Basic Information

Gene Symbol
Kdm5_1
Assembly
GCA_013368085.1
Location
JABVZW010001715.1:986024-1008031[-]

Transcription Factor Domain

TF Family
ARID
Domain
ARID domain
PFAM
PF01388
TF Group
Helix-turn-helix
Description
This domain is know as ARID for AT-Rich Interaction Domain [2], and also known as the BRIGHT domain [1].
Hmmscan Out
# of c-Evalue i-Evalue score bias hmm coord from hmm coord to ali coord from ali coord to env coord from env coord to acc
1 1 3.6e-24 1.1e-20 74.0 0.0 2 89 124 207 123 207 0.94

Sequence Information

Coding Sequence
ATGACTTCCAAAGTGGAAGGGTTAAACGGAATTAGGGCTTCTCACGAAAATTATCCTCTTAATGGAGTTTCGAACAACGACAATATCAAAGTTGTAAATCACATTAACGGAGTCAAATACCCAGGTGTCACTGTGCACAgctttgaatttgaaattccaCCTGAAGCACCTGTTTTCCATCCGACAGAAGAAGAATTTAAAGACGCCTTGgcatatattaataaaattcgacCTATTGCTGAAAACACGGggatatgtaaaataaaacctCCAAagAATTGGCAACCACCTTTTGCTGTAGATGTGGACAAACTTCGATTTACACCCAGAATACAAAGACTTAATGAATTGGAGGCCAAaactagaataaaattaaactttttagatCAGATTGCTAAGTTCTGGGAGTTGCAAGGATCGGCTTTGCGAATTCCTATGGTGGAAAAAAGAGCGCTAGACTTGTATACATTGCATCGATTAGTTCAAAGAGAAGgTGGATCAGACTCTGTCTCTAAAGAAAGGAAGTGGTCAAAAATTGCTGTACTTATGGGTTATCCGTCAGGAAAGGGTATTGGgactattttaaaaactcacTACGAAAGACTTCTATTCCCCTATGATATATTTAGACAAGGAAAATCGGTTAACATAAAAGTTGAAGAAGAAGGAACTGAGggattagaaaaaattgaaaaagacaaGGATTATAAACCGCACGGAATAGTTGGGCGAATGAATGTTAAACCACCTCCTGATATACATTTTCGACGCTCGAAAAGATATGATACTGATACTGATACAAAAGACTGCAAAATTGAAGTTACCGGACAATGCTCTACAAAAGTAAAGGAAGAAATTTGTAACAGTTCAGAGACCGAACATAATAAGGAATTAAAACGTTTACAATTTTATGGGGCCGGTCCAAAAATGGCTGGttttaacaatgtaaaaaatgaagataaactTAATGTAAAATCTATTGTTTATGATTTTGATCCTttggCTAAATATGTATGTCATAATTGTGGACGTGGTGATGTTGAAGAATGTATGCTTTTATGTGACGGATGTGATGACAGTTATCACACGTTTTGTCTTATGCCACCACTAACCGAAATTCCAAAAGGTGATTGGCGCTGTCCTAAATGTGTCGCTGTTGAAGTTTCTAAACCAACAGAGGCTTTTGGGTTTGAACAAGCGCAACGCGAATATAGTTTACAACAGTTTGGCGAAATGGCGGATCAATTTAAATCTGAGTATTTTAACTTGCCCGTTCATTTAGTTCCAACGGGTGTTGTGGAAAAAGAATTTTGGAGAATTGTGTCTTCCATTGATGAAGACGTAACGGTGGAATATGGAGCTGATTTGCATACTATGGATCATGGTTCTGGATTTCCTACCTCGACATCTATCAACTTGTATCCAGGTGATGTGGAGTATGCATATTCGGGATGGAACTTGAATAATTTACCAGTTTTGGATGGTTCTGTATTAGGTTACATTCATGCCGATATTTCAGGAATGAAAgtACCGTGGATGTATGTGGGAATGTGTTTTGCTACATTTTGTTGGCATAACGAAGACCATTGGAGTTATTCAATCAACTACCTTCATTGGGGAGAACCTAAAACTTGGTACGGAGTGCCAGGCAGCAAAGCCATTTCATTTGAGGAAACTATGAAATTGGCGGCTCCTGAATTATTCCAATCTCAACCCGACTTATTACATCAATTAGTAACGATAATGAATcctaatattttaatgaatgcTGGAGTTCCCGTCTACAGAACCGACCAGCATGCTGGTGAATTTGTTGTTACTTTTCCTCGCGCTTATCATGCAGGATTTAATCAAGGTTACAATTTTGCCGAAGCGGTAAATTTTGCTCCAGCCGATTGGCTAAAAATGGGCCGCGAATGTATTCTACATTATTCTCACCTCAGACGGTTCTGTGTATTTTCTCACGACGAATTAGTATGTAAGATGGCGTGTGAACCCGATAAGTTAAGTCCTTTAATAGCGGCAACAACTTATCAAGACATGTTACAAATGGTCGATACAGAAAAGAAATTGAGAAAGAGTTTATTAGAATGGggtGTGACAAACGCAGAACGCGAAGCTTTCGAACTACTTCCAGACGACGAACGTCAGTGCGAAGTTTGCAAAACTACATGCTTCCTTTCGGCAATAACCTGTAGCTGTAACGCAGATACCCTTGTTTGTCTTCGTCATTACGCCGAACTATGCAACTGTCCTCCAGGTAATCATACTTTGAGATATCGATACACTTTGGACGAACTACCTcgtatgttacaaaaattgaaaattaaagccGAAGCATTTGACGTGTGGTTAAACAAAGTCAAAGATTCTTTAGATCCAGGTGTTCCATCAACATTAACTTTACCGGAATTAAAAGGACTTCTAACTGAAGCTGAAGAAAAGAAGTTTCCAAAATGCGAGTTACTTACTACATTATCTAATGCTATCGATGATGCTGAGAAATGCGCTAGTGTTATACGTCAACTGGATTCTACAATGGCGCGTACTCGAACCAGAAATTGTACCGATAGAAAATATCATCTAAATTTAGAAgaacttaatttgtttatcgGCGAAATCGAAAGTTTAGCTTGTGTTTTAGACGAATCGAAAATAGTTAGGGAATTATTAAACGAATCtaagaaatttgaagaatttagtAAGGAATTGCTAAAACTTCCTTTAAGCGAGTGTAGTATAGCCGCGTTGGAAACGTGTTTAGAACATGGTGAAACTATATGTATAGAACTGCCTTCCTTAAGTCGTATAcgggaaaaattaaatcaagcgAAGTGGTTAGTTGAAGTTAAATCATTACGTAGTAATAAGTCTAATGTGATTACACTAAGTgacatagaaaatttaattgattcgGGTGAGAACGTTAAGCCGGACGTGTACATAGAAAGGGAGTTGGTGACTTTAAGGTTGTTATTGCATGAAGGGGAAAATTGGGAAGCCCGTGCTAAAGCCTTATTGAACGATCCGGCACCCATAAATGCTATAGcggaaatagaaaaattactatCACAGGCGGAAGGCATCGAAACTTATTTACCTAGCGAAGAGTTTCTTAAGGAAGTTAATATTAGCATTAAACAAtggttaaaaaatttagaagaaattaatgCCGCAGAATATTACCCGTATATAGACGTGTTACAAGATTTATTTCATAAAGGCCAATTGATTCCTCTGAAATTACCGGACGTCATGGACTTAGAACAATACATTATGTCCGCTTATGACTGGAAGGAAAAAACCAGTCGcacgtttttaagaaaaactactgCAATTTCTTTGATGGAGGCTTTATCGCCAAGATCGCCTTCGGTCATGACACCTTCAAAGTATAATAAGCGAAAATATCTGGAGGATGCTCAACAATTTGTGATAACTAACGACATGGAACCGAGCGATATTGTAAATAGGTTTAAGGATGCTGAAGAAGTGGAATTGGACGCGTTCAAAGCATTGCGCACTAGTAATTCAGCGAAACAATGCGTTCCAGGAGAAGATGTCAAATTTTGTCTGTGCCAGAGAGGTGCGTTCGGTCTAATGATGATGTGCGAATTGTGCAGGGACTGGTACCATTCAACTTGTGTTAACTTACCAAAAATAGCGAATATTAAGTTTAGCGGAAATTTCACTGATATAGCCTTGAGAATGGGTTTCAAAGATTGTAAGTTTCTGTGTCCTTTATGTTACCGTACCAAACGACCTCGGTTAGAGACGATCTTAACATTGTTGGTGTCTTTGCAAAAGTTATCCGTCCGTATTCCCGAAGGCGAAGCTCTTCAGTGTCTGACAGAACGAGCAATGACTTGGCAAGACAGAGTGAAGCATTTGCTACAAACTCCAGAGTTTGAAAGCGCGATGACAAAACTGTCTCTTGcctcacaaaaaaattcggAAGCAGCTGCTcgacaaaaaactgaaaaaaatattaacactgAACTGAAAAAAGCTTCTGTTAATCCTGAATTGCAGTTAAATGTGCAGGAAGTAGGGTCTTGTAGTGGTCTTAGTGTGGAAGATCATTCTGAAACTAATAGCATACATTCGTATACATTAAATGATAATATCGAATGTTCCAAAGTGTCTTTTACCCTTAGTGACGATGCAGTAGACGAACATGCATATTCTTTACATTTTCCCAGTTCGTGCAATAGTGACACTATAATCAAGTTTAGTGATGAAGCTCGTCAAGAACTTGAGGATATTTTAATGGAAGGAGATTTGCTAGAAATTTCTTTAGACGAAACTTTACAGCTATGGAAACTTCTTCAAGCTTCAAGAGATCCAGAGAAGGAAGTGATATTGATCGACTTTGACatcTTCACAAAAGGGTGA
Protein Sequence
MTSKVEGLNGIRASHENYPLNGVSNNDNIKVVNHINGVKYPGVTVHSFEFEIPPEAPVFHPTEEEFKDALAYINKIRPIAENTGICKIKPPKNWQPPFAVDVDKLRFTPRIQRLNELEAKTRIKLNFLDQIAKFWELQGSALRIPMVEKRALDLYTLHRLVQREGGSDSVSKERKWSKIAVLMGYPSGKGIGTILKTHYERLLFPYDIFRQGKSVNIKVEEEGTEGLEKIEKDKDYKPHGIVGRMNVKPPPDIHFRRSKRYDTDTDTKDCKIEVTGQCSTKVKEEICNSSETEHNKELKRLQFYGAGPKMAGFNNVKNEDKLNVKSIVYDFDPLAKYVCHNCGRGDVEECMLLCDGCDDSYHTFCLMPPLTEIPKGDWRCPKCVAVEVSKPTEAFGFEQAQREYSLQQFGEMADQFKSEYFNLPVHLVPTGVVEKEFWRIVSSIDEDVTVEYGADLHTMDHGSGFPTSTSINLYPGDVEYAYSGWNLNNLPVLDGSVLGYIHADISGMKVPWMYVGMCFATFCWHNEDHWSYSINYLHWGEPKTWYGVPGSKAISFEETMKLAAPELFQSQPDLLHQLVTIMNPNILMNAGVPVYRTDQHAGEFVVTFPRAYHAGFNQGYNFAEAVNFAPADWLKMGRECILHYSHLRRFCVFSHDELVCKMACEPDKLSPLIAATTYQDMLQMVDTEKKLRKSLLEWGVTNAEREAFELLPDDERQCEVCKTTCFLSAITCSCNADTLVCLRHYAELCNCPPGNHTLRYRYTLDELPRMLQKLKIKAEAFDVWLNKVKDSLDPGVPSTLTLPELKGLLTEAEEKKFPKCELLTTLSNAIDDAEKCASVIRQLDSTMARTRTRNCTDRKYHLNLEELNLFIGEIESLACVLDESKIVRELLNESKKFEEFSKELLKLPLSECSIAALETCLEHGETICIELPSLSRIREKLNQAKWLVEVKSLRSNKSNVITLSDIENLIDSGENVKPDVYIERELVTLRLLLHEGENWEARAKALLNDPAPINAIAEIEKLLSQAEGIETYLPSEEFLKEVNISIKQWLKNLEEINAAEYYPYIDVLQDLFHKGQLIPLKLPDVMDLEQYIMSAYDWKEKTSRTFLRKTTAISLMEALSPRSPSVMTPSKYNKRKYLEDAQQFVITNDMEPSDIVNRFKDAEEVELDAFKALRTSNSAKQCVPGEDVKFCLCQRGAFGLMMMCELCRDWYHSTCVNLPKIANIKFSGNFTDIALRMGFKDCKFLCPLCYRTKRPRLETILTLLVSLQKLSVRIPEGEALQCLTERAMTWQDRVKHLLQTPEFESAMTKLSLASQKNSEAAARQKTEKNINTELKKASVNPELQLNVQEVGSCSGLSVEDHSETNSIHSYTLNDNIECSKVSFTLSDDAVDEHAYSLHFPSSCNSDTIIKFSDEARQELEDILMEGDLLEISLDETLQLWKLLQASRDPEKEVILIDFDIFTKG

Similar Transcription Factors

Sequence clustering based on sequence similarity using MMseqs2

100% Identity
iTF_00152041;
90% Identity
-
80% Identity
-