATCCAAATAGTGATATTGATATTAAAGATCATTTGAAATATTTACGAAGTTTAGATCCAAAAGATTGGAAAAATCAGGATCATTATGCAGTACTTGGACTAAAAGCATTACGGTTTGATGCAACTGAAGATGATATTCGAAAAGCTTATAGAAAAGCAGTTTTGCGACACCATCCTGACAAAAGGAAAGCAAAAGGTGAAGATGTTCGAACCGAAGATGATTATTTTACATGTATAACTAAAGCTTATGAAACTCTAGGTGTTTCCAAAGCACGCCGGTCATATGATTCAGTTGATCCAGAATTTGATGATTCATTGCCAAGCCTTACAGAAATCGAAAAAGATTTTTATAAAACTTTTGACAAATATTTTACATTAAATTCTCGTTGGAGTGAACGTAAAAATGTTCCAAAAATTGGTAATGAAAATTCAACACGAGAACATTTAGAAAAATTTTATAGTTTTTGGTATGATTTTGAATCATGGCGTGAATATAGTTATTTGGATGAAGAAGATAAAGAAAAGGGCCAGGATCGTGAAGAAAGACGATGGATAGAAAAACAAAATAAAGCAATTCGTATTAAAAGGAAAAAAGAAGAAATGTCTAGAATTCGTTCATTAGTAGATTTGGCTTATAATAATGATCCAAGAATACTTAAATTTAAAAATGAAGACAAACAAAAAAAATTAGCTGCAAGACGTGCTAAAATGGACGCTGCCCAAGCACAAAAGGCTGAAGAAGAACGTATACTAAAAGAAGCACAGTTAGCTAAAGAACGTCATGAATTGGCTGAACAAAAACGTATCGAACAGATACGTATAGAAAAGGAACAACAAAAACGTGCACTTAAAAAGGAACGTAAAATATTACGTGATTTTGTAAAAGAAAATAATTATTTTTCAACAAATGACAAAGAAAAACTTAAAAATATGGAAGGTGTTGAAAAAATTTGTGAAATGTTTAAATTATTAGAATTACAACAATTAAATAAAGAGTTAGTTAATGGTGGAAATAAAACATTTGAAAGAGTTTTAAAAGAAACTGAAGATAAATTGGAAAAAGAAAGAGAAGCAATGTTAATTAATAAGACAACTAACCTAAATAACGATAATGCTAGTATTAAAGCAATTGATAAAAATTTAATTTGGAATAATGATAATATTCAATTATTGATTAAAGCTGTTAATTTATTTCCTGCTGGTACATCACAACGTTGGGAAGTGATTGCAACATTTATGAATCAACACTCAATTAATATGGATGATAAAAAATTTCTAGCAAAAGATGTACTTAATAAAGCTAAAGATTTACAAAGTAGTAATTTTTCAAAAAATATTTTAAAATCACAAGCTAACGAATCAGCATTTACATCATTTGAAAAATCAAAAAAAGATTTGAAAAAATTAGATAAATCTGATATAAGTGTAAAAATTAATGAAAATTCAATAAATTCTAATAAAAAATTAAATGGAAATATATTAAAACAAAATCAGAAAAGTGAAAATTGTAATTCAGATAATGTAACAAAAAGACAAACAGAAATAATTAAACCATGGACAACAGAAGAACAAGCACTATTAGAACAGGCAATCAAAAGTTATCCAATAACAACACCAGATAGATGGGATAGAATTGCAGAATGTATACCAGATCGAACAAAAAAGGATTGTTTAAAACGTGTTAAAGAATTAGTTGATCGTGTTAATGCAAAAAAAGAAGCTCAACAAGCAATGATTTACTCAACTCTGTATGAAGTTATCGTAGACTTTACTCGTGAATACGAAATTATACGACAAGCTTTGAAAAAAATAGAACACTATGATAAAATTTGCTTAGAAAAACTATTAGAGGGTTTAAGTGATATTTTAACCACAAATTGGGGAACACAAAATTACTGCCAAATATTAGTTTTAACAGATTGTGGATTAGGTTTTGGTAAATCATCTATTAAAAAGTTGGTTTCAACAATTGTAACAAAAAAACAAGAAGGAAAAAAATATTGTATACCATTTCTAACACCAAGCAAATTAAGTTTCATTTGCATTGGTACTAATACTGATTCATATTTTACACAAGCTGTTAAAATCTATAGACAATTGCTTGATGTAAGTGGCCAAAAGGGACATATATTTATACCAAAATCAAATGATAATATAAAAAATCAAAATGAAATTATTAAAAATTCTATAAAAGATATGATTGAAAGAATGTGTGAAACAAATTTTAAACAATTTGAGGCAACTTTAAAATGTGGAGGTTATCATAGATTAGAATGTCCAATCCTTATGTGGCCACCACCATTACCATATAATATTAAAGATAATTTTGGTAAAGATATAGTAAAAACAATATCAAAAACATTAGAAGTTTGTGGATTTCTTAGTTTATCTGATATTGGATCTCCAGTATCTGTAAGCCGTCATTTAGTTGTACCAAAACAAGATTTCGATAAAACTAATAAAAAAACAGTAAAAACTAAAAATCCTACACCTGGAACATTTACAAATGATATAGAAAAATTAGAAAATGAAATACGTTCATTTTATTCTAAAACTGATGGTAATAATTCTGATGAAGATGATAACAAATTATTAATACAAAATGATTCACATAGAGAATCTGTTTGTGTTCTTTTGCATGGAGCACTAAAAGTAGAGAATATGGCTGCTTTAGTATTACTGAATGACAACTGGTTTGGATTTATTAATTCTTATGCGGACAGTAAAAAAAAATTTAATTTAATGTTAAATGTATTACCACCAGGAAATGATGTTATACCTTGGATTGGAGATATGCGTCTTTTGGGTCATTTAAATGATAAAACGCCTGGAGAAAATGCTAATTTTCCAATTAAAGCTGAAAAACGAAGCTATTCCCAAAATTGTGTTGTTTGGATTAAACAGGCTGCTTTACAATCGGATATACAAAAAGTCCTACGACATGCAAAAAAACTACCAGAGAAGACACCACATTTTTATAAAGAATTAAATCGGATTAGACGTGCAGCTTTATCAATTGGTTTTGTAGAGCTTTTAGAAGGATTAGCAAATATTTTTGATAGAGAAGTTGCTGTACTACCTCCAACTGCTAGTCCTGATTGTGCTATTCAAATGAAACATGCAGCTATAGAATTAAGAAAAATAGTAGCTAGAGATTTAAAAACAATTATTACAGCCCAGCCTACAAAATATAATCAACTTTGA
- Protein Sequence
- MPTVIALDVSLSMTRNIPSGNSEDTITYHQLATAAINQFLDHLTANSRLEYVSLVTNNYKMSNLNKISSSENSVNNLQVQVAWPSVSEFLKRFQPGYENNKLSRKKSIDKYPNSDIDIKDHLKYLRSLDPKDWKNQDHYAVLGLKALRFDATEDDIRKAYRKAVLRHHPDKRKAKGEDVRTEDDYFTCITKAYETLGVSKARRSYDSVDPEFDDSLPSLTEIEKDFYKTFDKYFTLNSRWSERKNVPKIGNENSTREHLEKFYSFWYDFESWREYSYLDEEDKEKGQDREERRWIEKQNKAIRIKRKKEEMSRIRSLVDLAYNNDPRILKFKNEDKQKKLAARRAKMDAAQAQKAEEERILKEAQLAKERHELAEQKRIEQIRIEKEQQKRALKKERKILRDFVKENNYFSTNDKEKLKNMEGVEKICEMFKLLELQQLNKELVNGGNKTFERVLKETEDKLEKEREAMLINKTTNLNNDNASIKAIDKNLIWNNDNIQLLIKAVNLFPAGTSQRWEVIATFMNQHSINMDDKKFLAKDVLNKAKDLQSSNFSKNILKSQANESAFTSFEKSKKDLKKLDKSDISVKINENSINSNKKLNGNILKQNQKSENCNSDNVTKRQTEIIKPWTTEEQALLEQAIKSYPITTPDRWDRIAECIPDRTKKDCLKRVKELVDRVNAKKEAQQAMIYSTLYEVIVDFTREYEIIRQALKKIEHYDKICLEKLLEGLSDILTTNWGTQNYCQILVLTDCGLGFGKSSIKKLVSTIVTKKQEGKKYCIPFLTPSKLSFICIGTNTDSYFTQAVKIYRQLLDVSGQKGHIFIPKSNDNIKNQNEIIKNSIKDMIERMCETNFKQFEATLKCGGYHRLECPILMWPPPLPYNIKDNFGKDIVKTISKTLEVCGFLSLSDIGSPVSVSRHLVVPKQDFDKTNKKTVKTKNPTPGTFTNDIEKLENEIRSFYSKTDGNNSDEDDNKLLIQNDSHRESVCVLLHGALKVENMAALVLLNDNWFGFINSYADSKKKFNLMLNVLPPGNDVIPWIGDMRLLGHLNDKTPGENANFPIKAEKRSYSQNCVVWIKQAALQSDIQKVLRHAKKLPEKTPHFYKELNRIRRAALSIGFVELLEGLANIFDREVAVLPPTASPDCAIQMKHAAIELRKIVARDLKTIITAQPTKYNQL
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Sequence clustering based on sequence similarity using MMseqs2
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